⚛️ biophysics

Functional Differentiation of Type II and Type I Collagen Articular Models in Synovial Fluid Film Formation and Recombinant Lubricin Retention

تكشف هذه الدراسة أنه في حين أن الكولاجين من النوع الثاني يوفر بشكل فريد دعامة لأفلام السائل الزليلي الكاملة بينما لا يفعل الكولاجين من النوع الأول ذلك، فإن كلا النوعين من الكولاجين يرتبطان ويحتفظان باللوبريكين المُعاد تشكيله بشكل مماثل، مما يقدم رؤى بالغة الأهمية حول التدهور الميكانيكي للمفاصل المصابة بالفصال العظمي وإمكانات العلاجات القائمة على اللوبريكين.

Jaramillo Pinto, D. R., Mendoza, N. L., Ahmed, S. T., Wen, Y., Vitkova, L., Witt, S. M., Cutter, K. A., Honey, U., Pasze (…)2026-05-27
⚛️ biophysics

Single-molecule nanophotonic resolution of binding dynamics from apo to fully liganded for a cyclic nucleotide-gated ion channel in cell-derived vesicles

تستخدم هذه الدراسة أدلة موجية نانو-فوتونية من النمط الصفري لتحقيق دقة على مستوى الجزيء الواحد في رصد ديناميكيات الارتباط المتسلسل وحالات التشكيل البنيوي الوسيطة لقناة أيونية منظمة بالنيوكليوتيد الحلقي في حويصلات مشتقة من الخلايا، متجاوزةً بذلك قيود التركيز في المجهر التقليدي المحدود بالحيود للكشف عن آليات الارتباط التعاوني.

Haldar, T., Watson, D., Borghese, C. M., Ahmed, Z., Pena Palomino, P. A., Ressl, S., Brumback, A. C., Goldschen-Ohm, M. (…)2026-05-27
⚛️ biophysics

Modeling Reveals How Direct-Acting Antivirals Redirect HBV Capsid Assembly Pathways to Noninfectious Products

من خلال توسيع نموذج مونت كارلو الحركي لمحاكاة كيفية ارتباط مُعدِّلات تجميع القفيصة (CAMs) تفضيلياً بواجهات وحدات فرعية محددة، توضح هذه الدراسة الآليات الديناميكية الحرارية والحركية التي تعيد بها هذه مضادات الفيروسات توجيه تجميع قفيصة فيروس التهاب الكبد B نحو هياكل مشوهة وغير معدية، مما يساهم في تطوير علاجات لفيروس التهاب الكبد B واستراتيجيات التجميع الذاتي الأوسع نطاقاً.

Frechette, L. B., Pradhan, S., Mohajerani, F., Perez-Segura, C., Hadden-Perilla, J. A., Zlotnick, A., Hagan, M. F.2026-05-26
⚛️ biophysics

Nanometer-scale RNA protein clusters (RPCs) Foster Helicase Activity of DEAD-box eIF4A

تكشف هذه الدراسة أن هليكاز بدء الترجمة eIF4A يُشكّل عناقيد بروتينية-رنا (RPCs) بمقياس النانومتر مدفوعة بالتفاعلات متعددة التكافؤ لعامله المساعد eIF4B، وهو ميكانزم ضروري لتنسيق نشاط الهليكاز المعتمد على ATP وتنظيم بدء الترجمة.

Shweta, H., Sokabe, M., Villa, N., Fraser, C. S., Goldman, Y. E.2026-05-25
⚛️ biophysics

A unified ensemble-allosteric framework reconciles gain- and loss-of-function disease mutations in the IP3 receptor

تؤسس هذه الدراسة إطاراً موحداً للمجموعات والارتباط التفارغي يثبت أن الطفرات المسببة للأمراض في مستقبل (IP3) لا تسبب المرض عن طريق تعطيل البنية البروتينية الشاملة، بل عن طريق تغيير احتمالات المجموعة التشكيلية وتدفق المعلومات التفارغية لإنتاج أنماط ظواهر اكتساب أو فقدان الوظيفة.

Zhu, Y., Rahman, T.2026-05-24
⚛️ biophysics

Maintaining transcriptome solubility constrains mRNA sequence composition

تكشف هذه الدراسة أن التطور قد صاغ تسلسلات الحمض النووي الريبوزي المرسال (mRNA) لتقليل الارتباط الذاتي والحفاظ على ذوبانية النسخ المتعددة، مما يمنع التفاعلات العشوائية بين الحمض النووي الريبوزي التي قد تسبب تكتلاً واسع النطاق وغير وظيفي.

Todisco, M., Ausler, C., Jain, A.2026-05-22
⚛️ biophysics

Overcoming Preferred Orientation in Cryo-EM With Ultrasonic Excitation During Vitrification

تُثبت هذه الورقة أن التطبيق المستمر للتحفيز بالموجات فوق الصوتية أثناء عملية التزجيج يتغلب بفعالية على التوجه المفضل للجزيئات في المجهر الإلكتروني برد المبرد (cryo-EM) من خلال التعطيل الميكانيكي لامتزاز البروتين عند الواجهة بين الهواء والماء، مما يقدم حلاً بسيطاً وقابلاً للتطبيق على نطاق واسع لتحدٍ شائع في التصوير.

Williams, H. M., Curtis, W. A., Haubner, M., Hruby, J., Drabbels, M., Lorenz, U. J.2026-05-21
⚛️ biophysics

Energetic gradients emerge in developing motor-microtubule structures

تُظهر هذه الدراسة أن تجميع هياكل نجمية مرتبة من مخاليط غير مرتبة من الأنيبيبات الدقيقة ومحركات الكينيسين يُنتج تدرجات شعاعية مستمرة وطويلة الأمد في كثافة الـ ATP والمحركات، مما يكشف أن الحفاظ على هذه التدرجات المكانية للمحركات هو الطلب الطاقي المهيمن في مثل هذه الأنظمة الهيكلية الخلوية غير المتوازنة.

Duarte, A. I., Salmon, G. L., Lee, H. J., Najma, B., Ashok, M., Hirokawa, S., Postma, H. W. C., Banks, R. A., Thomson, M (…)2026-05-20
⚛️ biophysics

Mechanochemical Decoupling of ATP Hydrolysis and RNA Translocation in SARS-CoV-2 nsp13 by the L405D Mutation

تكشف هذه الدراسة أن الطفرة L405D في بروتين nsp13 الخاص بفيروس SARS-CoV-2 تفصل عملية تحلل الـ ATP عن انتقال الـ RNA عبر إعادة تشكيل المشهد التشكلي للبروتين للقضاء على التحولات الهيكلية الناجمة عن الاستحثاث، مما يؤدي إلى حبس الإنزيم في حالات غير منتجة وإضعاف دورته التحفيزية.

Fazelpour, E., Roy, P., Frederick, K., McCullagh, M.2026-05-20
⚛️ biophysics

AlphaFold3 predicted LWO G-protein complex from European robin features active-state biased Gα

تُقيّم هذه الدراسة نموذجين تم إنشاؤهما بواسطة AlphaFold3 لمعقد (LWO-G-protein) في طائر أبو الحناء الأوروبي، حيث كشفت أنه بينما يُظهر تنبؤ المعقد الكامل انحيازاً ذاتياً قوياً نحو الحالة النشطة مما قد يحد من قابليته للتفسير فيما يتعلق بآليات الإشارات، فإن التجميع الموجه بالقالب يقدم إطاراً هيكلياً أكثر حيادية لاستقصاء الاستقبال المغناطيسي لدى الطيور.

Hungerland, J., Kostritski, A., Koch, K.-W., Solov'yov, I.2026-05-20