Leveraging Phytolith Research using Artificial Intelligence

Die Studie stellt „Sorometry" vor, eine künstliche Intelligenz-basierte Pipeline, die durch die Kombination von 2D-Bild- und 3D-Punktwolkenanalyse sowie bayesscher Modellierung die manuelle Phytolithen-Analyse automatisiert, die Klassifizierungsgenauigkeit verbessert und die Rekonstruktion vergangener Vegetation auf ein „Omics"-Skalenniveau hebt.

Andrés G. Mejía Ramón, Kate Dudgeon, Nina Witteveen, Dolores Piperno, Michael Kloster, Luigi Palopoli, Mónica Moraes R., José M. Capriles, Umberto LombardoFri, 13 Ma🧬 q-bio

Nyxus: A Next Generation Image Feature Extraction Library for the Big Data and AI Era

Das Papier stellt Nyxus vor, eine neuartige, skalierbare Bibliothek zur effizienten Extraktion von Bildmerkmalen aus großen Datenmengen, die sowohl für 2D- als auch 3D-Daten optimiert ist und über flexible Schnittstellen für verschiedene Benutzergruppen sowie eine hohe Rechenleistung auf CPUs und GPUs verfügt.

Nicholas Schaub, Andriy Kharchenko, Hamdah Abbasi, Sameeul Samee, Hythem Sidky, Nathan HotalingFri, 13 Ma🧬 q-bio

Forecasting and predicting stochastic agent-based model data with biologically-informed neural networks

Diese Studie zeigt, dass biologisch informierte neuronale Netze (BINNs) genutzt werden können, um interpretierbare, von BINNs geleitete partielle Differentialgleichungsmodelle zu trainieren, die das Verhalten stochastischer agentenbasierter Modelle der kollektiven Migration sowohl für nicht gesehene räumliche Daten als auch für bisher unerforschte Parameterwerte genau vorhersagen und damit effiziente Datenanalysen ermöglichen.

John T. Nardini2026-03-11🧬 q-bio

Inferring the dynamics of quasi-reaction systems via nonlinear local mean-field approximations

Die Studie stellt eine neue Methode zur Parameterschätzung in stochastischen Quasi-Reaktionssystemen vor, die durch eine nichtlineare lokale Mittelwertnäherung und eine analytische Lösung der Hazard-Rate eine effizientere und robustere Schätzung kinetischer Raten ermöglicht, insbesondere bei großen Messintervallen und steifen biologischen Systemen.

Matteo Framba, Veronica Vinciotti, Ernst C. Wit2026-03-10🧬 q-bio