Per-residue optimisation of protein structures: Rapid alternative to optimisation with constrained alpha carbons
Die Autoren stellen PROPTIMUS RAPHAN vor, eine Methode zur per-residuenbasierten Optimierung von Proteinstrukturen, die durch die Zerlegung in überlappende Teilstrukturen eine lineare Skalierung der Rechenzeit ermöglicht und dabei Ergebnisse liefert, die mit der herkömmlichen Optimierung bei eingeschränkten Alpha-Kohlenstoffatomen vergleichbar sind, jedoch deutlich schneller erreicht werden.