🧬 biology
Skinteractome: An online atlas of neuro-immune-stromal interactions in the human skin microenvironment
이 논문은 건강한 상태와 염증 상태 모두에서 인간 피부 미세환경 내의 신경-면역-기질 세포 간 통신 네트워크를 매핑하고 시각화하기 위해 단일 세포 전사체학을 활용하는 대화형 온라인 아틀라스인 Skinteractome을 소개한다.
🧬 Category
q-bio
3918 편의 논문
🧬 biology
Study on the mechanism of type 2 diabetes mellitus on tendon repair based on bioinformatics analysis combined with machine learning models
본 연구는 멘델 무작위 분석, 생물정보학, 그리고 머신러닝을 통합하여 제2형 당뇨병과 건(tendon) 수리 저해 사이의 인과 관계를 확립하였으며, 세포 골격 기능 장애와 대식세포 매개 면역 변화를 통해 치유를 방해할 가능성이 높은 핵심 허브 유전자로 MYL2, MYL3, TTN을 식별하였다.
🧬 biology
3D µEFPocket for Multimodal Communications with Brain Organoids
본 논문은 인간 뇌 오가노이드에서 광학 및 전기적 기록과 더불어 고해상도 시공간적 화학 및 전기 자극을 동시에 가능하게 하여, 3차원적 복잡성의 한계를 극복하고 다중 모드 기능 분석 및 폐루프 연구를 용이하게 하는 파릴렌 C(parylene C)로 제작된 순응형 초박형 미세유체 바이오 인터페이스인 µEFPocket을 소개한다.
🧬 biology
Exploration of Evolutionary Dynamics and Genomic Architecture in Acinetobacter baumannii
본 연구는 범유전체(pan-genome), 계통유전체(phylogenomic) 및 조성 분석(compositional analyses)을 통합하여 전 세계적으로 우세한 *Acinetobacter baumannii* ST2 계통이 수평적으로 획득된 항생제 내성 유전자가 유전체 섬(genomic islands) 내에 안정적으로 유지되는 개방형 유전체 구조에 의존하고 있음을 밝힘으로써, 카바페넴 내성에 대응하기 위해 염색체, 플라스미드 및 파지에 걸친 포괄적인 유전체 감시가 매우 중요하다는 점을 강조한다.
🧬 biology
Long-read RNA-seq resolves isoform-level and context-specific regulatory architecture of complex traits in cattle
본 연구는 432두의 젖소로부터 얻은 인구 규모의 롱리드(long-read) RNA-seq 및 멀티오믹스 데이터를 활용하여 포괄적인 소 전사체 아틀라스를 구축하였으며, 이를 통해 수천 개의 새로운 이소형(isoform)과 맥락 특이적 조절 변이를 밝혀냄으로써 복잡한 형질 유전학의 해상도를 유의미하게 개선하고 기존 숏리드(short-read) 방식이 남긴 "누락된 조절(missing regulation)" 격차를 해소한다.
🧬 biology
Valorization of Shrimp Shell Waste: Crude Protease-Assisted Astaxanthin Extraction Using Bacillus cereus XT-1 and Functional Gene Analysis
본 연구는 핵심적인 35 kDa 중성 프로테아제를 생성하기 위해 *nprC* 유전자를 상향 조절하는 *Bacillus cereus* XT-1이, 향상된 항산화 활성을 가진 고수율의 안정적인 아스타잔틴을 새우 껍질 폐기물로부터 추출하는 효율적이고 친환경적인 생물학적 제제로 작용함을 입증한다.
🧬 biology
Symbiodiniaceae shifts in the corals Acropora cf. solitaryensis and A. aff. divaricata at the climate-driven poleward margin
본 연구는 기후 변화로 인해 북상 중인 *Acropora cf. solitaryensis* 및 *A. aff. divaricata*의 개체군 확장이 높은 숙주 유전적 다양성과 연결성을 유지하는 한편, 해수 온도 저하에 의해 유도된 것으로 보이는 C3 계통에서 C1 계통 심바이오디니움(Symbiodiniaceae)으로의 전환을 특징으로 하는 뚜렷한 심바이오디니움 군집을 나타낸다는 것을 입증한다.
🧬 biology
Sexual evolution in plants: genetic network co-option and reproductive innovation
이 리뷰는 10억 년 전 조상 녹조류에서 기원한 식물의 유성 생식 방식이 MADS-box 전사 인자 및 호르몬 체계와 같은 보존된 유전적 모듈의 반복적인 전용, 중복 및 재배선을 통해 육상 계통 전반에 걸쳐 어떻게 다양화되었는지를 보여주는 통합적인 진화적 프레임워크를 제안한다.
🧬 biology
A Two-step Feature Selection Framework for Computationally Efficient Machine Learning on Genome-wide SNP Data
본 논문은 6,100만 개의 SNP를 계산 가능한 수준의 하위 집합으로 줄이기 위해 분산 기반의 하드 필터링과 XGBoost를 결합한 2단계 특징 선택 프레임워크를 제안하며, 이를 통해 과도한 자원 요구 없이 대규모 유전체 데이터셋에 대한 효율적인 머신러닝 기반 지리적 기원 예측을 가능하게 한다.
🧬 biology
Cognitive appraisal and visual discomfort in severe trypophobia in a cognitive computational case study
이 인지-계산적 사례 연구는 심각한 트라이포포비아(공포증)가 단순히 저수준의 시각적 특성에서만 발생하는 것이 아니라, 초기 시각적 촉발 요인이 질병 및 오염 위협에 대한 상향식 인지적 평가에 의해 증폭되는 통합적 과정에서 발생한다는 것을 입증한다.