🧬 生物学

STAT3 of colonic epithelial cells prevents metabolic dysfunction-associated steatohepatitis by targeting Aldh1a1 to modulate gut-liver retinoic acids and CD103+ dendritic cells

这项研究表明,结肠上皮细胞中的 STAT3 通过直接抑制 Aldh1a1 转录以调节视黄酸水平,从而维持免疫调节性 CD103+ 树突状细胞的肠-肝稳态,进而防止代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的发生。

Jiahui Xu, Jiyuan Zhou, Hongbin Liu, Ruo Huang, Wendi Zhang, Qian Zhou, Zhanhui Ye, Yangzhi Xu, Liangying Ye, Fachao Zhi (…)2026-10-02
🧬 生物学

Cis-meQTL mapping reveals genetic architecture of DNA methylation in a giga-genome species

通过对602株挪威云杉幼苗进行顺式顺式定量性状位点(cis-meQTL)图谱绘制,本研究表明,在该巨型基因组物种中,DNA甲基化的变异在很大程度上受遗传控制,从而为将表观基因组标记整合到基因组选择计划中奠定了基础。

Víctor Chano, Konstantin V. Krutovsky, Kai Wang, Matti Haapanen, Fred O. Asiegbu, Oliver Gailing2026-10-02
🧬 生物学

Haplotype-resolved PacBio HiFi genome assemblies of the olive cultivar ‘Picual’

本研究通过使用 PacBio HiFi 测序技术,呈现了一个高质量、染色体水平且单倍型解析的橄榄栽培品种‘Picual’基因组组装,揭示了一个大小为 1.24 Gbp、BUSCO 完整度为 97.9% 的共识基因组,并鉴定出 35,281 个在两个单倍型之间存在差异表达证据的蛋白质编码基因。

Martín Moret, Silvia Manrique, Aureliano Bombarely, Francisco Luque2026-10-01
🧬 生物学

Genomic Connectivity and Adaptive Gene Flow of Anopheles gambiae s. s. Across East and Central Africa

本研究利用全基因组数据揭示,尽管东非和中非地区的冈比亚疟蚊(*Anopheles gambiae* s. s.)种群普遍表现出高水平的基因流,但存在限制沿海和南部扩散的独特生态屏障,且杀虫剂抗性等位基因的扩散程度因位点而异,这使得埃塞俄比亚成为监测新兴适应性的关键汇聚区。

Fekadu Gemechu, Kelly L. Bennett, Araya Eukubay, Sisay Dugassa, Anastasia Hernandez-Koutoucheva, Luna Kamau, Tadesse Keb (…)2026-10-01
🧬 生物学

AM-NET: A lightweight framework for detecting Stellera chamaejasme and supporting occurrence assessment in complex alpine grasslands

本文提出了 AM-NET,这是一个基于 YOLOv11n 并结合新型架构模块的轻量化检测框架,该框架在复杂高山草甸中识别有毒植物天鹅葵(*Stellera chamaejasme*)时实现了更高的准确率并降低了计算成本,同时通过基于 Web 的系统支持实时生态风险评估。

Siyuan Wang, Futao Yan, Zhijie Fan, Lijun Feng, Yuqi Wu, Qiangqiang Yao, Dedong Gao, Ying Zhang2026-10-01
🧬 生物学

Multifractal-Driven Optimization of Read Length and Depth in Metagenomic Sequencing: A Utility-Based Framework

本文引入了一种多重分形驱动的效用框架来优化宏基因组测序参数,揭示了虽然信息增益在超过 500 bp 和 10M 次读取后会递减,但在 Illumina NovaSeq 平台上进行的成本效益分析表明,对于中等预算的大规模队列而言,600 bp 的读长和每样本 3M 次读取是最佳平衡点。

Xianhua Xie, Zuguo Yu, Guosheng Han, Yujie Huang, Yuanlin Ma2026-10-01