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genomics

418 Arbeiten

Die Genomik untersucht den kompletten Bauplan des Lebens, indem sie analysiert, wie Gene zusammenwirken und unser Erbgut gestaltet. Dieses faszinierende Feld geht weit über einfache DNA-Sequenzierung hinaus und beleuchtet, wie genetische Informationen unser Wohlbefinden, die Evolution und sogar die Entwicklung neuer Medikamente beeinflussen. Auf Gist.Science machen wir diese komplexen Zusammenhänge für alle verständlich, unabhängig vom wissenschaftlichen Hintergrund.

Alle Artikel in dieser Kategorie stammen direkt von bioRxiv, wo Forscher ihre neuesten Ergebnisse unverzüglich veröffentlichen. Unser Team verarbeitet jeden neuen Preprint aus diesem Bereich sorgfältig und erstellt sowohl leicht verständliche Zusammenfassungen als auch detaillierte technische Auswertungen. So bleiben Sie stets auf dem aktuellen Stand, ohne in Fachjargon zu versinken.

Im Folgenden finden Sie die neuesten Veröffentlichungen im Bereich der Genomik, die wir für Sie aufbereitet haben.

🧬 Genomik

A phylogenetic estimate of canine retrotransposition rates based on genome assembly comparisons

Diese Studie schätzt basierend auf dem Vergleich von Genomassemblierungen verschiedener Hunderassen, eines Dingos und eines Wolfes, dass die Rate neuer Retrotransposon-Einfügungen bei Hunden (1 pro 184 Geburten für LINE-1 und 1 pro 22 für SINEC) hoch ist und die beobachtete genetische Vielfalt vor allem auf eine lange Geschichte von Variationen zurückzuführen ist, wobei die SINEC-Rate etwa doppelt so hoch ist wie die von Alu-Elementen beim Menschen.

Blacksmith, M. S., Nguyen, A., Moran, J., Kidd, J. M.2026-02-20
🧬 Genomik

Differential chromatin accessibility between pre- and post-natal stages highlights putative causal regulatory variants in pig skeletal muscle

Diese Studie integriert ATAC-seq-, molQTL- und GWAS-Daten, um entwicklungsstadiumsspezifische regulatorische Varianten in der Schweinemuskulatur zu identifizieren, die zeigen, wie sich die chromatinzugänglichkeit von der fetalen zur postnatalen Phase verschiebt und damit kausale Mechanismen für agronomische Merkmale aufklärt.

Shishmani, E., Rau, A., Djebali, S., Clark, E. L., Estelle, J., Palombo, V., D'Andrea, M., Giuffra, E.2026-02-20
🧬 Genomik

Hookworm genomic diversity and population structure from accessible sample types: A validated approach to generate genome-wide polymorphism datasets from individual third-stage larvae

Die Studie validiert eine optimierte Methode zur Gewinnung genomweiter Polymorphismus-Datensätze aus einzelnen, schwer zugänglichen Hakenwurmlarven (L3) mittels Ganzgenom-Amplifikation und zeigt, dass damit die genetische Struktur und reduzierte Vielfalt von Laborstämmen im Vergleich zu Feldpopulationen von *Necator americanus* präzise analysiert werden kann.

Herzog, K. S., Randi, S., Osabutey, D., Paraggio, C., Bungiro, R., Harrison, L., Owusu, I. S. O., Appiah-Tsum, F., Lampt (…)2026-02-20
🧬 Genomik

Two domesticated species of rice shaped the population structure of Xanthomonas oryzae pv. oryzae in Africa

Die Studie zeigt, dass die Evolution und Populationsstruktur des afrikanischen Reisbläulkrankheitserregers (AfXoo) maßgeblich durch die Domestizierung des afrikanischen Reises (Oryza glaberrima) vor etwa 1000 Jahren und den späteren Anbau der asiatischen Reissorte (Oryza sativa) geprägt wurde, was zu einer einzigartigen phylogenetischen Gruppe mit spezifischen Anpassungen der TALE-Effektoren führte.

Quibod, I. L., Sciallano, C., Auguy, F., Brottier, L., Dereeper, A., Diagne, D., Diallo, A., Doucoure, H., Mayaki, S. I. (…)2026-02-20
🧬 Genomik

Conserved Human CpG Dinucleotides Identify Enriched Ageing-related Signals in Developmental Pathways and the Brain

Die Studie zeigt, dass ultra-konservierte CpG-Dinukleotide, die in genomweiten Daten fehlende Mutationen aufweisen, stark mit entwicklungsbiologischen und altersbedingten Signalen sowie Gehirn-exprimierten Genen verknüpft sind, was darauf hindeutet, dass funktionelle Komponenten der DNA-Methylierung im Alterungsprozess eng mit Entwicklungsmechanismen verwoben sind.

Christofidou, P., Bell, C. G.2026-02-20
🧬 Genomik

Lessons learned from manual curation of thousands of gene models in the nematode Pristionchus pacificus

Diese Studie zeigt, dass die manuelle Gemeinschaftskuration des Genoms von *Pristionchus pacificus* durch Integration neuer Transkriptomdaten über 7.500 Genmodelle korrigierte und dabei häufige Fehlerquellen wie Assemblierungsprobleme, künstliche Transkriptfusionen und Homologie-basierte Fehlerpropagation aufdeckte, was wertvolle Erkenntnisse für die zukünftige Genomannotation anderer Arten liefert.

Roedelsperger, C., Agyal, N., Quiobe, S. P., Wu, H., Ibarra-Morales, D., Sommer, R. J.2026-02-19