q-bio 篇论文 | Gist.Science

本研究表明，在严重感染所特有的缺氧结肠环境中，通过经由 LuxS 依赖性调节并由缺氧诱导表达的艰难梭菌（*Clostridioides difficile*）CDT 二元毒素，会驱动中性粒细胞激活并加剧炎症性组织损伤。

这项针对五种人类致癌病毒的 75 项单细胞 RNA 测序研究的系统综述表明，虽然不存在通用的宿主基因特征，但反复出现的病毒-宿主程序涉及复杂的免疫相互作用和随环境变化的病毒转录关联，凸显了需要严谨的研究设计来开发具有可重复性的生物标志物。

本研究通过整合来自199头奶牛的ATAC-seq和RNA-seq数据，表征了泌乳期奶牛乳腺组织的染色质可及性及其遗传调控，识别出数千个caQTL和eQTL，揭示了特定的转录因子和染色质状态如何从机制上调节基因表达。

本系统综述评估了多器官芯片系统的架构、动力学及规模化原理，旨在增强临床前药物转化，同时识别了必须克服的诸如材料吸收、培养基标准化以及传感器集成等关键障碍，以实现监管与临床应用。

本系统综述综合了关于真菌鉴定与培养的证据，强调了三级诊断框架的优越性、标准化与可持续生长培养基的有效性，以及热伪影和污染等关键操作挑战。

本研究利用高分辨率的 Micro-C、RNA-seq 和 ATAC-seq 分析证明，按蚊体内的染色体倒位（2La 和 2Rbc）调节了 3D 染色质架构并重构了增强子-启动子相互作用，从而改变了涉及疟原虫易感性的关键免疫基因的表达。

这项研究揭示了上调的 circLMF1 通过稳定 TFE3 以诱导 MVP 和 ABCC1 的表达，从而促进间质型胶质母细胞瘤的亲神经-间质转化，并同时使胶质母细胞干细胞对铁死亡更加敏感，进而确定了用于联合靶向治疗的治疗脆弱性。

本研究确定了 TFAP4-DPEP1 调节轴是结直肠癌中促进恶性进展（包括肿瘤生长、转移、EMT 和癌症干性）的关键致癌驱动因子，从而凸显了 DPEP1 是一个具有前景的治疗靶点。

本文呈现了一个由亚瑟·博特（Arthur Bott）私人收藏的5,974条历史鳞翅目昆虫记录组成的数字化标本级数据库，以标准化的格式为全球研究提供了关于20世纪物种分布、保护状态及表型特征的宝贵数据。

通过整合大体量（bulk）和单细胞RNA测序数据，本研究开发了一个稳健的膀胱癌五基因免疫微环境相关预后模型，该模型能够准确预测患者生存期，并识别可能从免疫治疗中获益的候选群体。