🧬 biology
MiShape: 3D Mitochondrial Shape Modelling for Fluorescence Microscopy
MiShape 是一个新颖的框架，它利用从高分辨率电子显微镜中学习到的 3D 形态先验，能够从单张 2D 荧光显微图像中精确重建 3D 线粒体形态，在几何和拓扑指标上均优于现有方法。
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q-bio
4404 篇论文
🧬 biology
Benchmarking Classical, Hybrid, and Quantum Annealing Workflows on a Structured Control QUBO
本文通过对源自温室加热器调度计划的结构化二进制控制 QUBO 进行基准测试，评估了经典、混合及量子退火工作流，发现虽然经典和模拟量子方法始终能产生近优解，但目前的量子硬件和混合求解器尚未展现出相对于经典基准方法的性能优势。
🧬 biology
Ecological constraints to mirror life
本文提出了一个理论框架，证明了镜像生命形式尽管在分子层面具有可行性，但由于营养不兼容性以及现有生物群落的竞争排斥，很可能会面临严峻的生态约束，并无法在自然生态系统中建立自身。
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Case report on Variations of the Musculocutaneous Nerve
本病例报告记录了在解剖实验室中观察到的三种不同的肌皮神经解剖变异，包括两例由正中神经功能性补偿的肌皮神经完全缺失，以及一例在支配喙肱肌后与正中神经融合的情况，所有这些变异对于诊断上肢感觉和运动功能障碍均具有重要的临床意义。
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Cross-species ncRNA annotation using synteny-constrained embedding similarity
本文介绍了 CURIA，这是一个结合了共线性约束基因组比对与 RiNALMo RNA 基础模型嵌入的新型流水线，旨在通过识别能够补充传统序列保守性指标的局部嵌入支持区域，来改进跨物种非编码 RNA 的注释。
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A single-cell atlas of cancer-educated ecotypes across high-risk pediatric sarcomas
本研究展示了高风险儿童肉瘤肿瘤微环境的全方位单细胞与空间图谱，通过定义不同的细胞状态和十二种肿瘤微环境原型，揭示了保守且具有实体特异性的多细胞生态位，为开发合理的免疫疗法提供了框架。
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Unmasking the Black Box: Computational Evidence Identifying Mitochondrial ATP Synthase Subunit β as a High-Confidence Target of Glycyrrhetinic Acid Analogs Against Brugia malayi
本研究通过针对高置信度 AlphaFold2 模型进行全蛋白质组范围的反向分子对接筛选，将线粒体 ATP 合酶 β 亚基鉴定为强效宏小肠孢子杀灭剂甘草次酸类似物 6a 的高置信度、结构合理性的分子靶点，从而为该类化合物在班氏曼虫（*Brugia malayi*）中观察到的药效与其此前未知的作用机制之间提供了计算证据，弥合了两者之间的鸿沟。
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Diel variation in diving behaviour of rehabilitated grey seal juveniles (Halichoerus grypus) in the Baltic Sea
本研究表明，经康复处理的幼年波罗的海灰海豹通过表现出截然不同的昼夜潜水模式（其特征为白天的潜水更深且时间更短，而夜间的潜水更浅且时间更长）从而迅速适应当地环境，这暗示了其在释放后对猎物分布进行了成功的行为调整。
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PolySUMOylation restrains ubiquitination to protect fragile genomic loci during replication stress in fission yeast
这项研究表明，在裂殖酵母中，polySUMO化通过抑制同源重组因子Rad52的K63链连接的聚泛素化，从而防止其异常积累和基因组不稳定，以此在复制压力期间保护脆弱的核糖体DNA。
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CRISPRi loss-of-function mutations revealed through experimental evolution in Burkholderia cenocepacia
通过对*Burkholderia cenocepacia* CRISPRi突变体的实验进化研究，研究人员发现，向野生型生长表型的回复是由导致dCas9表达缺失的鼠李糖摄取缺陷引起的，而非由CRISPRi机制本身的突变引起。