High-pH NMR to Identify Macromolecular Hydrogen-Bonds and Foldons
该研究提出了一种利用高 pH 值（10-11）NMR 技术来快速、灵敏且低成本地识别蛋白质氢键及折叠单元（foldons）的新方法，其鉴定精度优于传统 D2O 氢氘交换实验，特别适用于分析稳定性较差或部分折叠的蛋白质。
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biophysics
613 篇论文
生物物理学是一门迷人的交叉学科，它像一座桥梁，将物理学的精密原理与生命的复杂奥秘连接起来。在这里，研究者利用物理工具去解码细胞如何运作、蛋白质怎样折叠，甚至探索意识背后的物质基础，让抽象的生命现象变得清晰可测。
Gist.Science 致力于让前沿科学触手可及。我们每天自动追踪 bioRxiv 上发布的最新生物物理学预印本，并由专家团队为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与深度的技术分析。无论您是资深学者还是科学爱好者，都能在这里快速把握研究核心。
以下为您呈现该领域最新发布的论文列表，带您即刻开启探索之旅。
Beyond fish in formation: A two-tier approach for biomechanical studies of collective movement
该研究提出了一种结合人工智能追踪与机械模拟的两级研究方法，揭示了鱼群通过个体对流体刺激的动态位置与运动调节，在频繁重组的队形中实现能量节约的机制。
Morphological parameters can capture emergent properties of dynamic disordered cytoskeletal networks
该研究通过模拟肌动蛋白网络并构建形态空间轨迹，证明结合曲率和纹理等多维形态描述符能有效区分动态无序细胞骨架系统的不同状态，从而为细胞骨架动力学的分类与数据驱动建模提供了新的量化方法。
Base-pair scale dynamics of a repair helicase on DNA lesions reveal varied damage-sensing mechanisms
该研究利用光镊技术实时观测 XPD 解旋酶在 DNA 损伤处的单分子动态，揭示了其根据损伤类型和 DNA 构象采取不同响应机制（如在 CPD 损伤处暂停后退而非完全停滞），并确定了两个对 DNA 修饰敏感的关键结构区域。
Mechanical regulation of cellular energy metabolism in cancer microenvironments
该研究通过引入细胞代谢势构建非平衡主动化学力学模型，揭示了基质刚度与配体密度如何共同调控乳腺癌细胞的能量代谢、形态及收缩力，并实验验证了机械微环境通过激活 AMPK 驱动细胞代谢适应的机制。
Amendable decisions in living systems
该论文提出并验证了一种针对可修正决策的最优策略理论，指出与不可撤销决策不同，生物系统通过动态修正决策，能够在有限平均时间内实现零误差，这一机制成功解释了从细胞分化到人类视觉实验中的广泛现象。
Fast MAS NMR Spectroscopy Can Identify G-Quartets and Double-Stranded Structures in Aggregates Formed by GGGGCC RNA Repeats
该研究利用快速魔角旋转核磁共振技术，证实了由 C9orf72 基因 GGGGCC 重复序列形成的 RNA 聚集体中同时存在 Watson-Crick 和 Hoogsteen 碱基配对，揭示了 G-四链体与双链结构之间的动态平衡受二价阳离子及核提取物调节。
Temperature and intrinsic Ca2+ reshape TRPM4 pharmacology
该研究揭示了温度和细胞内钙离子浓度能显著重塑 TRPM4 离子通道的功能与药理学特性，使原本被认为对 TRPM4 无活性的 TPPO 在生理条件下转化为强效激活剂，同时阐明了不同配体在特定环境下的协同或拮抗机制，强调了开发环境感知型靶向疗法的重要性。
Mid-infrared light produces anti-ageing effects through resonant absorption by living organisms
该研究表明，特定频率（约 34 THz）的中红外光可通过与核酸和线粒体磷脂中磷酸基团的振动模式发生共振吸收，在不产生热效应的情况下提升细胞整体运作效率，从而显著延缓秀丽隐杆线虫的衰老过程并延长其寿命。
A fast and accurate calculation method for light induced isomerization of retinal proteins in real time
该研究提出了一种基于量子力学优化力场参数的经典分子力学计算方法，能够在真实时间尺度（500 fs）下高精度模拟视黄醛蛋白的光诱导异构化过程，成功重现了通道视紫红质-2 的分支光循环机制及不对称激发态势能面，为光遗传学工具的设计与视蛋白结构优化提供了关键理论支持。