🧬 biology

Structural variants contribute substantially to complex trait heritability

تقدم هذه الدراسة أداة MiXeR-SV لتوضيح أن المتغيرات الهيكلية، على الرغم من تشكيلها جزءًا ضئيلًا من المتغيرات الجينومية، تساهم بشكل كبير في توريث العديد من السمات المعقدة — لا سيلوما في المظاهر الدموية والأيضية والسرطانية — مما يساعد في سد الفجوة بين تقديرات التوريث القائمة على تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) وتقديرات التوائم.

Dat Thanh Nguyen, Alexey A. Shadrin, Nadine Parker, Julian Fuhrer, Nam S. Vo, Anders M. Dale, Ole A. Andreassen, Oleksan (…)2026-08-06
🧬 biology

RECIPE bridges transcriptomics and proteomics with deep graph learning on Ribo-seq data

تقدم الورقة البحثية RECIPE، وهو إطار عمل للشبكات العصبية الرسومية يستفيد من بيانات Ribo-seq أو البيانات النسخية المتكاملة مع شبكات التفاعل بين البروتينات للتنبؤ بدقة بوفرة البروتينات على مستوى البروتينوم، متجاوزاً بذلك بفعالية قيود قياسات البروتوميات غير المكتملة في كل من سياقات القياس الكلي والخلية الواحدة.

Jun Ding, Luying Su, Bowen Zhao, Kailu Song, Dingfeng Zou, Jingtao Wang, Ziyang Wang, Wei Liu, Xiuhui Yang, Qinghui Duan (…)2026-08-06
🧬 biology

Microbiome-to-Nigrostriatal Vulnerability Mapping Prioritizes SCFA-Linked Gut-Brain Axes in Parkinson’s Disease

تقدم الدراسة إطار عمل MiNi-PD لتحديد أولويات محاور الأمعاء والدماغ في مرض باركنسون، كاشفةً أن المستقلبات المرتبطة بالأحماض الدهنية قصيرة السلسلة، ولا سيما البوتيرات وحمض 3-إندول بروبيونيك، تتقارب عند الجين المضيف IL1B داخل المادة السوداء لتحديد آلية التهابية ذات دلالة بيولوجية.

Nabanita Ghosh2026-08-06
🧬 biology

Proton-coupled alternating access in a versatile mycobacterial Spns drug transporter

توضح هذه الدراسة التنوع الآلي لناقل MsSpns في المتفطرة من خلال بيان كيف تُمكّن التغيرات التشكيلية المدفوعة بالبرتنة والتفاعلات المتميزة مع الركائز طيّة Spns من تشغيل أنماط نقل متضادة، مما يسهل كلاً من طرد الكاتيونات المحبة للماء وامتصاص المركبات المحبة للدهون.

Reza Dastvan, Samantha Gies, Kevin Jagessar, Tianqi Wu, Ian Miller, Khadijeh Dastvan2026-08-06
🧬 biology

Genome-scale molecular profiling from routine histopathology with a multimodal pathology foundation model

تقدم الورقة البحثية "Fuji"، وهو نموذج تأسيسي متعدد الوسائط لعلم الأمراض تم تدريبه على أكثر من 60,000 صورة كاملة للشرائح مقترنة ببيانات جينومية، والذي ينجح في استنتاج الحالات الجزيئية على نطاق الجينوم، والعمليات الطفرية، والنتائج السريرية مباشرة من الأنسجة النسيجية الروتينية، مما يسد الفجوة بين شكل الأنسجة والآليات الجزيئية الكامنة وراءها.

Guangyu Wang, Qing Li, Jian Sang, Yiwei Xiao, Pengzhi Zhang, Weiqing Chen, Tu Tran, Zejuan Li, Shengyu Li, Tongwu Zhang2026-08-06
🧬 biology

Cardiolipin remodeling reflects mitochondrial reprogramming in clear cell renal cell carcinoma

تكشف هذه الدراسة أن سرطان الخلايا الكلوية الصافي يتميز بانخفاض كبير وإعادة تشكيل أكسدية للكارديوليبين، مما يعكس استنزافاً للميتوكوندريا وعدم كفاية في الزيادة التعويضية لإنزيم إعادة التشكيل TAZ، وهو ما يسلط الضوء مجتمعين على ثغرة استقلابية محتملة في هذا المرض.

Rento Ito, Renpei Kato, Ikarashi Daiki, Shigekatsu Maekawa, Mitsugu Kanehira, Yosuke Matsushita, Yosui Nojima, Kenji Miz (…)2026-08-06
🧬 biology

MIDLPred: Ensemble Learning for Phenotype-Oriented Classification of Male Infertility Candidate Proteins from Primary Amino Acid Sequences

تقدم هذه الدراسة إطار MIDLPred، وهو إطار تعلم تجميعي يستخدم شبكة عصبية تلافيفية أحادية الأبعاد لتصنيف البروتينات المرشحة لعقم الذكور بدقة إلى أربع فئات نمط ظاهري متميزة مباشرة من تسلسلات أحماضها الأمينية الأولية، مما يساعد الباحثين في تحديد أولويات الأهداف لمزيد من الاستقصاء.

Abdelhafedh BEN DAHMANE, Mustapha BENSAADA, Hamza CHEHILI, Salah eddine ALIOUANE, Mohamed Abdelhafid HAMIDECHI2026-08-05
🧬 biology

New records and phylogenetic placement of two soft coral species (Octocorallia: Malacalcyonacea: Cladiellidae) from the Gulf of Kachchh, India

تسجل هذه الدراسة أول توثيق لنوعين من المرجان الرخو، وهما *Cladiella pachyclados* و*Aldersladum sodwanum*، في خليج كوتش بالهند، باستخدام بيانات مورفولوجية وجزيئية مشتركة لتقديم تحديدات مؤقتة مع تسليط الضوء على الحاجة إلى مزيد من العمل التصنيفي التكاملي لحل الغموض في العلاقات الوراثية العرقية ودعم جهود الحفظ في هذا النظام البيئي المرجاني القاسي.

RETHNARAJ CHANDRAN, RENGAIYAN PERIASAMY, RAMASAMY SENTHIL KUMARAN, CHANDRASEKAR SURENDAR, DHRITI BANERJEE2026-08-05
🧬 biology

Initial Cell Number Regulates Microscale Community Assembly and Structure

تُظهر هذه الدراسة أن العدد الأولي للخلايا في التجمعات المجهرية للتربة هو محرك حاسم لتجمع المجتمعات الميكروبية، حيث ينظم تكوين الغشاء الحيوي، والسيادة التصنيفية، والتنوع، وشبكات الارتباط بطريقة تعتمد على مصدر الكربون.

Zhaoshuo Zhang, Chun-Hui Gao, Fangkui Wang, Jiliang Hu, Huan He, Yichao Wu, Chenchen Qu, Ke Dai, Qiaoyun Huang, Peng Cai2026-08-05
🧬 biology

Interpersonal autonomic coupling profiles distinguish social transmission from common-input synchrony

تُظهر هذه الدراسة أن الاقتران الذاتي الاتجاهي، ولا سيما الاقتران الودي من القائد إلى التابع، يمكنه تمييز الانتقال المتواسط اجتماعياً عن التزامن الناتج عن مدخلات مشتركة، مما يكشف أن التوافق الفسيولوجي بين الأشخاص يعتمد على القناة والسياق.

Martina De Marinis, Andrea Gargano, Francesco Bossi, Sergio Frumento, Alejandro Callara, Enzo Scilingo, Alberto Greco2026-08-05