🧬 生物学

Cross-Platform Evaluation of Long-Read Sequencing for DNA Methylation and Portability of Methylation Predictors

本研究表明,尽管长读长测序技术(ONT 和 PacBio)提供了广泛的甲基化组覆盖范围并支持大规模甲基化预测器的可移植性,但其目前在单个 CpG 位点上的跨平台一致性仍不足以在不增加测序深度、校准和特定平台验证的情况下直接替代 Illumina EPIC 芯片。

Zongli Xu, John S. House, Joseph Breeyear, David C. Fargo, Charles P. Schmitt, Lawrence S. Kirschner, Trevor K. Archer (…)2026-09-30
🧬 生物学

Divergent PML and Nucleolar Body Programs Distinguish Protected from Vulnerable Neurons in FTLD-TDP

这项研究揭示了在 FTLD-TDP 中,神经元表现出两种分歧的核体重塑程序——其中保护性的 SUMO1 核仁积累和 PML-核仁接触与 TDP-43 滞留相关,而进行性的 PML 核膜接触和巨型 PML 体则驱动 TDP-43 耗竭——从而确定了相分离质量控制区室是神经元易感性的关键决定因素。

Oseas Medina, Alissa Nana Li, Lily Talley, Stephanie E. Gaus, Joel H. Kramer, Jennifer S. Yokoyama, Howard J. Rosen, Mar (…)2026-09-30
🧬 生物学

Structure-guided prioritization of divergent virulence and resistance candidates in an open pangenome clinical Escherichia coli isolate

本研究提出了一种集成且由结构引导的计算流程,该流程通过结合泛基因组过滤、蛋白质语言模型、结构预测和分子动力学模拟,成功地从一个多重耐药大肠埃希菌分离株的开放式泛基因组中,优先筛选出四种差异化的毒力及抗生素耐药候选对象。

Sarra Benmoumou-Hosni, Atika Mekla, Ikram Haleche2026-09-30