GeneRhythm uncovers gene expression rhythms that shape the dynamic transcriptional landscape in single-cell omics
이 논문은 기존의 시계열 기반 접근 방식으로는 포착할 수 없는 리듬감 있는 조절 프로그램과 질병 관련 역동성을 밝혀내기 위해 단일 세포 유전자 발현 분석을 시간-주파수 영역으로 재구성한 새로운 프레임워크인 GeneRhythm을 소개한다.
4730 편의 논문
이 논문은 기존의 시계열 기반 접근 방식으로는 포착할 수 없는 리듬감 있는 조절 프로그램과 질병 관련 역동성을 밝혀내기 위해 단일 세포 유전자 발현 분석을 시간-주파수 영역으로 재구성한 새로운 프레임워크인 GeneRhythm을 소개한다.
이 연구는 일본의 세 가지 식충성 박쥐 종의 장내 미생물 군집을 특성화하며, 호스트 종과 채집 위치 모두가 군집 구성을 유의미하게 결정한다는 것을 밝히는 동시에 *Bacillus cereus* 및 시가 독소 생성 *Escherichia coli*와 같은 다른 병원균과 더불어 *Chlamydophila psittaci*를 처음으로 검출함으로써 원 헬스(One Health)를 위한 야생동물 마이크로바이옴 감시의 중요성을 강조한다.
이 메타게놈 연구는 소형(0.1–0.45 µm) 및 대형(>0.45 µm) 하천 박테리아가 서로 구별되는 항생제 내성 유전자 조성과 숙주 군집을 나타내지만, 궁극적으로는 대등한 항생제 내성 위험을 초래한다는 것을 밝힘으로써 환경 레지스톰에서 소형 박테리아가 가진 중요하고도 이전에 간과되었던 역할을 강조한다.
본 연구는 심해 담수 생태계에서의 미세 규모 위치 추적 음향 텔레메트리 어레이를 평가하며, 탐지 효율은 태그 출력, 수신기 간격 및 온도에 따라 달라지지만 수신기 간격을 400~800미터로 배치할 경우 시스템이 동물의 정확한 위치 파악에 효과적이라는 것을 밝혀냈다.
본 연구는 산란계의 생애 초기 스트레스가 성체기까지 장-뇌 축(gut–brain axis)을 따라 지속적이고 조직 특이적인 대사 및 미생물 재구성을 유도하며, 이는 전신 혈장 프로파일은 대체로 영향을 받지 않는 가운데 회장과 뇌에서 국소적인 지질 및 산화 환원 변화를 특징으로 한다는 것을 입증한다.
본 연구는 단일 핵 RNA 시퀀싱을 활용하여 preBötzinger 복합체 내 Tacr1+ 및 Sst+ 뉴런의 뚜렷한 이온 채널 전사체를 특성화하였으며, 이를 통해 Tacr1+ 뉴런이 호흡 리듬을 생성하는 데 있어 그들의 결정적인 역할을 뒷받침할 것으로 보이는 TRPC5, NALCN 및 특정 신경 조절 수용체의 협동적인 상향 조절을 포함하는 고유한 분자적 특징을 보유하고 있음을 밝혔다.
본 연구는 숙주 마이크로RNA인 hsa-miR-643이 Gins2를 직접적으로 표적하고 하향 조절함으로써 대식세포 내 결핵균(Mycobacterium tuberculosis)의 생존을 촉진하고 세포 사멸을 억제한다는 것을 입증하며, 이를 통해 hsa-miR-643이 결핵의 잠재적인 치료 표적이 될 수 있음을 시사한다.
본 연구는 개선된 유전체 데이터와 전사체 분석을 활용하여 샤가스병 매개체인 *Rhodnius prolixus*의 신경계를 특성화하였으며, 5령 약충의 흡혈이 생리적 과정에 관여하는 유전자들의 광범위한 발현 감소를 유발한다는 점을 밝혀냄으로써, 기아 상태의 반응적인 상태에서 섭식 후의 덜 반응적인 상태로의 전환을 시사하였다.
본 연구는 분자 역학 시뮬레이션을 활용하여 초기 온도 및 압력 변화(각각 280–310 K 및 0–2 bar)가 종양 조직 모델의 포화 또는 평형 온도를 변화시키지는 않지만, 비단조적 경향을 통해 구조적 팽창과 열전도율에 유의미한 영향을 미치며, 원자 간 간격과 원자 이동성 사이의 균형으로 인해 1 bar에서 최적의 열적 및 구조적 특성이 관찰됨을 입증한다.
본 연구는 천연 페놀산, 특히 시나핀산이 행동 분석, 분자 도킹 및 양자 계산을 통해 확인된 바와 같이 세로토닌 기전 및 산화 의존적 활성을 통해 성체 제브라피시에서 용량 의존적인 항불안 및 기억 보존 효과를 나타낸다는 것을 입증한다.