💻 Category

bioinformatics

1250 Arbeiten

Die Bioinformatik verbindet Biologie und Informatik, um riesige Mengen an biologischen Daten verständlich zu machen. Statt sich nur auf einzelne Experimente zu konzentrieren, nutzen Forscher hier computergestützte Methoden, um Muster im Leben selbst zu entschlüsseln, von der DNA bis zu komplexen Krankheitsverläufen. Diese Schnittstelle ermöglicht es, die Sprache des Lebens in Zahlen und Algorithmen zu übersetzen und neue Erkenntnisse schnell zu gewinnen.

Auf Gist.Science durchsuchen wir täglich die neuesten Vorab-Veröffentlichungen auf bioRxiv in diesem Bereich. Für jedes neu eingereichte Preprint erstellen wir nicht nur eine detaillierte technische Zusammenfassung für Fachleute, sondern auch eine einfache Erklärung in Alltagssprache, damit jeder den Kern der Forschung verstehen kann. So wird komplexes Wissen für ein breites Publikum zugänglich, ohne dass wichtige Details verloren gehen.

Unten finden Sie die aktuellsten Artikel aus dem Bereich der Bioinformatik, die wir kürzlich für Sie aufbereitet haben.

Universal physical principles govern the deterministic genesis of protein structure

Die Studie stellt mit dem ProtGenesis-Framework ein einheitliches mathematisches Modell vor, das die Entstehung von Proteinstrukturen als deterministischen, physikalisch gesteuerten Prozess beschreibt, der durch drei universelle Prinzipien – Assembly, Emergence und Phase-Transition – geleitet wird und somit eine interpretierbare Grundlage für das Verständnis biologischer Evolution sowie für die Deutung von Deep-Learning-Modellen schafft.

Chuanyang, L., Liu, J., Qiu, X., Wu, X., Li, W., Min, L., Zhang, G., Zhang, S., Zhu, L.2026-02-23💻 bioinformatics

SPrOUT: A computational and targeted sequencing approach for mixed plant DNA identification with Angiosperms353

Die Studie stellt SPrOUT vor, eine computergestützte und gezielte Sequenzierungsmethode unter Verwendung des Angiosperms353-Kits, die eine hochpräzise Identifizierung von Pflanzenarten in gemischten DNA-Proben ermöglicht und damit Anwendungen in der Ökologie, im Naturschutz und in der Lebensmittelsicherheit unterstützt.

Hu, N., Bullock, M. R., Jackson, C., Miller, C., Hunter, E., Huff, C., Chen, Y., Handy, S., Johnson, M.2026-02-23💻 bioinformatics

Comprehensive top-down mass spectral repository enables pan-dataset analysis and top-down spectral prediction

Die Studie stellt TopRepo vor, die erste umfassende Repository mit über 18 Millionen Top-Down-Massenspektren, die eine groß angelegte Pan-Datenanalyse von Proteoformen ermöglicht und die Genauigkeit von Identifizierungen sowie das Training von Deep-Learning-Modellen für die spektrale Vorhersage erheblich verbessert.

Li, K., Liu, K., Fulcher, J. M., Tang, H., Liu, X.2026-02-23💻 bioinformatics

CellAwareGNN: Single-Cell Enhanced Knowledge Graph Foundation Model for Drug Indication Prediction

Die Studie stellt CellAwareGNN vor, ein Graph-Foundation-Modell, das durch die Integration zellspezifischer genomischer Daten in den erweiterten Wissensgraphen scPrimeKG die Vorhersagegenauigkeit und biologische Interpretierbarkeit bei der Identifizierung neuer Arzneimittelindikationen, insbesondere für Autoimmunerkrankungen, signifikant verbessert.

Zhang, X., Jeong, E., Yan, C., Feng, Y., Lyu, L., Guo, X., Chen, Y.2026-02-23💻 bioinformatics

MetaTracer: A nucleotide alignment-based framework for high-resolution taxonomic and transcript assignment in metatranscriptomic data

MetaTracer ist ein auf Nukleotid-Alignment basierendes Open-Source-Framework, das Metatranskriptomdaten komplexer bakterieller Gemeinschaften präzise sowohl taxonomisch als auch auf Gen-Ebene analysiert und dabei artenspezifische Transkriptionsaktivitäten mit hoher Auflösung identifiziert.

Furstenau, T., Shaffer, I., Hsu, K.-L. C., Pearson, T., Ernst, R. K., Fofanov, V.2026-02-23💻 bioinformatics

What makes a banana false? How the genome of Ethiopian orphan staple Ensete ventricosum differs from the banana A and B sub-genomes

Diese Studie präsentiert eine hochqualitative *de-novo*-Genomsequenzierung der äthiopischen Ensete (*Ensete ventricosum*), die durch vergleichende Analysen mit Bananen-Genomen etwa 25 % artspezifische Gene aufdeckt und somit eine entscheidende Grundlage für die gezielte Züchtung dieser wichtigen Kulturpflanze schafft.

Muzemil, S., Paul, P., Baxter, L., Dominguez-Ferreras, A., Sahu, S. K., Van Deynze, A., Mai, G., Yemataw, Z., Tesfaye, K., Ntoukakis, V., Studholme, D. J., Grant, M.2026-02-23💻 bioinformatics

Hierarchical Multi-Omics Trajectory Prediction forFecal Microbiota Transplantation: A Novel MachineLearning Framework for Small-Sample LongitudinalMulti-Omics Integration

Die Studie stellt HMOTP vor, ein neuartiges maschinelles Lern-Framework, das durch hierarchische Merkmalskonstruktion, mehrstufige Aufmerksamkeitsmechanismen und patientenspezifische Trajektorienvorhersage mittels Transferlernen die Vorhersage von individuellen Verläufen bei der Fäkalmikrobiota-Transplantation auch bei kleinen Stichproben und longitudinalen Multi-Omics-Daten ermöglicht.

Zhou, Y.-H., Sun, G.2026-02-23💻 bioinformatics

Interpretable transcriptome-to-phenotype modeling of cell-painting nuclear morphology features from RNA-seq under low-dose radiation exposure

Diese Studie stellt einen interpretierbaren, zeitstratifizierten inversen Modellierungsrahmen vor, der RNA-Sequenzierungsdaten mit quantitativen Kernmorphologie-Veränderungen aus Cell-Painting-Bildern unter Niedrigstrahlung verbindet, um stabile transkriptomische Prädiktoren für langfristige zelluläre Reaktionen zu identifizieren.

Jantre, S., Chopra, K., Zhao, G., Cucinell, C., Weinberg, R., Forrester, S., Brettin, T., Urban, N. M., Qian, X., Yoon, B.-J.2026-02-23💻 bioinformatics