🧬 biology
A cross-tissue single-cell and multiomics atlas of cold induced immunometabolic remodeling
본 연구는 추위 노출이 어떻게 조직 선택적인 면역대사 재구성을 유도하는지 밝히기 위해 마우스의 포괄적인 교차 조직 단일 세포 및 멀티오믹스 아틀라스를 구축하였으며, 멀티오믹스 노드인 Chil3에 의해 조절되는 폐 내의 특정 추위 관련 대식세포 하위 집단을 강조한다.
🧬 Category
q-bio
4041 편의 논문
🧬 biology
Seasonal patterns in the prickly pear (Opuntioideae: Opuntia) phyllosphere microbiome: The potential for dynamic core communities
텍사스 전역의 선인장(prickly pear) 엽권 미생물 군집에 관한 이 연구는 계절적 변화와 생태 지역이 미생물 다양성과 네트워크 구조에 유의미한 영향을 미친다는 것을 밝혀냈으며, 이는 가혹한 환경 조건과 일반종 및 전문종 사이의 역동적인 상호작용으로 인해 안정적이고 일관된 핵심 군집이 부재함을 시사한다.
🧬 biology
Independent Effects of APOL6 Overexpression and 5-Azacytidine on the Lipid Metabolic Landscape of Triple-Negative Breast Cancer: Parallel Transcriptomic and Lipidomic Analyses
본 연구는 APOL6 과발현과 5-아자시티딘 처리가 모두 중성 지질 축적을 촉진하고 주요 생합성 경로를 억제함으로써 삼중 음성 유방암 세포의 지질 대사 경관을 독립적으로 재구조화한다는 것을 입증하며, 이를 통해 서로 다른 기전에도 불구하고 공유된 대사적 취약성을 밝혀낸다.
🧬 biology
Host Ontogeny Structures Gut Microbiome Composition and Pathogen-Associated Bacterial Communities in the Endangered Ethiopian Wolf (Canis simensis)
본 연구는 31마리의 에티오피아 늑대를 대상으로 한 샷건 메타게놈 시퀀싱을 활용하여, 무리 구성원 여부보다는 숙주의 발달 단계가 장내 미생물 군집 구성과 병원균 부하를 유의미하게 형성하며, 성체가 아성체가 성체보다 잠재적 병원성 박테리아의 누적 풍부도가 더 높다는 것을 밝혀냈다.
🧬 biology
Fecal bacteriome in pediatric celiac disease in relation to the gluten-free diet and PFAS exposure: a multiomic study
이 전향적 멀티오믹스 연구는 글루텐 프리 식단이 셀리악병 아동의 분변 박테리오옴을 부분적으로 회복시키기는 하지만 완전히 정상화하지는 못하며, 특정 박테리아 분류군이 혈청 PFAS 수치 및 질환 특이적 자가항체와 유의미하게 상관관계가 있다는 것을 밝혀냈다.
🧬 biology
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
본 연구는 다양한 공간 전사체 기술과 생물학적 맥락에 걸쳐 20가지의 최첨단 세포 유형 주석 지정 방법론에 대한 포괄적인 벤치마크를 제시하며, scANVI, Seurat, TACCO와 같은 도구들이 전반적으로 우수한 성능을 보이는 반면, 정밀한 미세 수준의 주석 지정 및 역동적인 상태 주석 지정은 여전히 도전적인 과제로 남아 있으며 맥락 의존성이 매우 높다는 점을 밝힘으로써, 향후 방법론이 오픈 세트 인식, 공간 통합 및 희귀 세포 집단을 더 잘 처리할 수 있어야 할 필요성을 강조한다.
🧬 biology
Feeding the Problem? Free-Ranging Cats and Wildlife Loss in Urban Park
이 연구는 브라질의 한 관리되는 도시 공원에 서식하는 자유 방사된 고양이들이 다양한 야생 동물에 대해 지속적인 포식 활동을 보이며, 이러한 상호작용이 인간의 먹이 공급 지점 근처에 집중되어 있다는 점을 입증함으로써, 먹이 공급이 의도치 않게 포식 기회를 증가시킬 수 있으며 먹이 공급 관행을 도시 야생 동물 보전 전략에 통합할 필요가 있음을 시사한다.
🧬 biology
A minimal Asgard archaeal ESCRT-III system remodels membranes across scales
이 연구는 아스가르드 고균(Asgard archaea) 유래의 최소 단위인 2개 하위 유닛 ESCRT-III/Vps4 시스템이 나노 및 마이크로 규모 모두에서 막을 변형하고 수축시키기 위해 서로 다른 조립 모드를 활용함으로써, 진핵생물과 유사한 막 재구성 능력을 재현한다는 것을 입증한다.
🧬 biology
Lineage predicts SIX effector repertoire but not Avr2 race genotype in Fusarium oxysporum isolates from Türkiye
튀르키예산 *Fusarium oxysporum* 분리주에 대한 유전체 분석 결과, SIX 이펙터 레퍼토리는 기주 기원보다는 계통학적 혈통에 의해 강력하게 예측되는 반면, 특정 *Avr2* 레이스 유전자형은 핵심 유전체 거리나 혈통으로부터 추론할 수 없는 것으로 나타났다.
🧬 biology
First isolation of viable Bartonella spp. from wild rodents and rodent fleas in Chile reveals circulation of a putative novel Bartonella specie
이 연구는 칠레의 야생 설치류와 자연 감염된 *Neotyphloceras* 벼룩으로부터 생존 가능한 *Bartonella* 종을 성공적으로 분리해 낸 첫 사례로, 이는 가상의 신종이 순환하고 있음을 확인하며 원 헬스(One Health) 체계 내에서 이들 설치류와 벼룩이 저류체 및 매개체로서 수행하는 역할을 강화한다.