🧬 生物学

Disclosed and Undisclosed GPU Hardware Exclusion Across the Modern Protein Structure Prediction and Design Toolchain: A Compute-Accessibility Audit

本文对现代蛋白质结构预测工具进行了计算可访问性审计,揭示了未披露的硬件需求——特别是旧款图灵架构 GPU 上的静默数据损坏问题——造成了研究领域的不平等障碍,并指出有必要建立一种新的故障模式分类法以及明确披露最低计算能力要求。

Siddhardha Nanda2026-09-24
🧬 生物学

Relative contributions of reconstruction pipeline and MRI field strength to hippocampal shape variation

在一项针对健康成年人的研究中,重建方法对海马体形状变化的影响大于磁共振成像(MRI)场强(3T 与 7T),其中 FSL 显示出与手动分割最接近的一致性,并支持了使用 3T MRI 进行全海马体形态测量学分析的有效性。

Luis Miguel Echeverry-Quiceno, Katherine A. Koenig, Álvaro Heredia-Lidón, Xavier Sevillano, Neus Martínez-Abadías2026-09-24
🧬 生物学

Local Exclusion and Flux Loss Jointly Localize Ribosomal Traffic Jam Onset: The Exclusion Bottleneck Index in Synthetic TASEP Simulations

本文引入了排除瓶颈指数(Exclusion Bottleneck Index, EBI),这是一种结合了局部通量损失和条件阻塞概率的无参数指标,它能够准确且稳健地定位合成 TASEP 模拟中不同参数机制下核糖体交通拥堵的起始点,其性能优于标准观测指标和单组分指标。

Yathu Krishna Y K, Sabarinath P2026-09-24
🧬 生物学

Systematic review and Meta-analysis of the effects of air pollution exposure on nasal mucosal immune-inflammatory markers in experimental animal models of AR

这项针对18项实验性动物研究的系统评价和荟萃分析表明,空气污染暴露通过破坏鼻上皮屏障、激活先天免疫以及促进Th2型炎症(表现为嗜酸性粒细胞浸润增加、促炎细胞因子水平升高以及ZO-1表达降低),显著加重了过敏性鼻炎。

Pan Zhuo, Lv Ze yi, Li Xin rong2026-09-24
🧬 生物学

AFRACT: Autocorrelation-Aware Fractal Dimension for Complex Networks

本文介绍了 AFRACT,一种具有自相关意识的球质量缩放算法,该算法通过基于空间自相关对节点进行加权,克服了传统盒覆盖方法中的中心节点敏感性和属性集成缺失问题,同时提供了一个严谨的公理化框架、一个具有 471 倍加速效果的精确基于快速傅里叶变换(FFT)的实现方式,以及一个通用的有限尺寸修正律,从而在各种复杂网络中实现高度精确且稳健的分形维数估计。

Salvador Bermudez2026-09-24
🧬 生物学

Molecular mechanisms of thermal tolerance regulated by phycosphere bacteria in isolated Symbiodiniaceae

本研究阐明了特定的藻圈细菌(细微红球菌属 Exiguobacterium sp. 和红杆菌属 Erythrobacter sp.)如何通过重塑细菌群落以缓解氧化应激,并上调宿主 DNA 修复和细胞周期通路,同时下调高耗能的光合作用,从而增强分离共生藻科(Symbiodiniaceae)的耐热性。

Tang Tang, Peining Zhu, Xuemei Yao, Peixian Huang, Lijun Qiao2026-09-23