An End-to-End Reproducible RNA-Seq Workflow from Raw Sequencing Reads to Differential Expression, Pathway Enrichment, and Biological Interpretation
이 논문은 원시 데이터 처리부터 경로 풍부성 분석에 이르는 도구들을 통합하여, ESR1 변이와 BET 억제제 처리가 주요 생물학적 경로에서 어떻게 상호적인 전사 변화를 유도하는지를 밝혀낸 유방암 사례 연구를 통해 그 유용성을 입증하는, 모듈식이며 버전 관리가 가능하고 완전히 재현 가능한 엔드 투 엔드(end-to-end) RNA-seq 워크플로우를 제시한다.