Bacterial Stress Responses Lower mRNA-Protein Level Correlations

Diese Studie integriert Transkriptomik- und Proteomikdaten dreier humaner Bakterienpathogene unter verschiedenen Infektionsstressbedingungen und zeigt, dass Umweltstress die Korrelation zwischen mRNA- und Proteinniveaus verringert, wobei essentielle Gene stabilere Korrelationen aufweisen und posttranskriptionelle Mechanismen eine entscheidende Rolle bei der bakteriellen Anpassung spielen.

Suer, S. G., Lim, Y. Y., Dhurve, G. + 5 more2026-03-13🦠 microbiology

Integrated epidemiological and genomic analysis of some respiratory Bovine Coronavirus isolates reveals circulation of GIIb strains and ongoing viral evolution in U.S. Cattle (2020-2025)

Diese Studie liefert integrierte epidemiologische und genomische Einblicke in die Zirkulation von GIIb-Stämmen des respiratorischen Rindercoronavirus in den USA zwischen 2020 und 2025, wobei eine hohe Prävalenz bei jungen Kälbern sowie eine anhaltende virale Evolution festgestellt wurde.

Shah, A. U., Varga, C., Guger, P. + 1 more2026-03-13🦠 microbiology

Comprehensive analysis of air and surface hospital microbiomes uncovers potential hotspots and avenues for transmission of diverse pathogens linked to hospital-acquired infections

Diese Studie nutzt eine optimierte Metagenomik-Methode auf Oxford Nanopore-Technologie-Basis, um in einem britischen Krankenhaus komplexe Luft- und Oberflächenmikrobiome zu analysieren und dabei kritische Krankheitserreger sowie deren Übertragungspotenzial und die Verbreitung von Antibiotikaresistenzgenen in Hochrisikobereichen aufzudecken.

Cambara, J. C. O., Previtali, O., Cuber, P. + 5 more2026-03-13🦠 microbiology

The Pseudogymnoascus destructans Proteome Under Copper Stress Conditions

Diese Studie charakterisiert die globale proteomische Anpassung des Pilzes *Pseudogymnoascus destructans* unter chronischem Kupfermangel- und -überschussstress, identifiziert hunderte differenziell exprimierte Proteine, die mit Kupferaufnahme, oxidativem Stress und mitochondrialer Funktion zusammenhängen, und validiert Antikörper zur Detektion dieser Stressantworten.

Friudenberg, A., Anne, S., Lu, Y. + 2 more2026-03-13🦠 microbiology

Abundance-activity decoupling in sulfur-cycling bacteria reflects viral infection types in meromictic lakes

Die Studie zeigt, dass in meromiktischen Seen die Entkopplung zwischen Häufigkeit und Aktivität von schwefelzyklischen Bakterien auf unterschiedliche Virusinfektionsstrategien zurückzuführen ist, bei denen temperierte Viren die hochaktiven Purpurschwefelbakterien und lytische Viren die weniger aktiven Grünschwefelbakterien infizieren.

Walker, J. R., Varona, N. S., Wallace, B. A. + 7 more2026-03-13🦠 microbiology

Antarctic marine microplastics reveals environmental persistence and rapid evolution of Candida auris

Diese Studie dokumentiert die erstmalige Isolierung des multiresistenten Pilzpathogens Candida auris in der Antarktis und zeigt, dass mutatorische Phänotypen mit erhöhten Mutationsraten für die schnelle Evolution, die Entstehung verschiedener genetischer Kladen und die Entwicklung von Arzneimittelresistenzen verantwortlich sind.

van Rhijn, N., Gan, E., Hepo-oja, P. + 16 more2026-03-13🦠 microbiology

Genomic streamlining of seagrass-associated Colletotrichum sp. may be related to its adaptation to a marine monocot host

Diese Studie präsentiert das hochkomplette Genom des seegrasassoziierten Pilzes *Colletotrichum* sp. CLE4 und deutet darauf hin, dass dessen genomische Strömung und spezialisierte Anpassung an den marinen Wirt *Zostera marina* eine evolutionäre Reaktion auf diese einzigartige ökologische Nische darstellen.

Ettinger, C. L., Eisen, J. A., Stajich, J. E.2026-03-12🦠 microbiology

Eukaryotic MAGs recovered from deep metagenomic sequencing of the seagrass, Zostera marina, include a novel chytrid in the order Lobulomycetales

Diese Studie rekonstruiert durch tiefgehende Metagenomsequenzierung von *Zostera marina* fünf eukaryotische MAGs, darunter einen neuartigen Chytrid der Ordnung Lobulomycetales, dessen Genomanalyse auf eine symbiotische Lebensweise mit dem Wirt hindeutet und somit das Verständnis der mikrobiellen Eukaryoten in Seegras-Ökosystemen erweitert.

Ettinger, C. L., Eisen, J. A., Stajich, J. E.2026-03-12🦠 microbiology

Integration of Bioinformatics and Machine Learning to Characterize Fusobacterium nucleatum's Pathogenicity

Diese Studie integriert Bioinformatik und maschinelles Lernen, um potenzielle Pathogenitätsinseln in *Fusobacterium nucleatum* zu identifizieren und eine mechanistische Hypothese zu formulieren, die hämolysinvermittelte Eisenakquisition über oxidativen Stress und die Modulation des Hippo-Signalwegs mit der Förderung von Krebs in Verbindung bringt.

Tian, Z., Lio, P.2026-03-12🦠 microbiology

Quantifying antibiotic susceptibility and inoculum effects using transient dynamics of Pseudomonas aeruginosa

Diese Studie entwickelt einen computergestützten Ansatz, der hochauflösende Zeitreihendaten von *Pseudomonas aeruginosa* nutzt, um durch Ableitungsanalyse und Clustering neue dynamische Modelle und Metriken zur Quantifizierung von Antibiotika-Wirkungen und Inokulum-Effekten zu erstellen, die über herkömmliche statische Messwerte hinausgehen.

Sundius, S. A., Farrell, J., Eick, K. L. + 2 more2026-03-12🦠 microbiology

A survey of bacterial and fungal communities of table olives.

Diese Studie charakterisiert die größte bisherige mikrobielle Vielfalt von Tafeloliven aus 363 Proben und zeigt, dass zwar die Fermentationsmethode (alkalische Behandlung versus natürliche Gärung) die Hauptstrukturierungsfaktoren sind, die hohe Variabilität innerhalb derselben Sorten und Produzenten jedoch eine zuverlässige Unterscheidung von geschützten Ursprungsbezeichnungen (PDO) mittels Amplicon-Sequenzierung verhindert, während gleichzeitig ein großes Potenzial für neue Starterkulturen identifiziert wird.

Parente, E., Pietrafesa, R., De Filippis, F. + 5 more2026-03-12🦠 microbiology

Pregnancy and Early-Life Gut Virome in the Lifelines NEXT cohort:Origin, Persistence, Influencing Factors and Health Implications

Diese Studie analysiert die Herkunft, Dynamik und gesundheitlichen Auswirkungen des frühen Darm-Viroms in der Lifelines NEXT-Kohorte und zeigt, dass die mütterliche Darmflora die primäre Virusquelle für Säuglinge ist, wobei Geburts- und Ernährungsmethoden die Entwicklung sowie die Entstehung von Nahrungsmittelallergien beeinflussen.

Fernandez-Pato, A., Gulyaeva, A., Kuzub, N. + 13 more2026-03-12🦠 microbiology

Limitations of inferring antiviral efficacy of interfering particles from observational natural histories

Diese Arbeit kritisiert die Schlussfolgerungen von Hariharan et al. zur therapeutischen Wirksamkeit von Interferenzpartikeln bei HIV, indem sie darlegt, dass beobachtete natürliche Verläufe keine validen Rückschlüsse auf die Interventionserfolge zulassen, die berichteten Basisreproduktionszahlen (R0) inkonsistent sind und alternative Mechanismen die Beobachtungen ausreichend erklären.

Khetan, N., Vasen, G., Smith, D. M. + 1 more2026-03-12🦠 microbiology