Shotgun-NF: A reproducible Nextflow pipeline for end-to-end shotgun metagenomics analysis
Shotgun-NF는 컨테이너화와 자동화된 프로비넌스 추적을 통해 다양한 컴퓨팅 환경 전반에서 실행 일관성을 보장하면서, 가공되지 않은 시퀀싱 데이터로부터 균주 수준의 비교 통찰에 이르기까지 엔드 투 엔드 샷건 메타게노믹스 분석을 위한 포괄적인 도구 모음을 통합한 휴대 가능하고, 모듈식이며, 재현 가능한 Nextflow 파이프라인입니다.