CELeidoscope: quad-fluorescent Caenorhabditis elegans strain for tissue-specific spectral single-cell analyses
本研究は、複数の主要な細胞タイプを単一の線虫株内でスペクトル的に識別可能にする多色蛍光タンパク質発現株「CELeidoscope」を構築し、従来の別株が必要だった手法の限界を克服して、同一遺伝的背景から複数の組織を効率的に単離・解析できる新たな基盤を確立したものである。
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本研究は、複数の主要な細胞タイプを単一の線虫株内でスペクトル的に識別可能にする多色蛍光タンパク質発現株「CELeidoscope」を構築し、従来の別株が必要だった手法の限界を克服して、同一遺伝的背景から複数の組織を効率的に単離・解析できる新たな基盤を確立したものである。
本研究は、フローサイトメトリーを用いた新規アッセイにより、インフルエンザ A ウイルスのヘマグルチニンと宿主受容体との結合が、受容体の密度や種類に依存して膜融合効率を調節し、ヘマグルチニンとノイラミニダーゼのバランスが融合段階においても機能することを明らかにしました。
マラリア原虫の抗マラリア薬候補である PfNCR1 が、宿主赤血球との狭い膜接触部位に局在しコレステロール恒常性を維持するメカニズムは、Plasmodium 属に特異的な物理化学的性質を持つ HLH ドメインに依存していることが解明された。
アラスカのツンドラで行われた reciprocal transplant 実験により、短期間の気候変動下でのコケ共生微生物による窒素固定率の変動は、微生物群集の構成変化よりも宿主コケ種そのものの生理的性質や微小環境に主に依存することが示された。
本論文は、C. jejuni 488 株の T6SS が新規エフェクター CJ488_0980 および CJ488_0982 を介して他細菌に対する拮抗作用を発揮し、さらにヒト腸上皮細胞との相互作用、侵入、細胞内生存にも寄与することを明らかにし、C. jejuni における T6SS の病原性における重要性を初めて示したものである。
完全ゲノムデータに基づく大規模代謝モデルの構築により、腸内細菌の代謝相互作用がゲノム特性やニッチ特化に駆動されることを明らかにし、炎症性腸疾患の診断精度向上や精密医療への応用可能性を示しました。
この研究は、温暖化や資源富化などの地球環境変化が、植物の成長と酵素投資を脱結合させ、根圏微生物機能の変化を通じて在来種と外来種(コンイザとヘリントセカ)間の競争バランスを再構築することを示しています。
本論文は、Bacillus subtilis において、NADH 脱水素酵素(Ndh)の活性を調節し、細胞の生存に不可欠な YfhS と YjlC という新規タンパク質の機能を解明し、これらが抗生物質耐性菌に対する新たな治療標的となり得ることを示したものである。
この論文は、マクロファージから放出される一酸化窒素(NO)やイタコン酸などの抗菌因子に対する*Yersinia pseudotuberculosis*の転写応答を解析し、特にコロニー周辺部の細菌が NO 由来代謝産物からの防御に特化した遺伝子発現を示す一方、イタコン酸分解能の欠損が脾臓内での病原性に与える影響は限定的であることを明らかにしたものである。
本論文は、免疫蛍光顕微鏡観察におけるブドウ球菌のタンパク質Aに起因する非特異的染色を抑制し、宿主細胞因子の検出精度を向上させるために、ヒト血清を用いたブロッキングが最も効果的で汎用的な解決策であることを体系的に評価し実証したものである。
この論文は、アルプスの渓流バイオフィルムから単離された 57 株のバクテリオファージ(ALP コレクション)を解析し、それらが宿主細菌の多様性、ゲノム規模、および生物膜構造への影響において新規かつ多様であることを明らかにし、自然環境におけるファージ進化と生態学の研究基盤を提供したことを報告しています。
本論文は、トランスクリプトミクス、メタボロミクス、およびリピドミクスを統合した解析により、気相環境下でトルエンを分解する Acinetobacter sp. Tol 5 が、アミノ酸や核酸の分解促進、シトルリンの蓄積、および貯蔵脂質の分解を通じて窒素代謝と脂質代謝を再編成し、水分制限環境への適応戦略を確立していることを明らかにしたものである。
南極のラッセンC 氷棚下の堆積物から単離された「Candidatus Mariimomonas ferrooxydans」という新種の化学独立栄養細菌が、光に依存しない条件下で鉄を酸化・沈殿させる能力を持つことをゲノム解析と機能検証により実証し、これが帯状鉄鉱層(BIF)の形成メカニズムや地球および他の惑星における鉄循環の理解に新たな知見をもたらした。
本論文は、抗菌剤が溶出せず接触が粒子界面に限定される固定化第四級アンモニウム粒子を用いることで、廃水後処理において微生物と耐性遺伝子負荷を低減しつつ、耐性選択や水平伝播を促進しない新たなポリッシュング戦略の有効性を示したものである。
本研究では、マウス個体から分単位〜時間単位の連続糞便サンプリングを可能にする自動装置を開発し、高解像度の時系列解析によって腸内細菌叢が炭水化物利用戦略に基づいて昼夜間で同期し、抗生物質投与などの攪乱後にも機能的な同期性が回復することを明らかにしました。
本研究は、ラベルフリー定量プロテオミクス手法を用いて、カルシントリン暴露に対する Klebsiella pneumoniae の初期適応応答を解明し、細胞包膜のリモデリングや代謝の再編成など、多面的なタンパク質発現変化を通じて耐性獲得が迅速に起こることを示しました。
本論文は、大腸菌の増殖に伴う細胞配向のパターン化、特にトポロジカル欠陥付近で生じる機械的ストレスが細胞外マトリックス(コラン酸)の産生を誘導し、バイオフィルム形成の初期段階を空間的に制御することを明らかにしたものである。
本研究は、MRSA の多様な防御システムを網羅的に解析し、それらを回避するように設計されたファージの再組換え技術を用いて、耐性獲得を防ぐ効果的なファージ療法の実現に向けた新たな指針を示しました。
本研究は、臨床分離株である*C. jejuni* Bf 株が熱的および酸化ストレスの複合条件下で生存・増殖する際、細胞外小胞(bEVs)の分泌が環境適応と病原性の連結に重要な役割を果たし、ストレス下では小胞のサイズや組成が変化して上皮細胞に対する毒性が増大することを示しています。
ヒト腸内共生菌バクテロイデス・タイタオトミクロンは、100 種以上の遺伝子発現と 33 種のグリコシドヒドロラーゼ酵素の複雑なレパートリーを駆使してムチン O-グリカンを分解し、この過程が腸管への定着に不可欠であることを明らかにしました。