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1820 Arbeiten

🧬 biology

SSR marker-based genetic diversity and population structure of large-leaf tea germplasm across four major tea-producing regions of Yunnan, China

Diese Studie nutzte SSR-Marker zur Analyse von 216 Großblatttee-Akzessionen aus vier Regionen in Yunnan, wobei eine reiche genetische Diversität primär innerhalb der Populationen sowie eine schwache regionale Differenzierung aufgedeckt wurde, die durch extensiven Genfluss und historischen Austausch getrieben wurde, wodurch somit eine Grundlage für zukünftige Erhaltungs- und Züchtungsbemühungen geschaffen wurde.

Qihuan Ding, Wuxiang Fu, Ning Chi, Jianmei Su, Shanshan Wu, Zhanxia Ma2026-07-01
🧬 biology

GcQCR7 Mediates Pathogenicity via Maintaining Cell Wall Integrity and Enhancing Oxidative Stress Tolerance in Glomerella cingulata

Diese Studie zeigt, dass die mitochondriale Untereinheit GcQCR7 essenziell für die Pathogenität von *Glomerella cingulata* ist, indem sie die Zellwandintegrität, den Energiestoffwechsel und die Toleranz gegenüber oxidativem Stress aufrechterhält, wodurch sie als neuartiges Ziel für das Management der Glomerella-Blattfleckenkrankheit im Apfelanbau identifiziert wird.

Mingjuan Yang, Xinyue Cui, Shan Zhang, Fang Wang, Weichao Ren, Pingliang Li, Na Liu, Baohua Li, Chengying Jiang, Sen Lia (…)2026-07-01
🧬 biology

Mechanosensing at the endoplasmic reticulum by IRE1

Diese Studie identifiziert das endoplasmatische Retikulum als ein autonomes mechanosensitives Organell, in dem das Transmembranprotein IRE1 direkt die Membranspannung wahrnimmt, um die JNK-Signalkaskade auszulösen und die globale Proteinsynthese zu steigern, wodurch mechanische Kräfte unabhängig von seiner kanonischen Rolle bei der Unfolded Protein Response mit der Muskeladaptation verknüpft werden.

Hesso Farhan, Michaela Mayr, Luiz Garcia-Souza, Murphy McDermott, Utku Horzum, Yannick Frey, Margot Haun, Stephan Geley (…)2026-07-01
🧬 biology

Transglutaminase 2 contributes to the blood clotting cascade

Diese Studie stellt die lang gehegte Ansicht infrage, dass Faktor XIIIa die einzige Transglutaminase ist, die für die Gerinnungsstabilisierung verantwortlich ist, indem sie zeigt, dass auch die Gewebetransglutaminase (TG2) eine signifikante Rolle bei der Verstärkung von Blutgerinnseln und der Reduzierung der Fibrinolyse spielt.

Gerry Melino, Mauro Piacentini, N Mutch, Alessandro Mauriello, Manuel Scimeca, Mara Mancini, Valerio Da Ros, Francesco B (…)2026-07-01
🧬 biology

Shotgun-NF: A reproducible Nextflow pipeline for end-to-end shotgun metagenomics analysis

Shotgun-NF ist eine portable, modulare und reproduzierbare Nextflow-Pipeline, die eine umfassende Suite von Werkzeugen für die durchgängige Shotgun-Metagenomik-Analyse vereint, von rohen Sequenzierungsdaten bis hin zu vergleichenden Erkenntnissen auf Stammebene, während sie durch Containerisierung und automatisierte Provenienzverfolgung die Ausführungskonsistenz über verschiedene Rechenumgebungen hinweg sicherstellt.

Fereshteh Izadi, Sepideh Mofidifar, Emily A. Wasson, Carla S. Möller-Levet, André P. Gerber2026-07-01
🧬 biology

MLH1 −93G/A Polymorphism: Its Role in Colorectal Cancer Progression and Metastasis

Diese Studie berichtet über die erste Untersuchung in einer irakischen Population und stellt fest, dass der MLH1 −93G/A-Polymorphismus signifikant mit einer erhöhten Anfälligkeit für kolorektalen Krebs assoziiert ist und mit fortgeschrittener Krankheitsprogression, einschließlich höherer histologischer Grade, späteren TNM-Stadien und Lymphknotenmetastasen, korreliert.

Ali Alabedi, Rand Al- Husseini2026-07-01
🧬 biology

Predicting Microbiologically Influenced Corrosion Risk from Quorum Sensing Biofilm Community Features: A Random Forest-SHAP Approach

Diese Studie stellt ein Random-Forest-SHAP-Maschinenlern-Framework vor, das das Risiko mikrobiell beeinflusster Korrosion durch die Integration neuartiger Quorum-Sensing-Biofilm-Gemeinschaftsmerkmale mit traditionellen Umwelt- und mikrobiellen Parametern erfolgreich vorhersagt, dabei einen F1-Score von 0,762 erreicht und den prädiktiven Wert bakterieller Kommunikationssignale bei der Korrosionsbewertung aufzeigt.

Bipul Bhattarai, Naina Maharajan, Sulav Dahal2026-07-01
🧬 biology

AI-Based Pipeline for Vascularization Detection in Histological Images; low-cost solution Using Moderate Computing Resources

Dieses Paper präsentiert eine kostengünstige, benutzerfreundliche KI-Pipeline, die einfache Bildverarbeitung mit einer interaktiven, selbstlernenden Ähnlichkeitssuche kombiniert, um Pathologen zu ermöglichen, Vaskularisierung in histologischen Bildern unter Verwendung moderater Rechenressourcen und minimaler manueller Kennzeichnung schnell und genau zu detektieren.

Jan Žídek, Bretislav Lipový, Veronika Pavliňáková, Martin Knoz, Jakub Holoubek, David Izsák, Vladimir Váňa, Jan Herudek (…)2026-07-01
🧬 biology

Ecological Inference Is Structured Empirical Risk Minimization: Generalization Across Space, Nested Units, and Niche Support

Dieses Paper argumentiert, dass das häufige Scheitern geografischer Modelle bei der Generalisierung über Standorte hinweg auf eine fundamentale Estimanden-Diskrepanz in geschachtelten Umfragedaten zurückzuführen ist, indem es zeigt, dass ökologische Inferenz strukturell äquivalent zur empirischen Risikominimierung unter Domänen-Generalisierung ist und eine populationsbasierte Holdout-Validierung anstelle der standardmäßigen individuellen Kreuzvalidierung erfordert, um eine zuverlässige räumliche Übertragbarkeit zu gewährleisten.

R. Craig Stillwell2026-07-01
🧬 biology

BioGPT-ClinVar: Parameter-Efficient Fine-Tuning of a Biomedical LLM for Genomic Variant Interpretation

Diese Studie präsentiert BioGPT-ClinVar, ein Framework für das parametereffiziente Fine-Tuning unter Verwendung von Low-Rank Adaptation (LoRA), um das 150-Millionen-Parameter starke BioGPT-Modell für die Interpretation genomischer Varianten anzupassen, wobei eine effektive Konvergenz auf einem kuratierten ClinVar-Datensatz demonstriert wird, während gleichzeitig eine Open-Source-, reproduzierbare Pipeline für zukünftige klinische und Überwachungsanwendungen bereitgestellt wird.

Sepideh Moafi2026-07-01