⚗️ biochemistry

Regulation of mitochondrial DNA homeostasis by a mitochondrial microprotein

تحدد هذه الدراسة AltSLC35A4، وهو بروتين ميكروي محفوظ مشفر بواسطة إطار قراءة مفتوح بديل، كمنظم جديد لتوازن الحمض النووي الميتوكوندري يتفاعل مع مكونات الهيكل الخلوي للأكتوميوين للحفاظ على التوزيع المكاني لكتل النوكليويد وعدد النسخ بشكل مستقل عن حالات التضاعف أو الحالات الحيوية الطاقية.

Ajala, I., Lipuma, D., Bonnamour, G., Vanderperre, B.2026-02-21
⚗️ biochemistry

Linking biochemical and cellular efficacy of MERS coronavirus main protease inhibitors

تُظهر هذه الدراسة أنه بينما يمكن لأساليب متعددة لتحليل البيانات أن تربط بين التثبيط الكيميائي الحيوي والنشاط المضاد للفيروسات لمثبطات البروتياز الرئيسي لفيروس ميرس (MERS-CoV)، فإن نموذج حركية الإنزيم الذي يأخذ في الاعتبار التضاعف ومنحنيات الاستجابة للتركيز ثنائية الطور يوفر التنبؤ الأكثر دقة للفعالية الخلوية.

La, V. N. T., Lahav, N., Rodriguez, M., Diaz-Tapia, R., McGovern, B., Benjamin, J., Barr, H., Kang, L., Chodera, J. D. (…)2026-02-21
⚗️ biochemistry

The promoter-poised Rpd3 HDAC complex orchestrates global chromatin reprogramming upon nutrient transition

تكشف هذه الدراسة أن معقد نزع الأسيتيل من الهيستون Rpd3L يعمل كحارس بوابة استقلابي في خميرة *Saccharomyces cerevisiae* من خلال إزالة أستلة H3K9 ديناميكيًا من المحفزات النشطة عند التحولات الغذائية، مما ينسق إيقاف برامج النمو ويضمن الدقة النسخية أثناء الانتقالات الاستقلابية.

Bhattacharya, S., Sutter, B. M., Tu, B.2026-02-20
⚗️ biochemistry

Identification of 4,5,6,7-Tetrabromo-1H-benzotriazole (TBB) as a Small Molecule MESH1 Inhibitor that Suppresses Ferroptosis

تحدد هذه الدراسة مركب 4،5،6،7-رباعي برومو-1H-بنزوتريازول (TBB) كـمثبط جزيئي صغير محدد لإنزيم NADPH فوسفاتاز MESH1، والذي يعمل بفعالية على كبح الموت الحديدي (ferroptosis) في المختبر ويقلل من موت الخلايا العصبية في نموذج لمرض ألزهايمر، مما يؤكد أن MESH1 هدف علاجي واعد.

Mestre, A. A., Oh, Y., Wu, J., Dunn, D., Setayeshpour, Y., Chen, S.-Y., Lin, C.-C., Cochrane, C. S., Jeong, P., Nam, G. (…)2026-02-20
⚗️ biochemistry

Structural basis of metalloid transport by the arsenite efflux pump ArsB

توضح هذه الدراسة الأساس الهيكلي لتدفق الزرنيخيت من خلال تقديم بنيات مجهرية إلكترونية برديّة عالية الدقة لمضخة ArsB من بكتيريا *Leptospirillum ferriphilum*، كاشفةً عن هيئة مواجهة للداخل حيث يحدث ارتباط العناصر شبه المعدنية عبر الروابط الهيدروجينية ويكون مقترناً بنقل البروتونات عبر بقايا حمض الأسبارتيك المحفوظة.

Mahajan, S., Demirer, K., Clemons, W. M., Rees, D. C.2026-02-20
⚗️ biochemistry

PXL: a Nucleic Acid-Binding Module of Promyelocytic Leukemia Protein

تحدد هذه الدراسة وتصف بنيوياً وحدة فريدة لربط الأحماض النووية تسمى PXL داخل بروتين PML-1، مما يثبت ارتباطها الانتقائي بزخارف الحمض النووي الريبوزي والحمض النووي الديكسيروزي أحادية السلسلة والغنية بالجوانين، ودورها في تعديل النسخ الجيني لتنظيم التعبير الجيني والتنظيم النووي.

Fairchild, D., Semenova, I. V., Geddes-Buehre, D., Li, Y., Szczepaniak, R., Weller, S. K., Hao, B., Bezsonova, I.2026-02-20
⚗️ biochemistry

Mechanistic machine learning enables interpretable and generalizable prediction of prime editing outcomes

تقدم الورقة البحثية OptiPrime، وهو نموذج تعلم آلي ميكانيكي يحقق تنبؤاً ذا حالة فنية رائدة، وقابل للتفسير، وعام النطاق لنتائج التحرير عبر مختلف استراتيجيات التحرير وأنواع الخلايا، مما يتيح تصميم تعديلات علاجية فعالة مثل التصحيح في الجسم الحي لاضطراب عصبي في الفئران.

Hsu, A., Chen, P. J., Li, A. H., Hemez, C. F., Gao, X. D., Terrey, M., Nelson, C., Selvam, V., Cristian, A., McElroy, A. (…)2026-02-20
⚗️ biochemistry

Identification and characterization of bacterial repeat-in-toxin adhesins using long-read genome analysis

تستخدم هذه الدراسة تسلسل الجينوم طويل القراءة ونمذجة البنية باستخدام AlphaFold3 للتغلب على تحديات التجميع الناجمة عن التسلسلات المتكررة، حيث نجحت في تحديد وتوصيف 35 بروتينًا من بروتينات الالتصاق من نوع RTX عبر سبعة أنواع من البكتيريا سالبة الجرام لتوجيه الاستراتيجيات المستقبلية لمنع الاستعمار البكتيري والعدوى.

Hansen, T., Graham, L. A., Soares, B. P., Lee, D., Gagnon, J. R., Dykstra-MacPherson, T., Guo, S., Davies, P. L.2026-02-19
⚗️ biochemistry

A sequence-encoded promoter proximal super pause stabilizes an offline RNA polymerase II state

من خلال تطوير مقايسة GATO-seq واستخدام المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM)، تكشف هذه الدراسة أن تسلسلاً معيناً من الأحماض النووية يحفز حالة "توقف فائق" فريدة ومقاومة لعامل النسخ TFIIIS في إنزيم بلمرة الحمض النووي الريبي الثاني (RNA polymerase II)، مما يعمل على تثبيت حالة "انحراف مسار" (sidetracked) عكسية أحادية النيوكليوتيد ومتراجعة، وذلك عبر جيب مبطن بالثريونين، مما يثبت كيف يقوم التسلسل مباشرة بترميز التحكم في التوقف النسخي.

Vazquez Nunez, R. J., Kesha, S., Vos, S. M.2026-02-18
⚗️ biochemistry

Chemiluminescent probes allow for the rapid identification of colibactin-producing bacteria

تقدم هذه الدراسة مجسات كيميائية ضوئية عالية الحساسية وسريعة تستهدف إنزيم ClbP بشكل انتقائي، مما يتيح الكشف المباشر عن بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) المنتجة للكوليباكتين في عينات البراز المعقدة لتطبيقات في أبحاث السرطان والفحص السريري.

Aguilar Ramos, M., Gutkin, S., David, M., Shabat, D., Balskus, E. P.2026-02-17