🧬 biology

SSR marker-based genetic diversity and population structure of large-leaf tea germplasm across four major tea-producing regions of Yunnan, China

本研究利用SSR标记对来自云南四个地区的216份大叶茶种质资源进行了分析,结果显示种群内部存在丰富的遗传多样性,而由于广泛的基因流和历史交流,区域间的分化较弱,从而为未来的保护和育种工作奠定了基础。

Qihuan Ding, Wuxiang Fu, Ning Chi, Jianmei Su, Shanshan Wu, Zhanxia Ma2026-07-01
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GcQCR7 Mediates Pathogenicity via Maintaining Cell Wall Integrity and Enhancing Oxidative Stress Tolerance in Glomerella cingulata

本研究表明,线粒体亚基 GcQCR7 通过维持细胞壁完整性、能量代谢和氧化应激耐受性,对于柑橘炭疽菌(*Glomerella cingulata*)的致病性至关重要,从而将其确定为管理苹果生产中柑橘炭疽病的新靶点。

Mingjuan Yang, Xinyue Cui, Shan Zhang, Fang Wang, Weichao Ren, Pingliang Li, Na Liu, Baohua Li, Chengying Jiang, Sen Lia (…)2026-07-01
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Shotgun-NF: A reproducible Nextflow pipeline for end-to-end shotgun metagenomics analysis

Shotgun-NF 是一个便携式、模块化且可重现的 Nextflow 流水线,它统一了一套全面的工具集,用于实现从原始测序数据到菌株水平比较见解的全程鸟枪法宏基因组学分析,同时通过容器化和自动化溯源追踪,确保在不同计算环境中的执行一致性。

Fereshteh Izadi, Sepideh Mofidifar, Emily A. Wasson, Carla S. Möller-Levet, André P. Gerber2026-07-01
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Predicting Microbiologically Influenced Corrosion Risk from Quorum Sensing Biofilm Community Features: A Random Forest-SHAP Approach

本研究引入了一种随机森林-SHAP机器学习框架,该框架通过将新型群体感应生物膜群落特征与传统的环境及微生物参数相结合,成功预测了微生物影响腐蚀风险,实现了0.762的F1分数,并证明了细菌通信信号在腐蚀评估中的预测价值。

Bipul Bhattarai, Naina Maharajan, Sulav Dahal2026-07-01
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AI-Based Pipeline for Vascularization Detection in Histological Images; low-cost solution Using Moderate Computing Resources

本文提出了一种低成本、用户友好的 AI 流水线,该流水线将简单的图像处理与交互式自学习相似性搜索方法相结合,使病理学家能够利用适度的计算资源和极少的人工标注,快速且准确地检测组织学图像中的血管化现象。

Jan Žídek, Bretislav Lipový, Veronika Pavliňáková, Martin Knoz, Jakub Holoubek, David Izsák, Vladimir Váňa, Jan Herudek (…)2026-07-01
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Ecological Inference Is Structured Empirical Risk Minimization: Generalization Across Space, Nested Units, and Niche Support

本文认为,地理模型频繁无法在不同地点进行泛化的原因在于嵌套调查数据中存在根本的估计量不匹配,并论证了生态推断在结构上等同于领域泛化下的经验风险最小化,因此需要通过群体层面的留出验证而非标准的个体层面交叉验证,以确保可靠的空间迁移。

R. Craig Stillwell2026-07-01