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bioinformatics

1199 Arbeiten

Die Bioinformatik verbindet Biologie und Informatik, um riesige Mengen an biologischen Daten verständlich zu machen. Statt sich nur auf einzelne Experimente zu konzentrieren, nutzen Forscher hier computergestützte Methoden, um Muster im Leben selbst zu entschlüsseln, von der DNA bis zu komplexen Krankheitsverläufen. Diese Schnittstelle ermöglicht es, die Sprache des Lebens in Zahlen und Algorithmen zu übersetzen und neue Erkenntnisse schnell zu gewinnen.

Auf Gist.Science durchsuchen wir täglich die neuesten Vorab-Veröffentlichungen auf bioRxiv in diesem Bereich. Für jedes neu eingereichte Preprint erstellen wir nicht nur eine detaillierte technische Zusammenfassung für Fachleute, sondern auch eine einfache Erklärung in Alltagssprache, damit jeder den Kern der Forschung verstehen kann. So wird komplexes Wissen für ein breites Publikum zugänglich, ohne dass wichtige Details verloren gehen.

Unten finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Bioinformatik, die wir kürzlich für Sie aufbereitet haben.

💻 Bioinformatik

Deciphering the links between metabolism and health by building small-scale knowledge graphs: application to endometriosis and persistent pollutants

Die Studie stellt das Rechenframework Kg4j vor, das auf der großen Wissensgraph-Datenbank FORVM aufbaut, um kontextspezifische, kleine Teilgraphen zu generieren, die durch die Integration experimenteller Daten und die Validierung gegen wissenschaftliche Literatur neue Hypothesen über den Zusammenhang zwischen endokrinen Störungen durch persistente organische Schadstoffe und Endometriosis aufdecken.

Mathe, M., Laisney, G., Filangi, O., Giacomoni, F., Delmas, M., Cano-Sancho, G., Jourdan, F., Frainay, C.2026-03-04
💻 Bioinformatik

T cell-Macrophage Interactions Potentially Influence Chemotherapeutic Response in Ovarian Cancer Patients.

Die Studie zeigt, dass physikalische T-Zell-Makrophagen-Interaktionen im Ovarialkarzinom-Mikromilieu, die durch Doublets in scRNA-seq-Daten identifiziert wurden, die Therapieresistenz beeinflussen, indem Makrophagen des M2-Phänotyps bei resistenten Patienten T-Zell-Erschöpfung induzieren, während M1-polarisierte Makrophagen bei sensiblen Patienten mit nicht-erschöpften T-Zellen interagieren.

Hameed, S. A., kolch, W., Zhernovkov, V.2026-03-04
💻 Bioinformatik

Formalized scientific methodology enables rigorous AI-conducted research across domains

Die Autoren formalisieren die wissenschaftliche Methodik als ein phasengesteuertes, protokollbasiertes System, das es allgemeinen Sprachmodellen ermöglicht, durchgängig evidenzbasierte und überprüfbare Forschungsarbeiten in verschiedenen Domänen durchzuführen, wobei ein kontrollierter Vergleich die Vorteile dieser integritätsorientierten Einschränkungen gegenüber ungesteuerten Ansätzen belegt.

Zhang, Y., Zhao, J.2026-03-04
💻 Bioinformatik

PopGenAgent: Tool-Aware, Reproducible, Report-Oriented Workflows for Population Genomics

Das Paper stellt PopGenAgent vor, ein reproduzierbares, berichtorientiertes System, das kuratierte Populationsgenetik-Toolchains in validierte Vorlagen mit standardisierten I/O-Schnittstellen und vollständiger Provenienz erfasst, um manuelle Skriptierungsarbeit zu reduzieren und die End-zu-End-Replikation komplexer Analysen zu ermöglichen.

su, h., Long, W., Feng, J., Hou, Y., Zhang, Y.2026-03-04
💻 Bioinformatik

STCS: A Platform-Agnostic Framework for Cell-Level Reconstruction in Sequencing-Based Spatial Transcriptomics

STCS ist ein plattformunabhängiges Open-Source-Framework, das durch die Integration von Kernsegmentierung und einem kombinierten transkriptomisch-räumlichen Distanzmodell kohärente zelluläre Genexpressionsprofile aus hochauflösenden sequenzbasierten räumlichen Transkriptomdaten rekonstruiert und so eine zuverlässige zellbasierte Analyse ohne Referenzannotationen ermöglicht.

Chen Wu, L., Hu, X., Zhan, F., Sun, C., Gonzales, J., Ofer, R., Tran, T., Verzi, M. P., Liu, L., Yang, J.2026-03-03
💻 Bioinformatik

snputils: A High-Performance Python Library for Genetic Variation and Population Structure

Das Paper stellt snputils vor, eine hochleistungsfähige, modulare Python-Bibliothek, die die Verarbeitung, Analyse und Visualisierung genetischer Daten für populationsgenetische Studien und die Präzisionsmedizin in einem einzigen, effizienten Framework vereint und dabei bestehende Herausforderungen wie Formatinkompatibilitäten und Rechenineffizienzen löst.

Bonet, D., Comajoan Cara, M., Barrabes, M., Smeriglio, R., Agrawal, D., Aounallah, K., Geleta, M., Dominguez Mantes, A. (…)2026-03-03
💻 Bioinformatik

A comprehensive assessment of tandem repeat genotyping methods for Nanopore long-read genomes

Diese Studie bewertet sieben aktiv gepflegte Bioinformatik-Tools für die Genotypisierung von Tandemwiederholungen in Oxford-Nanopore-Daten umfassend hinsichtlich ihrer Sequenz- und Längengenauigkeit sowie ihrer praktischen Anwendbarkeit und kommt zu dem Schluss, dass keine einzelne Methode in allen Kategorien überlegen ist, wobei eine rein längenbasierte Bewertung die Leistung überschätzt und eine sequenzbasierte Analyse für klinische und populationsgenetische Anwendungen unerlässlich ist.

Aliyev, E., Avvaru, A., De Coster, W., Arner, G. M., Nyaga, D. M., Gibson, S. B., Weisburd, B., Gu, B., Gonzaga-Jauregui (…)2026-03-03