12 artigos
Este artigo apresenta um modelo matemático estendido que integra a dinâmica das subpopulações de células T CAR CD4+ e CD8+ com a regulação do antígeno tumoral, demonstrando como a combinação de simulações mecanicistas e redes neurais pode melhorar a previsão de resultados terapêuticos e elucidar a variabilidade entre pacientes sob incerteza paramétrica.
Este estudo demonstra que ondas evanescentes geradas por reflexão interna total podem ser utilizadas como uma ferramenta não invasiva para detectar alterações na mobilidade de eritrócitos induzidas por variações na concentração de glicose, observando-se uma redução significativa na velocidade média das células em ambientes com maior teor de glicose.
Este trabalho apresenta um modelo de equações diferenciais parciais estruturado por idade para o ciclo celular e analisa como a disponibilidade de dados experimentais limitados, como proporções de fase de FACS e métricas FUCCI, afeta a identificabilidade dos parâmetros, determinando as combinações de parâmetros identificáveis e o volume mínimo de dados necessário para ajustar o modelo com sucesso.
Este trabalho propõe um modelo de campo de fase para simular a apoptose celular induzida por um campo de ativação, explorando as condições para iniciar ou reduzir o processo e demonstrando transições morfológicas como encolhimento e fragmentação que são validadas por comparação com imagens de microscopia eletrônica.
O artigo demonstra que células podem inferir rapidamente e com precisão a direção de uma fonte de quimioatraente em concentrações ultra-baixas, explorando estatísticas de eventos de ligação precoce que carregam informações desproporcionalmente maiores sobre a direcionalidade da fonte.
Os autores descobrem e extraem do modelo de base scGPT um algoritmo compacto e performático para a hematopoiese, utilizando um método de três etapas baseado em interpretabilidade mecânica que supera abordagens padrão em precisão e eficiência computacional.
Este artigo apresenta uma teoria quantitativa que explica a inversão do sinal de fototaxia em mutantes "sem olhos" de *Chlamydomonas*, demonstrando que a lente formada pelo corpo celular concentra a luz de modo que o sinal óptico mais intenso e rápido, proveniente de trás, supera a iluminação direta e inverte a resposta flagelar.
Este artigo apresenta o SSRCA, uma nova metodologia baseada em aprendizado de máquina que facilita a análise de sensibilidade em modelos baseados em agentes (ABMs) biológicos, permitindo identificar parâmetros sensíveis e padrões de saída comuns, como demonstrado no crescimento de esferoides tumorais.
Este artigo propõe um modelo multiescala baseado na teoria cinética de partículas ativas para estudar e comparar a eficácia de diferentes abordagens terapêuticas combinadas (radioterapia, quimioterapia e terapia antiangiogênica) na invasão de gliomas, utilizando dados de imagem de ressonância magnética por difusão e dados clínicos reais para reconstruir a geometria cerebral e simular o crescimento tumoral.
O artigo apresenta o DCENWCNet, uma nova rede neural convolucional emsemble que integra três arquiteturas CNN com configurações distintas para superar os desafios de desequilíbrio de dados na classificação de glóbulos brancos, alcançando desempenho superior em métricas de precisão e incorporando a técnica LIME para garantir a interpretabilidade e confiança nas previsões de diagnóstico automatizado.
O artigo apresenta as Redes Neurais Mecanicistas Celulares (Cell-MNN), uma arquitetura de rede neural totalmente end-to-end que utiliza representações de equações diferenciais ordinárias (ODE) para modelar explicitamente e de forma interpretável as interações gênicas durante a diferenciação celular, superando os métodos atuais em escalabilidade e eficiência computacional.
Este estudo introduz o rastreamento de circuitos causais em modelos de base de células únicas, revelando que tanto o Geneformer V2 quanto o scGPT exibem arquiteturas computacionais distintas caracterizadas por dominância inibitória e coerência biológica, com consensos intermodelos que enriquecem significativamente domínios associados a doenças.