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genomics

271 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

Atg8 orchestrates stress-responsive chromatin programs across immunity and metabolism

Diese Studie zeigt, dass das Autophagie-Protein Atg8/LC3 stressresponsive transkriptionelle Programme sowohl in der Immunität als auch im Stoffwechsel orchestriert, indem es über konservierte Motive direkt mit dem NF-κB-Transkriptionsfaktor Dif interagiert, um dessen nukleäre Akkumulation und Chromatinbesetzung zu regulieren, wodurch Zellen in der Lage sind, während einer Infektion und bei Nährstoffüberschuss die Abwehr und metabolische Anpassung zu koordinieren.

Kelly, K. P., Ramesh, N. A., Ranganathan, S., Madan, A., Marschall, S. N., Unckless, R., Rajan, A.2026-05-28🧬 genomics

PRISMA: A tensor-based framework for deconstructing the genetic architecture of complex diseases, with application to diabetic retinopathy

Die Studie stellt PRISMA vor, ein neuartiges tensorbasiertes Framework, das GWAS-Signale komplexer Erkrankungen durch die Integration von Zusammenfassungsstatistiken mit eQTL-Daten aus mehreren Geweben in gewebeaufgelöste genetische Trajektorien zerlegt und dabei erfolgreich distinkte vaskuläre, immunologische und neurodegenerative Achsen bei der diabetischen Retinopathie aufdeckt, die mit herkömmlichen Methoden nicht erfasst werden können.

Xiong, H., Xu, W., Ji, A., Zhong, L., Liu, S., Xie, Z., Yan, J., Wu, Z.2026-05-28🧬 genomics

Multi-omics data of a weedy coral species from Ulithi Atoll (Micronesia) to investigate the impact of human disturbance on coral health and resilience

Diese Studie stellt eine umfassende Multi-Omics-Ressource vor, die Daten der Ganzgenomsequenzierung, der Proteomik und der Metabolomik von drei Korallengattungen im Ulithi-Atoll umfasst, um die molekularen Mechanismen zu untersuchen, durch die menschliche Störungen die Gesundheit und Resilienz von Korallen beeinflussen.

Chille, E. E., Panayotakis, G. M., Stephens, T. G., Paddack, M., Crane, N. L., Bernardi, G., Rulmal, J., Bhattacharya, D.2026-05-26🧬 genomics

Population-scale transcriptomics reveals host genetic control of phyllosphere fungal communities

Diese Studie zeigt, dass standardmäßige polyA-angereicherte RNA-seq-Datensätze umgenutzt werden können, um metabolisch aktive Pilzgemeinschaften der Phyllosphäre quantitativ zu charakterisieren, und enthüllt eine weitverbreitete und biologisch strukturierte genetische Kontrolle durch den Wirt über diese mikrobiellen Assoziationen bei mehreren Kulturpflanzenarten.

Colvin, C., Chopra, S.2026-05-26🧬 genomics

Evaluation of Active Learning Selection Strategies and Characterization of Informative Sequences for Sequence-to-Expression Models

Diese Studie zeigt, dass aktives Lernen die Dateneffizienz von Sequenz-zu-Ausdruck-Modellen erheblich verbessert, indem es informative Sequenzen mit eindeutigen biologischen Signaturen identifiziert, und etabliert es somit als praktisches Werkzeug für die iterative Verfeinerung im Labor-in-the-Loop.

Qian, J., Rafi, A. M., Cazottes, E., de Boer, C.2026-05-26🧬 genomics

Pan-Cancer Genomic Scars of Alternative End Joining and Single-Strand Annealing

Diese Studie charakterisiert genomische Narben aus alternativem End-Joining und Single-Strand-Annealing systematisch über 2.157 Tumoren hinweg und zeigt, dass zwar alternativ End-Joining die vorherrschende Reparatur als Backup in homologer Rekombination-defizienten Krebsarten ist, beide Wege jedoch über HR-Defizienz hinaus aktiv sind und durch unterschiedliche lokale genomische und transkriptionelle Kontexte geprägt werden.

Modi, A. A., Zito, A., Parmigiani, G.2026-05-26🧬 genomics

Carbon: Decoding the Language of Life

Der Artikel stellt Carbon vor, eine Familie effizienter, domainspezifisch angepasster generativer DNA-Sprachmodelle, die eine nicht-überlappende 6-Mer-Tokenisierung und spezialisierte Trainingsziele nutzen, um eine wettbewerbsfähige Leistung und eine deutlich schnellere Inferenz im Vergleich zu bestehenden großskaligen genomischen Modellen zu erreichen und damit die Bedeutung einer Ausrichtung des Modelldesigns auf die einzigartigen statistischen und biologischen Eigenschaften der DNA unterstreichen.

Allal, L. B., Li, Q., Fiusco, M., Tunstall, L., Rasul, K., Beeching, E., Aubakirova, D., Patino, C., Frere, T., Lozhkov, A., Channing, G., Wolf, T., Bernardo, D. d., Werra, L. v.2026-05-25🧬 genomics

Interpreting the WaveSeekerNet model to reveal the evolution and biology of influenza A virus

Das WaveSeekerNet-Modell sagt die Wirtsherkunft von Influenza-A-Viren präzise voraus und zeigt unterschiedliche genomische Anpassungsmuster zwischen aviären und Säugetierwirten auf, wodurch ein quantitatives Rahmenwerk zur Bewertung des zoonotischen Risikos und zur Identifizierung Schlüsselnder adaptiver Mutationen bereitgestellt wird.

Nguyen, H.-H., Rudar, J., Mubareka, S., Lapen, D., Berhane, Y., Leung, C. K., Lung, O.2026-05-25🧬 genomics

Insertion sequence elements associated with Staphylococcus epidermidis evolution in persistent orthopaedic device-related infections

Diese Studie zeigt, dass zwar Insertionssequenz-(IS-)Elemente, insbesondere die IS256-Familie, während persistierender orthopädischer device-bezogener Infektionen eine signifikante genetische Diversifizierung bei *Staphylococcus epidermidis* vorantreiben, die hochgradige Multiresistenz und die Biofilmbildungsfähigkeiten der Stämme jedoch wahrscheinlich präexistente Merkmale epidemischer Klone und nicht Ergebnisse einer schnellen Anpassung innerhalb des Wirts sind.

Littlefair, J. C., Kobras, C. M., Post, V., Pascoe, B., Baker, D. J., Erichsen, C., Stracy, M., Moriarty, F., Sheppard, S. K.2026-05-24🧬 genomics