Variable performances of commercial eDNA inventories challenge their use for surveying stream fish communities
该研究通过对比四家商业公司的 eDNA 检测服务与实地鱼类调查，发现其在物种检出率和准确性上存在巨大差异及大量误报，表明在缺乏统一标准和全面 DNA 条形码数据库的情况下，目前商业 eDNA 技术尚不足以可靠地用于物种丰富度高的溪流鱼类群落评估。
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ecology
413 篇论文
Scale cortisol levels vary with habitat type and population in the Mexican tetra Astyanax mexicanus
该研究通过分析墨西哥盲鱼（Astyanax mexicanus）不同栖息地种群的鳞片皮质醇水平，揭示了长期环境压力与遗传适应共同塑造了该物种的慢性应激生理机制，并证实鳞片皮质醇是评估生物应对多样化极端环境能力的有效生物标志物。
Degree heating weeks fail to reach alert thresholds yet coral bleaching is widespread: structural insensitivity of anomaly-based metrics across Japan's latitudinal gradient
该研究基于日本 2020 至 2024 年的监测数据指出，由于基于最大月均值（MMM）的异常值设计导致其在低纬度地区热信号被压缩、高纬度地区热事件缺失，传统的“度热周”（DHW）指标在日本珊瑚监测网络中普遍失效，无法有效预警广泛发生的珊瑚白化，而绝对温度指标（如 SST≥30°C）表现出更优的预测能力。
Information-Theoretic Origins of Universality in Stochastic Biological Systems
该研究通过随机个体生长模型表明，代谢率随体型变化的普适性（如克莱伯定律）源于细胞动力学中的信息中性，即在特定微观噪声结构下，宏观代谢波动对微观噪声最不敏感且对体型依赖性最大，从而揭示了这种普适性源自随机代谢波动的信息论最优。
Importance of functional diversity in benthic remineralization: a new perspective through the lens of Nares Strait, a key Arctic gateway
该研究以加拿大北极的奈尔斯海峡为案例，通过对比不同海冰覆盖条件下的沉积物实验，发现功能多样性比分类多样性更能预测底栖再矿化通量，并指出海冰减少可能导致沉积食性生物优势化，从而加速有机质再矿化并削弱该区域乃至整个北极的碳汇功能。
Evaluation of Phosphogypsum and Pore Volume Water Rates for Reclaiming Saline-Sodic Cambisols of Metehara Sugar Estate, Central Rift Valley of Ethiopia
该研究通过柱实验表明，在埃塞俄比亚梅特哈拉糖业种植园的盐碱化始成土改良中，施用相当于 100% 石膏需求量（≥13 吨/公顷）的磷石膏并配合 3-4 倍孔隙体积的淋洗水，是降低土壤盐度和钠吸附比至作物适宜水平的最有效组合。
BatSpot: a retrainable neural network for automatic detection and classification of bat echolocation and detection of buzzes and social calls
本文介绍了 BatSpot，这是一种可重训练的卷积神经网络工具，能够自动检测并分类蝙蝠的搜索期叫声、嗡嗡声及社交叫声，其性能优于现有商业和开源方案，且支持用户针对特定需求进行模型微调以提升识别准确率。
Windthrow-generated tip-up mounds create contrasting regeneration niches for red oak and black cherry in a deer-browsed Carolinian forest
该研究指出，在安大略省卡罗林纳地区受白尾鹿啃食抑制的森林中，风倒树形成的翻根土丘创造了与地面截然不同的微环境（更干燥、通气性更好），从而为黑樱桃提供了比红栎更有利的幼苗存活条件，表明这些土丘正成为气候变化和鹿害背景下关键的树种更新生态位。
SPECIES DISTRIBUTION PROJECTIONS UNDER INTERNAL CLIMATE VARIABILITY REVEAL MULTIPLE PLAUSIBLE FUTURES REQUIRING FLEXIBLE CLIMATE-READY DECISIONS
该研究利用 CESM2-LENS2 的 100 个初始条件成员对 34 种海洋和陆生物种进行分布投影，发现内部气候变率（ICV）本身即可导致截然不同的分布预测结果（甚至逆转范围变化），且这种变异性无法完全由物种特征或局部气候变率解释，因此强调生物多样性规划必须基于多种合理气候情景的应力测试，而非依赖单一的最佳估计地图。
Validating wing biopsies for blood-borne pathogen characterization in bats
该研究通过对吸血蝙蝠进行血液与翼膜活检的配对检测，发现翼膜样本虽因检出率较低而不适合用于精确估算血源性病原体的感染率，但因其能检测到相同感染且操作更便捷，仍可作为病原体初步筛查和发现的有效替代方案。
Herbarium specimens reliably track plant phenological responses to climate change in understudied montane biomes
该研究通过对比近 50 年的实地观测数据，证实了植物标本馆标本虽在捕捉次级开花高峰及温度敏感性估算上存在一定局限，但仍是可靠资源，能够有效弥补高山生态系统物候响应气候变化研究中的空间数据空白。
Timing the regional spread of PRRSV-2 variants across the United States
本研究基于美国 2015 至 2024 年间 14,835 条 PRRSV-2 序列，揭示了该病毒变体在美国五大生猪产区间的传播动态，发现其从起源地扩散至其他区域通常需 1.2 至 3 年，且内陆地区间传播速度快于沿海至内陆路径，这一发现有助于优化疾病传播模型并提升防疫准备能力。
Trait misalignment risk in North American forests under climate change
该研究基于北美 4 万余个森林样地的功能性状数据，量化了未来气候情景下森林群落功能特征与气候条件错位的风险，发现高纬度及山地针叶林面临最高风险，而物种多样性是降低此类风险的关键缓冲因素。
Stage-dependent biotic interactions may not be important for stochastic competitive dynamics with little variation in stage structure
该研究表明，尽管考虑了发育阶段依赖的种间相互作用，但在环境随机性主导且种群结构波动较小的情况下，忽略发育阶段结构的简化模型仍能提供高度准确的群落动态预测，因此发育阶段依赖相互作用的实际重要性主要取决于种群结构随时间波动的程度。
Soil organisms in military-impacted environments: A systematic review of microbial community studies, contamination types, and methodological gaps
本文系统综述了军事活动影响下土壤微生物群落的研究现状，揭示了当前研究过度依赖细菌 16S rRNA 测序、缺乏真菌与土壤动物调查、理化指标（如土壤容重）记录不全以及方法学完整性不足等关键问题。
Temperature station matching for elevation-standardised ecological meta-analysis
该研究提出了一种透明的人工匹配协议，通过利用参考气象站数据推导区域海拔校正因子，成功解决了因海拔差异导致的温度数据标准化难题，从而实现了基于海拔校正的跨地区生态元分析可比性。
Automated morphometry and weight prediction of juvenile Chinook Salmon leveraging open-source deep learning models
该研究利用开源的 Meta Segment Anything 模型（SAM）开发了“免手抓”（HandsFreeFishing）系统，通过自动分割幼鲑图像提取形态特征，在最小化鱼类干扰的前提下实现了高精度的体重预测。
Trait dimensionality in experimental and natural ecological communities
该研究通过整合系统发育信息与群落构建数据发现，实验和自然植物群落中维持物种共存所需的生态性状维度往往高于物种丰富度，且受面积、物种库大小和纬度等因素的复杂影响，从而挑战了传统低维性状视角下的群落结构观点。
Generational selection, transcriptomics and functional characterization reveal the impact of environmental pollutants on the evolution of insecticide resistance in malaria vectors
该研究通过多代选择实验和转录组分析，揭示了环境污染物（多环芳烃）可作为额外驱动因素，通过激活芳烃受体通路及上调特定细胞色素 P450 基因（如 CYP6M4）的表达，促进按蚊代谢性杀虫剂抗性的进化。
A novel pipeline for the rapid expansion of ecological trait databases using LLMs
该论文提出了一种利用大语言模型从真菌物种描述中快速提取形态性状数据的新流程，通过将其与人工数据集进行对比评估，展示了该方法在加速构建跨类群生态性状数据库及推动生态研究方面的巨大潜力，同时也指出了不同性状和模型间存在的精度差异及系统性偏差。