🧬 biology

Transmission Dynamics and Genomic Evolution of Monkeypox Virus in Nigeria Across Pre- and Post-COVID-19 Periods

Diese Studie analysiert 172 Affenpockenvirus-Sequenzen aus Nigeria, um aufzuzeigen, dass die Transmissionsdynamik des Virus primlich durch das Jahr der Isolation und weniger durch saisonale Faktoren getrieben wird, wobei die Klade IIb über die Vor-, während und nach der COVID-19-Periode hinweg persistiert hat, was die dringende Notwendigkeit einer standardisierten Überwachung und gezielter Interventionen unterstreicht.

Uwem Okon Edet, Kayode Abraham Olawuyi, Akaninyene Joseph, Md Zulfekar Ali, Okoroiwu Henshaw, Francisca Nwaokorie, Mesek (…)2026-07-09
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paRDal: Bioinformatics Framework for a Parallel RNA and DNA NGS Analysis in Hereditary Cancer Diagnostics

Das Paper stellt paRDal vor, ein containerisiertes Bioinformatik-Framework, das gematchte Keimbahn-DNA- und RNA-NGS-Daten integriert, um die hereditäre Krebsdiagnostik durch die Detektion von Spleiß- und Expressionsanomalien zu verbessern und dadurch die Varianteninterpretation sowie die diagnostische Ausbeute durch einen benutzerfreundlichen, evidenzbasierten Workflow zu steigern.

Kateřina Matějková, Petr Nehasil, Petra Kleiblová, Taťána Ptáčková, Marta Černá, Pavel Just, Ondřej Vít, Petra Zemánková (…)2026-07-09
🧬 biology

Biodiversity as the source of heterospecific social information: the effect on territory selection in the marsh warbler

Obwohl ein groß angelegtes Experiment zunächst nahelegte, dass heterospezifische soziale Informationen die Revierwahl von Teichsänger beeinflussen, offenbarte eine strenge Analyse unter Berücksichtigung der vorbestehenden räumlichen Verteilungen, dass deren Abundanz primär durch die Habitatstruktur und die lokale Artenvielfalt anstatt durch manipulierte akustische Signale getrieben wird.

Sylwia Pustkowiak, Zbigniew Kwieciński, Piotr Skórka2026-07-09
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Fungal–Fungal Interactions Drive Metabolic Reprogramming in Root-Associated Endophytes of Salvia abrotanoides

Diese Studie zeigt, dass pilzliche Interaktionen zwischen wurzelassoziierten Endophyten von *Salvia abrotanoides* eine metabolische Reprogrammierung vorantreiben, die zu einer differenziellen Regulation von Signalverbindungen und der Aktivierung stiller Biosynthesewege führt, welche neuartige Sekundärmetaboliten produzieren.

Yeganeh Teimoori-Boghsani, Ali Ganjeali, Gabriele Berg, Tomislav Cernava, Javad Asili, Fatemeh Masoudi-Khorasani, Nasrin (…)2026-07-09
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Diversity of microbiome associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella in North Sulawesi, Indonesia

Diese Studie nutzt die Full-Length-16S-rRNA-Sequenzierung, um aufzuzeigen, dass das bakterielle Mikrobiom der Ascidie *Lissoclinum patella* in Nord Sulawesi unterscheidbare, standort- und tiefenspezifische Gemeinschaftsstrukturen aufweist, wobei die flache Population der Insel Talise im Vergleich zu weniger diversen Gemeinschaften in tieferen und urbanisierten Gewässern die reichhaltigsten und vielfältigsten bakteriellen Konsortien beherbergt, die von *Hoeflea* dominiert werden.

Inneke Fenny Melke Rumengan, Robert A. Bara, Deiske Adeline Sumilat, Trezya Nilam Sari Pangemanan, Irene Shelyn Poluan (…)2026-07-09
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Response Surface Optimization of PEG-Mediated Precipitation for Efficient Recovery of ClearColi™ Outer Membrane Vesicles

Diese Studie zeigt, dass die mittels Response Surface Methodology optimierte Polyethylenglykol (PEG)-Präzipitation eine skalierbare, kosteneffiziente Alternative zur Ultrazentrifugation zur Gewinnung hochertragreicher, strukturell intakter Außenmembranvesikel aus ClearColi™ darstellt, wobei eine um 63,4 % höhere Proteinausbeute bei gleichzeitigem Erhalt der Vesikelintegrität erzielt wird.

shiva bayat, Seyed Latif Mousavi Gargari, Shahram Nazarian2026-07-09
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Local structure-activity landscape roughness detects the activity-cliff failure mode that standard QSAR reliability methods miss

Diese Arbeit führt ein verbindungsspezifisches Maß für die Rauheit der lokalen Struktur-Wirkungs-Landschaft ein, das erfolgreich Aktivitäts-Cliff-Ausfallmodi erkennt, die von Standard-QSAR-Zuverlässigkeitsmethoden übersehen werden, wodurch die Konstruktion kalibrierter konformer Prädiktoren ermöglicht wird, die selbst in Regionen, in denen traditionelle Modelle versagen, eine gültige Abdeckung aufrechterhalten.

Krishna Harish2026-07-09
🧬 biology

OTrack: A High-Throughput Organoid Detection and Tracking Framework Using Neighborhood-Guided Descriptors

OrTrack ist ein trainingsfreies Framework, das durch die Nutzung stabiler räumlicher Nachbarschaftsverteilungen anstelle der Abhängigkeit von morphologischen Merkmalen, die sich über die Zeit verändern, ein robustes Hochdurchsatz-Organoid-Tracking über lange Bildintervalle hinweg erreicht.

Binlin Chen, Jian Wang, Jiaqi He, Yuan Li, Jianfa Zhou, Linjie Guo, Haofeng Li, Liang Yang, Bohui Chen2026-07-09
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Prevalence, Virulence Gene Profiles, and Multidrug Resistance of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in Farmed Carp (Labeo rohita) from Punjab, Pakistan: Implications for Food Safety and One Health

Diese Studie zeigt eine signifikante Prävalenz von multiresistenten, Shiga-Toxin-produzierenden *E. coli* mit Virulenzgenen in gezüchtetem Karpfen und Wasser aus dem Punjab, Pakistan, auf, was dringende Lebensmittelsicherheitsrisiken sowie die Notwendigkeit eines verbesserten Antimikrobiellen Managements in der Aquakulturindustrie der Region verdeutlicht.

Talib Hussain, Fayyaz Rasool, Sarjito Sarjito, Shahid Mahmood, Aninditia Sabdaningsih, Agus Trianto, Shahid Sherzada2026-07-09