419 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
该研究通过大规模分子动力学模拟揭示，Nanog、Oct4 和 Sox2 在 DNA 存在下通过非加性的协同作用形成具有特定空间组织的转录凝聚体，其中 Nanog 和 Sox2 作为“递送者”促进 DNA 富集，而 Oct4 作为“接收者”在 DNA 富集的间质区域发挥功能，从而提出了一种超越经典转录因子-DNA 结合的新型基因表达调控机制。
该研究通过整合晶体结构分析与分子动力学模拟，揭示了大肠杆菌核糖体出口通道狭窄处具有动态构象变化特性，能根据新生肽链的存在发生适应性扩张，从而取代了以往将其视为静态结构的观点。
该研究通过冷冻电镜技术解析了假单胞菌碳氮代谢关键调控因子 CbrA 的复合物结构，揭示了其作为“转运受体”识别组氨酸的分子机制、CbrX 肽段的稳定结合作用以及质子梯度驱动的构象变化，从而阐明了膜运输与下游信号传导偶联的结构基础。
该研究提出了一种利用表面接枝的荧光 DNA 纳米结构（FluoroCubes）作为新型示踪标记，结合改进的光流算法，实现了比传统荧光微球更高分辨率、更稳定且可调控的细胞牵引力显微成像技术。
该研究结合机器学习、理论推导及跨物种单细胞转录组数据分析，发现基因表达变异性在细胞范围内具有协调性，并证明这种协调模式是区分干细胞与祖细胞等特定调控状态、识别细胞身份及组织结构的新型细胞尺度特征。
该研究通过离散活性网络模型证明，仅依靠弹性肌动球蛋白网络中收缩力与力敏感粘附点之间的平衡及中间速率的周转，即可在无外部信号或化学引导的情况下自发产生对称性破缺并驱动细胞定向迁移。
该研究开发了一种将残基级去溶剂化能直接纳入能量函数的粗粒化模型，揭示了去溶剂化效应不仅通过重塑相图改善了对致密相堆积密度的预测，还通过线性关联温度差与构象压缩程度，并差异化地调控早期粗化动力学与成熟凝聚体中的链迁移率，从而深刻影响了生物分子液 - 液相分离的热力学景观与动力学特性。
该研究证实硬脂酸通过促进脂质膜流动化并增强肽聚糖细胞壁刚度，从而提升革兰氏阳性菌（如表皮葡萄球菌）的生存稳定性与生长性能。
本文介绍了 torch-projectors，这是一个专为 PyTorch 设计的高性能可微傅里叶空间投影库，通过支持多种插值方式和硬件加速，在电子显微镜分析任务中比现有方案快 1 到 2 个数量级。
该研究利用 DAmFRET 技术揭示 TDP-43 的 C 端结构域在液 - 液相分离前会形成动态停滞的聚集体，这些聚集体仅在特定条件下（如存在其他蛋白淀粉样模板且未受其他结构域或应激促进的过度凝聚抑制时）才能作为成核位点引发淀粉样纤维形成，从而阐明了 TDP-43 病理性聚集的特定物理与生物学机制并提出了新的治疗策略。