🧬 biology

Interpretable tissue-resolved drug toxicity prediction with pathway-level mechanism attribution

Il documento introduce ToxiPred, una rete neurale a due torri interpretabile che predice la tossicità dei farmaci specifica per il tessuto integrando dati multi-omici attraverso un collo di bottiglia a livello di pathway, consentendo sia un punteggio accurato della responsabilità sia l'attribuzione meccanicistica degli effetti avversi.

Aleksandr Ianevski, Erlend Ravlo, Jørn Schjølberg, Rakel Sæther, María Quílez, Ine Nordli, Hilde Lysvand, Synnøve Fjelds (…)2026-07-17
🧬 biology

Subfield-specific hippocampal contributions to cognitive map-based navigation in early- and late-onset blindness

Questo studio dimostra che negli individui ciechi con esordio precoce o tardivo, i volumi di specifici sottocampi ippocampali (DG/CA3 e subiculum) correlano con la performance di navigazione basata su mappe cognitive non visive, suggerendo che meccanismi neurali distinti per la codifica spaziale siano preservati e riorganizzati funzionalmente nella cecità nonostante l'assenza di differenze volumetriche complessive rispetto ai controlli vedenti.

Maxime Bleau, Mats Donbrowe, Ron Kupers, Laurence Dricot, Nikolai Axmacher, Daniel Robert Chebat, Maurice Ptito2026-07-16
🧬 biology

Alternative Splicing Generates a Nuclear ACSS2 Isoform that Regulates Cardiomyocyte Contractile Gene Programs

Questo studio rivela che lo splicing alternativo genera un'isoforma nucleare specifica dei cardiomiociti di ACSS2 (ACSS2-L che regola i programmi genici della contrattilità cardiaca modulando l'acetilazione di H3K27 nei promotori e negli enhancer attivi, integrando così la segnalazione metabolica con il controllo epigenetico per mantenere la funzione cardiaca e prevenire il rimodellamento maladattivo.

Carolina Greco, Riccardo Doro, Mauro Passaretti, Rosanna Caputo, Luca Lambroia, Roberta Carriero, Alessandra Idini, Ales (…)2026-07-16
🧬 biology

Climatic and Ecological Gradients Associated with MSP1 Genetic Diversity in Plasmodium falciparum: An Entropy-Based Population Analysis

Questo studio analizza le sequenze di msp1 di *Plasmodium falciparum* in Vietnam per rivelare che, sebbene i gradienti climatici ed ecologici influenzino l'entità della diversità genetica, essi non guidano una significativa suddivisione della popolazione, poiché la maggior parte della variazione rimane all'interno di popolazioni parassitarie coesive attraverso i confini ambientali.

Joseph O. Adebayo, Oche A. George, Dorcas I. Adebayo, Evans C. Egwim, Simeon A. Adebisi, Caroline A. Okoli, Adedoyin Igu (…)2026-07-16
🧬 biology

A constitutive nuclear lubricant safeguards proteome homeostasis through dynamic IDR-mediated solvation

Lo studio identifica Sena1, una proteina intrinsecamente disordinata essenziale nei mammiferi, come un lubrificante nucleare costitutivo che previene l'indurimento patologico dei condensati biomolecolari risolvendo attivamente gli assemblaggi arrestati di proteine soggette ad aggregazione come U2af2, salvaguardando così l'omeostasi del proteoma e garantendo lo splicing corretto di specifici introni.

Shinichi Nakagawa, Ikuko Nomura, Manato Okazaki, Misuzu Kurihara, Tatsuya Ishizuka, Tomoki Chiba, Hiroshi Asahara, Naoki (…)2026-07-16
🧬 biology

Pathway-Informed Stratification of Major Depression: Links to NMN-Rescued Aging Programs in Mitochondrial Metabolism and Trafficking

Questo studio propone una stratificazione della depressione maggiore basata sui percorsi biologici, dimostrando che le vulnerabilità genetiche specifiche per i sintomi convergono sui percorsi del metabolismo e del traffico mitocondriale precedentemente collegati ai programmi di invecchiamento salvati dal NMN, supportando così un modello dimensionale biologicamente distinto del disturbo.

Ngo Cheung2026-07-16✓ Author reviewed
🧬 biology

Prenatal methylmercury exposure disrupts developmental trajectories and induces sex-specific toxicity in pubertal rats

Questo studio dimostra che l'esposizione prenatale a livelli ambientalmente rilevanti di metilmercurio interrompe le traiettorie di sviluppo e induce alterazioni persistenti e specifiche per sesso nella crescita, nella funzione epatica e nella segnalazione infiammatoria nei ratti in età puberale.

Jessica L. Bradshaw, E. Nicole Wilson, Steve Mabry, Jennifer J. Gardner, Alexandra Grief, Brianne K. Soulen, Celeste L. (…)2026-07-16
🧬 biology

Interpretable Driver Fatigue Detection Using SHAP Analysis of Multiple Entropy EEG Features

Questo studio dimostra che l'analisi SHAP di caratteristiche EEG multi-entropiche, in particolare la Fuzzy Entropy dal canale Pz, può identificare efficacemente biomarcatori affidabili e fornire spiegazioni clinicamente interpretabili per i modelli basati su alberi per il rilevamento della fatica del conducente, nonostante il raggiungimento di una precisione di classificazione moderata.

Jianfeng Hu, Jing Gao2026-07-16
🧬 biology

Integrated Bioinformatics and Experimental Validation Identifies Prognostic Hub Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma (ESCC)

Attraverso un'analisi bioinformatica integrata di dataset GEO seguita da validazione sperimentale tramite real-time PCR, questo studio identifica STAT1 e LOX come geni hub significativamente sovraregolati associati a una prognosi infausta nel carcinoma squamoso dell'esofago, evidenziando il loro potenziale come target terapeutici.

Yalda Amiri Hezave, Armin Khaghani Boroujeni, Razieh Amini, Ali Shojaeian2026-07-16