Demonstration and interpretation of "scutoid" cells in a quasi-2D soap froth
この論文は、曲率を持つ境界条件を課された乾燥泡（ドライフォーム）において、上皮細胞で発見された「スクトイド」と呼ばれる新しい細胞形状がシミュレーションと実験の両方で確認できることを示しています。
🔬 Category
physics.bio-ph
55 件の論文
Wave-like behaviour in (0,1) binary sequences
この論文は、量子理論の波動関数を確率測度の類似物として用いる「GenomeBits」モデルを拡張し、独立した (0,1) 二値系列から導かれる複素波動関数の実部と虚部のスペクトルが、塩基配列の位置に対して音波のような特徴的な振る舞いを示すことを明らかにした研究です。
Physics-based signal analysis of genome sequences: GenomeBits overview
本論文は、離散フーリエ変換や量子力学の概念を応用した物理学ベースの解析手法「GenomeBits」の概要と、SARS-CoV-2 やマラプックスウイルスのゲノム配列における変異パターンや秩序・無秩序転移などの特徴を抽出するその有用性を包括的に解説したものである。
The importance of being discrete -- An agent-based model for active nematics and more
この論文は、内部流れに基づく能動的な柔軟なロッドのエージェントベースモデルを提案し、そのシミュレーションから自発的な流れ、トポロジカル欠陥の形成、および密度と配向の結合など、能動的乱流の重要な特徴を粒子スケールで再現し、生体材料の統合的な記述への道を開くことを示しています。
Quantitative EUV ptychography reveals nanoscale morphological responses of bacteria under physiological and antibiotic stress
本論文は、卓上極端紫外線（EUV）ptychography を用いて大腸菌と枯草菌のナノスケール形態を定量的に解析し、枯草菌の胞子形成過程やモノザマイシン抗生物質ストレス下での超微細構造変化を可視化・特徴づけることで、ラベルフリーの細菌イメージングにおける同技術の有効性を示したものである。
Metabolic quantum limit to the information capacity of magnetoencephalography
この論文は、脳の代謝エネルギーと量子限界を組み合わせることで、非侵襲的な脳磁図（MEG）の情報が得られる最大レートが約 2.2 メガビット/秒に制限され、空間分解能と時間分解能の間に根本的なトレードオフが存在することを示しています。
Waiting-time based entropy estimators in continuous space without Markovian events
この論文は、離散化された空間における領域の出入りや多様体の横断といった単一のイベントの頻度と持続時間に基づき、マルコフ的イベントの検出や離散動的仮定を必要とせずに連続空間の系におけるエントロピー生成を推定する新しい手法を提案し、その有効性をブラウン渦のシミュレーションを通じて検証したものである。
Implementation of a Radiation Protection System at Four Hospitals in Ethiopia
エチオピアの 4 病院で行われた調査により、診断画像検査における放射線防護の実態が不十分であることが明らかになり、特に X 線室での機器稼働時の高線量暴露を防止するため、継続的な研修、最新の監視機器の導入、および防護アドバイザーの配置が緊急に必要であると結論付けられています。
The Dynamics of Inducible Genetic Circuits
この論文は、従来の遺伝子回路の動的解析がパラメータ調整に依存するのに対し、統計力学モデルを用いて細胞内のシグナル分子濃度という生体内の制御因子に焦点を当て、ヒル関数ではなく熱力学的モデルを採用することで、生細胞における遺伝子スイッチの安定性制御に関する新たな知見を得ることを目指しています。
Irreversibility and symmetry breaking in the creation and annihilation of defects in active living matter
この論文は、細菌の群集と人間の気道上皮細胞という異なる生物系において、アクティブなネマティック理論の予測に反して欠陥の生成と消滅が空間対称性の破れと不可逆性を示すことを発見し、これが生物系固有のネマティック構造と分極力の二重性に起因し、非平衡生物系におけるエントロピー生成の主要な源泉であることを明らかにしたものである。
In vitro binding energies capture Klf4 occupancy across the human genome
この論文は、Klf4 の物理的結合エネルギーを測定し、統計力学モデル（線形モデルとイジングモデルの組み合わせ）を用いて解析することで、in vitro の結合エネルギーデータが追加の fitting パラメータなしでヒトゲノム全体における Klf4 の占有パターンを正確に予測できることを実証したものである。
Guiding Peptide Kinetics via Collective-Variable Tuning of Free-Energy Barriers
この論文は、Chignolin の変異体における短時間の分子動力学シミュレーションから導出された HLDA 法に基づく集合変数を用いて、自由エネルギー障壁を調整し、アミノ酸置換によるコンフォメーション遷移速度の変化を最小限のサンプリングで予測・制御する新しい枠組みを提案し、その有効性を検証したものである。
Advancing Food Nanotoxicology with Microphysiological Systems: Rebalancing the Risk/Benefit Ratio Toward Safer Nano-Enabled Food Innovations
本論文は、ナノ材料を食品に応用する際の安全性評価において、従来のモデルの限界を克服し、生体反応をより正確に再現するマイクロフィジオロジカルシステム（MPS）の活用可能性を評価し、ナノ食品のリスクとベネフィットのバランスを最適化するための新たな枠組みを提案しています。
The Integration Host Factor is a pH-responsive protein that switches from DNA bending to DNA bridging in acidic biofilm-like conditions
この論文は、統合宿主因子（IHF）が酸性条件下で DNA 折り曲げから分子間架橋へと機能を変化させることを示し、これが細菌バイオフィルムの構造的安定性を支えるメカニズムであることを明らかにしたものである。
Learning functional groups in complex microbiomes
この論文は、機械学習を用いて複雑な微生物群集の機能を少数のグループに要約し、土壌や海洋、腸内などの環境における構造と機能の関係を解明する統合的な手法を提案しています。