🧬 biologia

Horizontal Gene Transfer Drives Patchy Distribution of CPR-C4 Cysteine Proteases with Deep Structural Conservation

Questo studio dimostra che la famiglia di cisteina proteasi CPR-C4 presenta una distribuzione discontinua attraverso i genomi della Candidate Phyla Radiation guidata dal trasferimento genico orizzontale, pur mantenendo il proprio ripiegamento strutturale e la funzione catalitica attraverso una forte selezione purificante nonostante la profonda divergenza filogenetica.

Minxin Zhang, Qinan Han2026-10-20
🧬 biologia

Within-host HPV–immune dynamics with epithelial turnover and downstream cervical disease burden: invasion, Hopf bifurcation, and intervention modelling

Questo articolo presenta un modello deterministico dell'infezione da HPV e della progressione della malattia cervicale all'interno dell'ospite che incorpora il turnover epiteliale e la dinamica immunitaria per dimostrare la stabilità del sistema, identificare una biforcazione di Hopf che conduce a oscillazioni periodiche e derivare strategie di controllo ottimale per l'intervento terapeutico, sottolineando al contempo che l'attuale modello di riferimento richiede un'ulteriore calibrazione biologica prima dell'applicazione clinica.

Khalid Aldawsari, Fahad Al Basir, Konstantin B. Blyuss2026-10-20
🧬 biologia

Beyond Species Richness: Empirical Assessment of a Consumption-Weighted Functional Diversity Index Across Aquatic Ecosystems

Questo studio valuta empiricamente un Indice di Diversità Funzionale (FDI) pesato sul consumo attraverso gli ecosistemi acquatici, dimostrando la sua utilità come descrittore complementare dell'organizzazione trofica che cattura pattern distinti dalla diversità tassonomica, evidenziando al contempo la sua sensibilità alle scelte di misurazione e rilevando che non supera necessariamente modelli più semplici nella previsione del funzionamento dell'ecosistema.

Aryan Ayyanger2026-10-20
🧬 biologia

A 159-step auditable open-quantum-system chain links cerebral metabolism to a coherence-protected information channel in the myelinated axon at 310 K (V148)

Questo articolo presenta un modello di sistema quantistico aperto a 159 fasi completamente verificabile (V148) che dimostra come il metabolismo cerebrale possa finanziare termodinamicamente un canale di informazione protetto dalla coerenza all'interno della guaina mielinica alla temperatura fisiologica, utilizzando l'accoppiamento fotone-fonone e la coerenza di fase piuttosto che l'entanglement bipartito per ottenere una trasmissione del segnale ad alta fedeltà.

alfonso mendoza orellana2026-10-20
🧬 biologia

Phylogenetic harmonization of cross-cohort vaginal microbiome data for machine-learning prediction of preterm birth

Questo studio dimostra che l'integrazione di una coorte coreana monocentrica con un ampio dataset pubblico tramite armonizzazione filogenetica migliora significativamente i modelli di machine learning per la previsione del parto prematuro, raggiungendo un AUC di 0,81 con CatBoost e migliorando ulteriormente le prestazioni a 0,83 incorporando le caratteristiche inferite della lunghezza cervicale breve.

Sunwha Park, Kyeongeui Yun, Hyebeen Byun, Yeonhwa Park, Young-Ah You, Gain Lee, Young Min Hur, Minjung Ko, Young Ju Kim (…)2026-10-20
🧬 biologia

Chromosome-scale reference genome of Finger corn, an eight-rowed maize landrace retaining primitive traits

Questo studio presenta un genoma di riferimento ad alta qualità e su scala cromosomica per la varietà locale di mais dello Yunnan "Finger corn", integrando i dati PacBio Fiber-seq e Hi-C per fornire risorse genomiche, epigenomiche e della cromatina 3D complete che facilitino la ricerca sulla domesticazione del mais, la regolazione del genoma e la variazione dei tratti agronomici.

Jieying Yao, Yi Jiang, Kaiwen Tan, Kesen Zhu, Qingyun Li, Junpeng Shi, Zechao Yin2026-10-20
🧬 biologia

Pharmacological and genetic induction of fetal haemoglobin converge on a shared transcriptional signature

Questo studio stabilisce che l'induzione farmacologica e genetica dell'emoglobina fetale condividono una firma trascrizionale coerente, consentendo la riuscita applicazione del matching trascrizionale per identificare la decitabina come un candidato principale, evidenziando al contempo la critica necessità di esperimenti di controllo per evitare falsi positivi nello screening computazionale dei farmaci.

Jack Odoyo Otieno, Osim Losiligaki Kambei2026-10-20
🧬 biologia

Lineage plasticity and tumor microenvironment transcriptional features define a novel aggressive state in pediatric rhabdomyosarcoma

Questo studio identifica un nuovo, biologicamente distinto "Stato Aggressivo Associato alla Plasticità" (PAAS) nel rabdomiosarcoma pediatrico, caratterizzato da un'elevata plasticità del lignaggio neuroendocrino e da una bassa infiltrazione di mastociti, che funge da robusto biomarcatore prognostico per una sopravvivenza scarsa, indipendentemente dalla stratificazione del rischio convenzionale.

Elena Jachetti, Davide Pernici, Stefano Percio, Gabriele Tiné, Elena Di Blasi, Bahar Fayaztorshizi, Renata Ferri, Yiyi Z (…)2026-10-20