433 ورقة بحثية
تكشف هذه الدراسة أن مسار polyA/polyQ في عامل النسخ العصبي Ascl1 يعمل كنموذج تنظيمي يعزز الارتباط غير النوعي بالحمض النووي (DNA) ويحفز التجمع من خلال تعديل المجموعة التشكيلية للبروتين، مما يوازن بين النشاط النسخي وتكاليف الذوبانية.
يقدم المؤلفون "ماء مارتيني الخفيف" (light Martini water)، وهو نموذج مائي منخفض اللزوجة بكتلة خرزات مخفضة يعمل على تسريع معدلات أخذ العينات بشكل كبير في محاكاة الديناميكا الجزيئية خشنة الحبيبات للبروتينات غير المنظمة ذاتياً والأغشية الليبيدية، مع الحفاظ على خصائص التوازن ودقة المحاكاة.
تقدم هذه الورقة إطار عمل للتعلم الذاتي الخاضع للإشراف يقوم برسم خرائط لتسلسلات الصور المشوشة إلى مفردات منفصلة من الحالات المحلية المتكررة وعلاقاتها الزمكانية دون الحاجة إلى قوالب محددة مسبقاً أو أهداف نظيفة، مما ينجح في استعادة الهياكل القابلة للتفسير في البيانات الاصطناعية، والبيانات المرجعية، والبيانات البيولوجية.
تقدم هذه الورقة منهجية تآزرية تجمع بين بيانات المكتبات المشفرة بالحمض النووي (DEL) التي تم التحقق منها تجريبياً وبين الذكاء الاصطناي التوليدي وفهارس المركبات الضخمة للغاية لتوسيع النتائج الأولية بسرعة إلى مركبات متنوعة، شبيهة بالأدوية، ومتاحة تجارياً، مما نجح في تحديد مثبطات جديدة لبروتين 53BP1 ذات خصائص محسنة مقارنة باختيار الـ DEL الأصلي.
تستخدم هذه الدراسة النمذجة التكاملية الموجهة بتقنية smFRET لتوضيح أن تكوين اتصال ثالثي بين حلقة GAAA والمستقبل يعتمد على أيونات المغنيسيوم (Mg2+) ويتضمن توازناً غير متجانس من المجموعات الفرعية المرتبطة وغير المرتبطة عند تركيزات الملح الفسيولوجية، مما يكشف عن مجموعات تشكيلية ديناميكية لا تستطيع البنى عالية الدقة الساكنة التقاطها.
تقدم هذه الورقة إطاراً منهجياً من الأسفل إلى الأعلى باستخدام مجهر SlimVar عالي السرعة ومجسات النقاط الكمومية للقياس الكمي للنقل الجزيئي داخل محاكيات غشاء حيوي أدنى محددة، مما يؤسس لسير عمل معياري يتغلب على التحديات البصرية والتحليلية لتتبع الجسيمات في بيئات الغشاء الحيوي الطبيعية المعقدة.
تكشف هذه الدراسة أن النطاق داخل الخلوي لبروتين PCDH15 CD2، والضروري للسمع، هو مادة متعددة الأملاح حمضية متوسعة وغير منظمة بنيوياً، ذات خصائص فيزيائية حيوية تشير إلى أنها تعمل كعنصر هيكلي مستجيب ميكانيكياً قد يساهم في نقل القوة والتكيف في عملية التحويل الميكانيكي السمعي.
تكشف دراسة مطيافية القوة أحادية الجزيء هذه أن بروتين طي "روسمان 2×2" (Ross) يصل إلى بنيته الأصلية عبر مسار صارم وعكوس حيث تتجمع وحدات طي تعاونية منفصلة (foldons) بشكل متسلسل، بدءاً من وحدة أولية تطوى ذاتياً وتوجه التنظيم اللاحق للوحدات الثانوية المعتمدة عليها.
تقدم هذه الورقة تقنية مجهر 2P-RESOLFT، وهي تقنية تستخدم الإثارة المدفوعة بالفوتون المزدوج والتبديل الضوئي العكوس لتحقيق تصوير فائق الدقة بدقة 205 نانومتر في عمق الأنسجة، مما كشف بنجاح عن بروزات غشائية لم تكن مرئية سابقاً في الجزر الكاذبة البنكرياسية.
تقدم هذه الورقة تقييم عام للمجتمع لعام 2026 لخوارزميات إعادة البناء غير المتجانسة (CAHRA)، وهو تحدٍ صُمم لتقييم طرق تحليل عدم التجانس في المجهر الإلكتروني برد (cryo-EM) باستخدام ثلاث مجموعات بيانات مرجعية جديدة تعالج عدم التجانس التركيبي، والتباين التشكلي المستمر، وتشابك الوضعية والتشكل.