6547 articoli
Questo studio ottimizza un protocolo di PCR asimmetrica a due fasi per lo screening di aptameri raffinando sistematicamente le condizioni della PCR simmetrica e i parametri asimmetrici chiave, identificando infine i rapporti tra i primer, il numero di cicli e i componenti della reazione come fattori critici per migliorare la resa e la purezza del DNA a singolo filamento.
Questo studio valuta le prestazioni di vari algoritmi di clustering basati su modelli e su grafi sotto diverse condizioni spaziali e di pre-elaborazione per fornire una guida pratica per inferire accuratamente la struttura della popolazione e le frequenze alleliche in set di dati genomici.
Questo articolo introduce BEAM-1, un framework matematico multiscala informato dalla biofisica che integra le leggi di Fick e di Einstein-Stokes per prevedere e classificare la permeabilità della barriera emato-encefalica di 25 farmaci per il sistema nervoso centrale, identificando con successo Levodopa e Temozolomide come i più permeabili e offrendo un'alternativa economica ai tradizionali test in vitro.
Questo studio impiega un approccio bioinformatico integrato per caratterizzare la proteina ipotetica RvY_05612 di *Ramazzottius varieornatus*, identificandola come una proteina basica di 98 amminoacidi della famiglia Sec61β transmembrana localizzata nel reticolo endoplasmatico che probabilmente facilita il trasporto proteico intracellulare.
Questo studio rivela che l'accorciamento della crescita nel luppolo indotto dal viroide Citrus bark cracking è guidato da una persistente e coordinata soppressione della fotosintesi e dell'acquisizione di azoto che inizia in primavera e conduce a una perdita irreversibile di biomassa, piuttosto che da una risposta dominante della segnalazione immunitaria.
Questo studio introduce un "medico virtuale" completamente automatizzato che diagnostica l'ADHD da registrazioni EEG standard a 128 canali senza l'intervento di esperti, utilizzando una pipeline di deep learning per identificare pattern neurofisiologici diagnosticamente significativi — specificamente nella finestra tra 150 e 300 ms — che i metodi statistici tradizionali trascurano, eliminando così il collo di bottiglia dell'esperto umano nell'interpretazione dell'EEG.
Questo studio stabilisce un flusso di lavoro riproducibile di microscopia SHG assistita da apprendimento automatico che rivela microarchitetture del collagene distinte tra fibrosi e osso trabecolare nei biopsi del midollo osseo, dimostrando che specifiche strategie di annotazione sono critiche per un'accurata analisi morfometrica quantitativa del rimodellamento tissutale.
Questo studio dimostra che la proteasi principale (Mpro) di SARS-CoV-2 è rimasta evolutivamente vincolata da requisiti strutturali e funzionali sin dall'era Omicron, preservando il suo riconoscimento del substrato e sostenendo la sua validità come robusto bersaglio antivirale a lungo termine.
Questo articolo investiga sistematicamente l'ipotesi del manifold nei modelli linguistici proteici (pLM) attraverso una batteria completa di diagnostica geometrica e topologica, concludendo che, diversamente dai modelli fondativi per le singole cellule, le rappresentazioni dei pLM sono prevalentemente ad alta dimensionalità e lineari piuttosto che organizzate attorno a manifold a bassa dimensionalità.
Questo studio empirico rivela che, sebbene i modelli linguistici di grandi dimensioni biologici (SCFMs) codifichino una reale struttura geometrica a bassa dimensionalità e parzialmente linearizzata per la conoscenza biologica, tale struttura è modesta, spesso intrecciata in modo non lineare e ampiamente sovrapponibile a ciò che i metodi classici basati sull'espressione come la PCA possono già recuperare, venendo meno alla geometria nitida e regolare osservata nei modelli di linguaggio naturale.