🧬 biologia

UNIPRO enables protein inference and panel expansion across single-cell and spatial transcriptomics

UNIPRO è un framework unificato basato su grafi che sfrutta le risorse CITE-seq esistenti per modellare congiuntamente la somiglianza trascrizionale e il contesto spaziale, abilitando l'inferenza proteica accurata, la ricostruzione spaziale e l'espansione del pannello attraverso diversi dataset di singola cellula e di trascrittomica spaziale.

Yadong Wang, Jichong Mu, Tianyi Zhao, Yuzhi Sun, Yachen Yao, Guohua Wang2026-08-07
🧬 biologia

Breeding emperor penguins repeatedly use shelf/slope-associated foraging areas across contrasting sea-ice seasons in the northwestern Weddell Sea

Questo studio rivela che i pinguini imperatore che nidificano nell'isola di Snow Hill, nel Weddell Sea nord-occidentale, mostrano una forte fedeltà a specifiche aree di foraggiamento associate alla piattaforma/scarpata attraverso stagioni di ghiaccio marino contrastanti, con l'uso dell'habitat influenzato dalla concentrazione di ghiaccio marino e dalla distanza dalla colonia, convalidando così la rilevanza della proposta Area Marina Protetta del Mare di Weddell per la loro conservazione.

Hugo R. Guímaro, Peter T. Fretwell, Klemens Pütz, José C. Xavier, Victoria Warwick-Evans, George Day, Juliana A. Vianna (…)2026-08-07
🧬 biologia

A genomically validated loss of chromosome Y transcriptional program is a modest prognostic signal independent of tumour stage in male lung adenocarcinoma

Nell'adenocarcinoma polmonare maschile, un programma trascrizionale di perdita del cromosoma Y (LOY) validato genomicamente funge da segnale prognostico modesto e statisticamente significativo che è solo marginalmente indipendente dallo stadio tumorale ed è ampiamente confuso dalla proliferazione generica, limitando la sua utilità clinica immediata come biomarcatore autonomo.

Shilei Qin, Ling Yan, Zanjin Wu, Yang Wang2026-08-07
🧬 biologia

CHAP-GWAS: Leveraging Chromosomal Haplotypes to Improve Genome-Wide Association Studies

Il documento introduce CHAP-GWAS, un nuovo algoritmo guidato dal fenotipo che sfrutta gli aplotipi su scala cromosomica per definire dinamicamente i blocchi associati al tratto, migliorando così significativamente la potenza statistica e identificando loci genetici trascurati dai convenzionali metodi GWAS basati su singoli SNP o su aplotipi statici.

Zhenyu Jia, Shibo Wang, Qiong Jia, Yanru Cui, Han Qu, Ruidong Li, Lei Yu, Xuesong Wang, Chin-Sheng Teng, Si Liu, Chenwu (…)2026-08-07
🧬 biologia

Effects of 3DP coral-inspired shelter geometry on reef fish occupancy and shelter use

Questo studio dimostra che rifugi ispirati al corallo stampati in 3D con geometrie ingrandite aumentano significativamente l'abbondanza e la frequenza di interazione dei pesci di barriera, evidenziando il potenziale della manipolazione di specifiche caratteristiche architettoniche per ottimizzare i design delle barriere artificiali.

Raz Levy, Asa Oren, Liat Biniuri, Natalie Chernihovsky, Ezri Tarazi, Nadav Shashar2026-08-07
🧬 biologia

Identification and functional analysis of the TOPLESS-related co-repressor CcTPR4 in jute: a negative regulator of fiber yield through modulation of cellulose biosynthesis and gibberellin homeostasis

Questo studio identifica e caratterizza funzionalmente CcTPR4 come un regolatore negativo della resa della fibra di juta che sopprime la biosintesi della cellulosa e modula l'omeostasi della gibberellina, stabilendolo come un obiettivo chiave per il breeding molecolare.

Qiuying Hou, Haixiong Ma, Huifan Kang, Siyan Wu, Mengen Niu, Zonera Arshad, Jianmin Qi, Pingping Fang, Jiantang Xu, Aife (…)2026-08-07
🧬 biologia

A brain splicing-QTL colocalization map of candidate effector genes for major depressive disorder

Integrando un GWAS su larga scala per il disturbo depressivo maggiore con una risorsa completa di splicing-QTL del cervello umano, questo studio identifica 56 geni effettori candidati ad alta confidenza le cui associazioni con la malattia sono risolte più chiaramente attraverso lo splicing alternativo che attraverso la sola espressione genica, offrendo uno strato regolatorio complementare per la prioritizzazione funzionale e traslazionale.

Bozhi Li, Weijia Gu, Xiaqiu Wu2026-08-07
🧬 biologia

Shared Genetic Architecture of Premenstrual Disorder and Postpartum Depression: Registry-Based and Genetic Evidence

Questo studio fornisce la prima evidenza di un sostanziale' architettura genetica condivisa tra il disturbo premestruale e la depressione postpartum attraverso analisi basate su registri e genomiche, identificando nuovi loci di rischio in *PCDH9* e *KCTD16* che implicano la segnalazione inibitoria mediata dal GABA e la regolazione ippocampale nella risposta cerebrale anomala alle fluttuazioni ormonali.

Susu Qu, Kejia Hu, Jerry Guintivano, Elgeta Hysaj, Piotr Jaholkowski, Alexey A. Shadrin, Alicia Nevriana, Rebecka Keijse (…)2026-08-07
🧬 biologia

Septal venous drainage facilitates oxygen-transfer kinetics in the human placenta

Questo studio identifica le vene EphB4⁺ all'interno dei setti deciduali come una via di uscita materna critica che accelera la cinetica del trasferimento di ossigeno nella placenta umana, dimostrando che la loro assenza nelle gravidanze ad alto rischio ritarda significativamente il rinnovamento dell'ossigeno e aumenta la suscettibilità alla morte intrauterina.

Lopa Leach, Dimitrios Amanitis, Fenia Deligianni, Reem Abuhaimed, Hatoon Alkeraim2026-08-07
🧬 biologia

DNA phosphorothioation enhances Bacillus subtilis probiotic efficacy against alcoholic gut-liver injury

Questo studio dimostra che la fosforotioazione del DNA potenzia la tolleranza allo stress di *Bacillus subtilis* e l'efficacia probiotica contro le lesioni intestino-fegato indotte dall'alcol, neutralizzando le specie reattive dell'ossigeno e convertendo l'acido taurocenodeossicolico in acido tauroursodeossicolico per attivare la segnalazione TGR5 dell'ospite, preservando così l'integrità della barriera intestinale e sopprimendo l'infiammazione epatica.

Xinyi He, Tingfei Dong, Biao Zhu, Meiling Yu, Ketong Yin, Ruimin He, Wenyue Hu, Haitong Diao, Yuli Wang, Xinyu Zhang, Zh (…)2026-08-07