Validating folding energy estimates as a method for variant interpretation
该研究通过大规模实验数据与自动化 FoldX 流程的系统分析，证明了尽管折叠能量预测的绝对相关性有限，但通过聚合多结构估算并识别异常残基，可有效提升预测精度并识别低置信度变异，从而为利用 FoldX 进行变异解读提供了可靠框架。
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biophysics
613 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Social Information Quality and Environmental Volatility Shape Collective Foraging Behavior
该研究通过多智能体强化学习模型发现，社会信息的质量与环境波动性共同决定了集体觅食行为：低质量信息仅在稳定环境中有效，而高质量信息则能促使个体根据环境变化灵活调整策略，从而形成多样化的集体行为模式。
Robust ciliary flows protect early Xenopus embryos from pathogens independent of multiciliated cell patterning
该研究通过实验与计算模拟发现，早期 Xenopus 胚胎表面的纤毛流能形成稳健的液体屏障以有效清除病原体，且这种保护功能主要取决于纤毛的整体流速，对多纤毛细胞的密度和空间分布变化具有高度鲁棒性。
Absorption dipole effects on MINFLUX single molecule localization
该研究通过模拟揭示了固定吸收偶极子倾斜及光学像差会导致 MINFLUX 单分子定位产生显著系统误差，并指出增加测量点分布密度（如从三角形改为六边形）及迭代缩小探测区域可有效降低或消除部分偏差，但中心位置的偏差仍受偶极子取向强烈影响。
Energy-precision trade-off in mitotic oscillators revealed by ATP modulation in artificial cells
该研究利用高通量微流控人工细胞平台，通过精确调控 ATP 水平揭示了有丝分裂振荡器中能量消耗、振荡速度与精度之间的权衡关系，证明胚胎细胞周期并非追求最大精度，而是处于平衡速度与准确性的代谢最优状态。
G-screen: Scalable Receptor-Aware Virtual Screening through Flexible Ligand Alignment
本文提出了一种名为 G-screen 的可扩展受体感知虚拟筛选框架，该框架通过灵活的全局配体对齐算法结合受体感知药效团评估，在保持毫秒级单分子处理速度的同时，成功兼顾了配体基础方法的效率与基于受体结构的相互作用建模能力，从而实现了在超大规模化学库筛选中兼具高计算效率与优异富集性能的目标。
Characterizing the Impact of Nucleoid-Associated Proteins on HU-DNA Interactions by Live-Cell Single-Molecule Tracking
该研究通过活细胞单分子追踪技术发现，细菌生长阶段依赖的 Dps 和 H-NS 等核蛋白对 DNA 的重组作用会显著改变 HU 蛋白在拟核中的动态行为与结合状态。
Introducing a fusogenicity metric for lipid nanoparticle formulation
该研究提出了一种基于小角 X 射线散射的定量框架，通过测量脂质立方相参数（Q）来表征脂质纳米颗粒（LNP）的融合性，从而为优化药物递送载体的配方及理解生物膜融合机制提供了关键工具。
Rupture-Repair Cycles in Regenerating Hydra Tissues
该研究揭示了再生水螅组织中由机械力触发的钙离子活动是调控破裂修复循环的关键机制，其效率决定了破裂面积分布从具有特征尺度的指数行为向反映间歇性破裂传播的幂律临界态转变。
Myristoylation licenses disordered viral VP4 protein to anchor to and perforate the membrane through phase separation
该研究揭示了柯萨奇病毒 B3 的 VP4 蛋白通过 N 端豆蔻酰化修饰，不仅将其锚定至膜界面，还驱动其发生液 - 液相分离形成动态凝聚体，进而通过诱导膜曲率降低穿透能垒并稳定跨膜孔道，从而阐明了一种单脂质修饰赋能无序病毒蛋白通过相分离机制穿孔细胞膜的新范式。