MycorrhizaFinder: an efficient machine learning tool to quantify endomycorrhizal colonisation of real-world roots
本論文は、従来の顕微鏡観察に代わる大規模な内生菌根の定量化を可能にする、ユーザーフレンドリーかつ学習可能な機械学習ツール「MycorrhizaFinder」のワークフロー、性能評価、および生態系モニタリングへの応用可能性を提示するものである。
413 件の論文
本論文は、従来の顕微鏡観察に代わる大規模な内生菌根の定量化を可能にする、ユーザーフレンドリーかつ学習可能な機械学習ツール「MycorrhizaFinder」のワークフロー、性能評価、および生態系モニタリングへの応用可能性を提示するものである。
本論文は、南米のモンスーン山地草原において、太陽光による光分解が乾燥期に堆積した枯死植物の分解を促進し、特に特定の波長域が生物学的分解を加速させることを初めて実証し、光分解が乾燥地帯に限らず生産的な草原生態系においても炭素循環に重要な役割を果たすことを明らかにしたものである。
この論文は、マラリア媒介蚊の個体群動態における負の密度依存性とアルリー効果の相互作用をシミュレーションモデルで解析し、持続的な介入がアルリー効果を誘発して個体群絶滅を加速させる可能性を示唆している。
この論文は、464 件の研究を統合したグローバルレビューを通じて、外来種と火災の相互作用が生態系に複雑かつ主に負の影響を及ぼすことを示しつつ、地理的・分類群的な研究の偏りや管理手法の限界といった重要な知識の空白を明らかにし、リモートセンシングや実験室研究などの新たなアプローチの必要性を提言しています。
本論文は、海洋細菌*Alteromonas macleodii* ATCC 27126 のアミノ酸利用能力を直接測定し、その成長がアミノ酸の分解経路がクエン酸回路(TCA 回路)のどの部位に流入するか(特にピルビン酸やアセチル CoA への変換)に強く依存し、アスパラギン酸やアスパラギンによる成長阻害などの複雑な相互作用が存在することを明らかにしたものである。
本論文は、アジアゾウによる糞の堆積が栄養の再分配を通じて植物の成長を促進し、競争関係を改変することで、熱帯林の植物群落に微細な空間的異質性を生み出す重要な役割を果たしていることを示しています。
この論文では、リソース探索行動に基づく行動状態マイクロシミュレーションモデルと R パッケージ「ramp.micro」を開発し、従来の拡散モデルでは見落とされがちなリソースの空間分布と行動状態が、蚊の分散パターンや集団構造の形成において決定的な役割を果たすことを示しています。
この論文は、米国における規制対象のミツバチ亜種の迅速かつ正確な同定を可能にするため、ミトコンドリア遺伝子の変異に基づいた複数の分子マーカーと PCR 法を開発・検証したものである。
本論文は、107 種の野生魚類の熱応答データを統合した「FishTherm」データベースを構築し、熱性能曲線が緯度や生息環境、生物学的組織レベルに応じて体系的に変化することを明らかにすることで、気候変動下における魚類の脆弱性理解と熱生態学の一般原則の確立に貢献したものである。
本論文は、メタゲノム解析を用いて絶滅危惧種のオオトゲノコギリザメの皮膚微生物叢を初めて特徴づけ、水環境とは異なる宿主特異的な構成を持ちながら、休眠や嫌気性代謝に関わる遺伝子の豊富さにより高い機能的冗長性と環境ストレスに対する回復力を備えていることを明らかにし、微生物機能データの保全戦略への統合の重要性を提唱しています。
この研究は、長島の森林における外来種と在来種の両方が同様の環境フィルター(特に土壌栄養)の支配下で群集が形成されることを示し、地域的な種プールが栄養貧弱な環境に適応した形質を持たないことが、撹乱や侵入圧が高いにもかかわらず一部の群落が外来種に侵食されない理由であることを明らかにした。
北米に侵入した植物の約 8 割が 30 年以上にわたる気候的安定状態(ステイシス)に達していないことが示され、多くの外来種がまだ潜在的な脅威を拡大し続けている一方で、平衡仮説に基づく評価が適用可能な種を特定する手がかりが得られた。
本研究は、衛星リモートセンシングと現地観測データを組み合わせたランダムフォレストモデルを開発し、米国全域の湖の表面水温を高精度に予測することで、有害な藍藻ブルーム(cyanoHAB)の予報精度向上と水資源管理への貢献を目指したものである。
この研究は、気候変動に伴う平均気温の上昇だけでなく、エルニーニョ現象などの気候変動性がアンデス地域の高標高都市におけるデング熱のリスクを急激に再編成し、免疫を持たない人口を新たな感染域にさらす主要な要因であることを明らかにしています。
この研究は、21 世紀の気候変動と人口動態シナリオに基づき、メカニズムモデルを用いてフランスにおける白紋シマカ(Aedes albopictus)の生息適性域の拡大とデング熱の国内感染リスクが 2085 年までに著しく高まることを予測しています。
この研究は、単一感染ではなく複数の寄生虫が宿主内で互いに促進し合う共感染状態が、トウミジンコ(Tribolium castaneum)の個体群動態において安定性を損ない、振動やカオスを引き起こす主要なメカニズムであることを、実験と数理モデルの両面から実証したものである。
本論文は、機械学習モデルを用いて貯蔵豆害虫であるハスモンヒメトビハムシ(Callosobruchus chinensis)の翅長、発生期間、成虫寿命などの生活史形質を予測し、特にニューラルネットワークが寿命の予測に高い精度を示すなど、生態実験と機械学習の統合が害虫生態や管理の理解向上に寄与することを示した。
植物と火災のフィードバックを考慮したモデルを用いた研究により、 boreal および地中海性生態系において、種組成多様性と機能的多様性がともに中程度の火災頻度で最大化されることが示された。
本論文は、スイッチグラスの葉と根の微生物群集において、直接的な相互作用が葉の群集構造を、間接的な相互作用が根の真菌群集構造を説明する主要な要因であり、これらが環境要因や空間的要因と同等の重要性を持つことを明らかにした。
オーストラリアからアフリカまで広く分布する C4 植物キツネノアワ(Themeda triandra)の 15 系統を共通環境下で栽培した研究により、開花時期が生育地気候と強く相関する適応形質である一方、光合成や葉の成長などの形質は気候起源よりも生育温度の影響を強く受け、この高い表現型の可塑性が本種の広範な分布を支えていることが示されました。