🧬 biology

Interaction-Token Structural Alignment (ITSA): An Interpretable Framework for Protein Similarity Based on Residue-Level Chemical Interactions

이 논문은 단백질 구조를 국소 정렬을 위한 잔기 수준의 생화학적 상호작용 토큰으로 변환하는 해석 가능한 프레임워크인 상호작용-토큰 구조 정렬(Interaction-Token Structural Alignment, ITSA)을 소개하며, 이것이 전통적인 기하학 중심 방법론이 미치지 못하는 부분에서 패밀리 수준의 유사성을 포착하고 기계적 맥락을 보존하는 데 효과적임을 입증한다.

Samanyu Kulkarni, Ranjita Thapa2026-07-30
🧬 biology

Transforming MRI volumes with Space-Filling Curves reveals Multifractal Signatures of Ageing and Dementia Progression

본 연구는 다중 프랙탈 공간 채움 곡선 분석(MFSCA)을 도입하여, MRI 데이터의 다중 프랙탈성으로 측정되는 뇌 구조의 공간적 조직이 연령 증가 및 치매의 진행에 따라 복잡하고 이질적인 상태에서 단순하고 균질한 상태로 점진적으로 악화됨을 입증한다.

Marta Lotka, Jacek Grela, Zbigniew Drogosz, Jeremi K Ochab, Paweł Oświęcimka2026-07-30
🧬 biology

Exploring ubiquitination-related biomarkers in osteoarthritis based on single-cell and transcriptomic data

본 연구는 단일 세포 및 벌크 전사체 데이터를 통합하여 골관절염 병태생리에 관여하는 5가지 유비퀴틴화 관련 바이오마커(MYC, TLR7, CX3CR1, PER1, GADD45B)를 식별하였으며, 이들이 TNF-alpha/NF-kappaB 경로에 농축되어 있고 특정 면역 세포군과 연관되어 있으며 활막 섬유아세포에서 발현이 높다는 것을 밝힘으로써 해당 질환의 새로운 치료 표적을 제시한다.

Tian Lan, Huan Dai, DeGuang Li, ChongYu Zhao, XiaoYu Mu, Li Li, Chao Wang2026-07-30
🧬 biology

Transformed Callus of Panax vietnamensis: Promising In Vitro Platform for Majonoside R2 Production alongside Hairy Roots

본 연구는 *Agrobacterium rhizogenes*에 의해 형질 전환된 *Panax vietnamensis* 캘러스가 희귀 사포닌인 마요노사이드 R2의 지속 가능한 체외 생산을 위해, 특히 MeJA 유도를 통해 강화될 때 헤어리 루트(hairy roots)를 대체할 수 있는 안정적이고 호르몬이 불필요하며 생산성이 높은 대안임을 입증한다.

HUYEN TRAN, THI QUY TRAN, HongIk Yoon, Hei Chan Lee2026-07-30
🧬 biology

Polarity-Registered Nuclear Mapping Reveals Discrete Topological Classes of Chromosome Organization

본 연구는 인간 중간엽 줄기세포에서 염색체 구조의 이산적이고 재현 가능한 위상학적 클래스를 밝히기 위해 핵 기하학을 정규화하는 극성 등록 핵 좌표계를 도입하며, 이를 통해 기계적 및 극성 제약이 비대칭적이고 상동 염색체 특이적인 공간적 행동을 유도함을 입증한다.

Paolo Netti, Luca Messina, Carlo Natale2026-07-30
🧬 biology

BMP9 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression By Accelerating Cell Cycle through CKS1B Lactylation

이 연구는 BMP9 발현의 상승이 CKS1B-K4 락틸화를 촉진하여 CKS1B와 CDK1–3 사이의 상호작용을 강화하고 p27 분해를 용이하게 함으로써 세포 주기 진행을 가속화하여 간세포암 진행을 유도한다는 것을 밝혀냈다.

Hong Tang, Han Chen, Jianhao li, Ying-Yi Li, Mingming Zhang, Jiayi Wang, Xia Zhu, Weixiu Li, Junpeng Zhou, Xiangnan Teng (…)2026-07-30
🧬 biology

FuncDECODE Resolves Cell-Type-Specific Functional Heterogeneity across Biological States and Spatial Contexts

FuncDECODE는 단일 세포 참조 데이터를 활용하여 혼합된 벌크 및 공간 전사체 데이터를 디콘볼루션함으로써, 다양한 생물학적 상태, 질병 맥락 및 공간적 조직 구조에 걸친 세포 유형별 기능 프로그램의 리모델링을 식별할 수 있게 하는 계산 프레임워크이다.

Yadong Wang, Renjie Liu, Tianyi Zhao2026-07-30
🧬 biology

Malaria parasites coordinate host cell remodeling through the AP2-HCR DNA-binding protein

본 연구는 PfAP2-HCR이 핵심적인 수출 단백질의 발현을 직접적으로 조절함으로써 숙주 세포의 재구성을 조율하고, 이를 통해 무성 및 유성 혈액 단계 모두에서 기생충의 생존, 발달 및 전파를 보장하는 열성(essential) ApiAP2 전사 인자임을 밝혀냈다.

Arnab Pain, Amit Subudhi, Dhiviya Vedagiri, Sara Mfarrej, Reem Abu-Shamma, Rohit Satyam, Rahul Salunke, Di Liu, Maya Aya (…)2026-07-30