🧬 biologia

Mutation mapping and evolutionary dynamics of Bundibugyo Ebolavirus (BDBV-2026) genomes reported from Uganda

Questo studio analizza 19 genomi dell'Ebola di Bundibugyo (BDBV-2026) ugandesi per caratterizzare nuove mutazioni, la dinamica evolutiva e gli effetti di stabilizzazione proteica, suggerendo un recente origine da spillover zoonotico e fornendo approfondimenti critici per la progettazione di vaccini e terapie.

David Kelvin, Anuj Kumar, Andrew Nsawotebba, Barnabas Bakamutumaho, Bruce Kirenga, Mansi Dutt, Gustavo Sganzerla Martine (…)2026-07-13
🧬 biologia

Inverted repeat sequences involved in high-frequency T-DNA truncation in “Princettia” (Euphorbia pulcherrima × Euphorbia cornastra)

Questo studio investiga l'alta frequenza di troncamento del T-DNA nei trasformanti di poinsettia "Princettia" e propone un nuovo modello in cui le lunghe sequenze di ripetizione invertita che fiancheggiano i punti di rottura innescano il troncamento e l'aggiunta di sequenze di DNA extra.

Koya Ito, Reiko Kogishi, Sayaka Shindo, Rina Shimo, Yukiko Shimbo, Maki Ohtsubo, Keisuke Matsui, Kenichi Suzuki, Koichi (…)2026-07-13
🧬 biologia

A Construction of Archaean Rest-Like Biology from Genomics

Questo studio presenta un'indagine genomica comparativa sistematica di 1.024 genomi archeali che quantifica il potenziale di codifica per gli effettori di sopravvivenza allo stress e i regolatori di legame al DNA con specificità di sequenza, rivelando un kit di strumenti per lo stress quasi universale e un'architettura regolatoria dipendente dal lignaggio che scala in modo super-lineare e funge da analogo strutturale alla logica REST/NRSF eucariotica, sottolineando esplicitamente che questi risultati rappresentano un potenziale genetico piuttosto che un comportamento fisiologico confermato.

Ajay Vellanki2026-07-13
🧬 biologia

RNA folding below the nanopore impairs direct RNA sequencing fidelity and modification calling

Questo studio identifica che le strutture secondarie dell'RNA che si ripiegano al di sotto del nanoporo durante il sequenziamento diretto dell'RNA causano distorsioni sistematiche della corrente ionica e chiamate di modifiche falsi positivi, stabilendo così la necessità critica di modelli sensibili alla struttura per migliorare la fedeltà del sequenziamento.

Jana Wiedermannová, Marek Schwarz, Josef Pánek, Saran Natarajan, Veronika Kočárková2026-07-13
🧬 biologia

Ingestion of Poly-Ethylene Terephthalate Nanofragments Derived from Plastic Bottles Triggers Long-term Gut Inflammation and Microbiome Dysbiosis in Mice

Questo studio dimostra che l'ingestione di nanoplastiche di polietilene tereftalato (PET), comunemente presenti nelle bottiglie d'acqua, induce una grave infiammazione intestinale a lungo termine, disbiosi del microbioma e genotossicità nei topi, ponendo rischi maggiori per la salute gastrointestinale rispetto alle nanoplastiche di polistirene.

Aswin Kuttykattil, Hannes R. Van Goethem, Raquel Egea, Arnau Rocabert, Adriana Rodríguez-Garraus, Sonja Holme, Aliro Vil (…)2026-07-13
🧬 biologia

Developmental Landscape of Gradients in Human Hippocampus

Analizzando tre ampi studi di coorte sullo sviluppo, questo studio rivela che l'ippocampo umano è organizzato in tre gradienti riproducibili con traiettorie maturative distinte che rilassano progressivamente i vincoli geometrici per orchestrare la gerarchia corticale e sostenere lo sviluppo della memoria episodica e delle funzioni esecutive.

Debin Zeng, Qiongling Li, Deyu Li, Yirong He, Xiaoxi Dong, Zekun Yang, Yiyu Zhang, Shaoxian Li, Shenghan Bi, Ting Xu, Xu (…)2026-07-13
🧬 biologia

What Drives GNN Performance in Tissue Dynamics? Insights from Vertex-Model Simulations

Questo studio confronta cinque architetture di Graph Neural Network su 1.615 grafi tissutali simulati sottoposti a transizioni T1, rivelando che il Provably Powerful Graph Network (PPGN) raggiunge un'elevata accuratezza con dati minimi impiegando una strategia di predizione ibrida e sottolineando il disordine tissutale come fattore chiave che influenza l'affidabilità del modello.

Matej Krajnc, Troy Comi, Siqi Miao, Adnan Hafeez, Hadar Serviansky, Pan Li, Tomer Stern2026-07-13
🧬 biologia

Functional Depth Biomarkers Distinguish Lung Squamous Cell Carcinoma from Lung Adenocarcinoma

Questo studio introduce un framework di analisi della profondità funzionale che integra la trascrittomica spaziale e la statistica di rete per distinguere il carcinoma polmonare a cellule squamose dall'adenocarcinoma, identificando architetture di coordinazione dei percorsi specifiche per sottotipo, il riassetto guidato dalle mutazioni e i modelli di programmazione del microambiente che rivelano nuovi biomarcatori meccanicistici per l'oncologia di precisione.

Sagnik Bhadury, Ashley P. Tsang, Dipankar Ray, Kiran Lagisetty, Arvind Rao2026-07-13
🧬 biologia

Functional inertia reveals history-dependent organization of large-scale brain dynamics

Questo articolo introduce l'«inerzia funzionale» come un vincolo multilivello e dipendente dalla storia che agisce sulla dinamica cerebrale, strutturando l'attività in regimi coerenti e spiegando come lo stesso meccanismo sottostante possa predire una migliore prestazione cognitiva negli individui sani, pur guidando una maggiore gravità dei sintomi nella schizofrenia, rifocalizzando così stabilità e volatilità come espressioni contestuali di un unico principio organizzativo.

Sir-Lord Wiafe, Vince Calhoun2026-07-13
🧬 biologia

Genome-wide association analysis of growth traits in Tianzhu white yak

Questo studio ha utilizzato il sequenziamento a bassa copertura e l'analisi di associazione genome-wide su 536 individui di yak bianchi di Tianzhu per identificare 366 loci SNP significativi e 32 geni candidati associati ai principali tratti di crescita, fornendo preziosi marcatori genetici per far progredire i programmi di breeding di precisione.

Guowu Yang, Xuedong Qi, Yongfu La, Xiaoming Ma, Yicheng Liu, Zhicheng Wang, Wenxue Luo, Wenwen Ren, Zhenyu Zhang, Min Ch (…)2026-07-13