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🧬 biology

Computational Simulations of Trigger-and-Inhibit Control Rules in Intussusceptive Pillar Morphogenesis

Diese Studie nutzt numerische Strömungsmechanik, um zu demonstrieren, dass die Morphogenese der intussuszeptiven Säulen durch einen Trigger-und-Inhibitions-Mechanismus gesteuert wird, bei dem steile Gradienten der Wandschubspannung die Säulenbildung initiieren, während erhöhte absolute Wandschubspannungen diese unterdrücken, wodurch die räumliche Verteilung der Wandschubspannung als primärer Treiber des mikrovaskulären Remodellings definiert wird.

Nenad Filipovic, Akira Tsuda, Jennifer M. Pan, Jae Cho, Hassan A. Khalil, Maximilian Ackermann, Steven J. Mentzer2026-09-18
🧬 biology

Regulatory Evolution of TEM β-lactamases through Large-Scale Genomic Analysis Reveals Promoter Diversity and its Impact on β-lactam Resistance in Escherichia coli

Diese Studie integriert groß angelegte genomische Analysen von über 60.000 *Escherichia coli*-Genomen mit kausaler Inferenz und Strukturmodellierung, um zu zeigen, dass die Diversität in der *bla*<sub>TEM</sub>-Promotorregion, über Variationen in der kodierenden Sequenz hinausgehend, den β-Laktam-Resistenzphänotyp signifikant beeinflusst.

Srimathy Ramachandran, Snekha Arumugam Chandran, Suma Mohan S.2026-09-18
🧬 biology

spaGFM is a scalable graph foundation model for spatial transcriptomics analyses

Das Paper stellt spaGFM vor, ein skalierbares Graph-Foundation-Modell, das Random Walks und selbstüberwachtes Lernen nutzt, um robuste, transferierbare Repräsentationen von räumlichen Transkriptomdaten zu generieren, was die Analyse komplexer Gewebeorganisation und funktioneller Konsequenzen über verschiedene biologische Kontexte hinweg ermöglicht.

Juexin Wang, Yu Zhong, Fei He, Xiaojie Jin, Yang Yu, Ricardo Melo Ferreira, Andrew Gunderson, Jordan Krull, Guangyu Wang (…)2026-09-18
🧬 biology

Uncovering Anti-Cancer Potential of Clausena anisata Bioactives via Network Pharmacology-Based Target Prediction, Virtual Screening, Docking, ADMET Analysis, and Molecular Dynamics Simulation

Diese Studie nutzt einen integrierten netzwerkpharmakologischen und computergestützten Ansatz, um Anisolacton und Triphasiol aus *Clausena anisata* als vielversprechende, stabile und arzneistoffähnliche Leitstrukturen zu identifizieren, die EGFR für eine potenzielle antikanzerogene Therapie targetieren.

Priyanka Nath Mazumdar, Kaushik Kalita, Partha Pratim Dutta, Dhrubajyoti Gogoi, Nikhita Nina Bora, Manash Pratim Sarma2026-09-18
🧬 biology

Rethinking aerobic glucose metabolism in Saccharomyces cerevisiae: is glucose completely fermented to ethanol at high concentrations?

Diese Arbeit stellt die traditionelle Ansicht infrage, dass der aerobe Glukosestoffwechsel in *Saccharomyces cerevisiae* bei hohen Glukosekonzentrationen eine gleichzeitige direkte Respiration und Fermentation beinhaltet, schlägt stattdessen vor, dass Glukose zunächst vollständig zu Ethanol fermentiert wird, gefolgt von einer Ethanoloxidation, und skizziert ein quantitatives Isotopenverfolgungs-Experimentdesign, um diese Hypothese zu testen.

David Barreras Martínez2026-09-18
🧬 biology

An Immuno-informatics Pipeline for Identification of Low-Risk Peptide Immunotherapy Candidates Across the Childhood Food Allergy Triad

Diese Studie präsentiert eine integrierte Immunoinformatik-Pipeline, die erfolgreich 23 Niedrigrisiko-Peptidkandidaten für die Immuntherapie bei Erdnuss-, Milch- und Eiallergenen identifizierte, indem sie Sequenzen mit geringer HLA-Bindung und allergenem Potenzial computergestützt priorisierte, während sie den Ansatz gegen bestehende klinische Kandidaten validierte und die Notwendigkeit experimenteller Verifizierung hervorhob.

Aditya Narayan, Ruchi Jain, Manish Kumar2026-09-18
🧬 biology

CAST as a Tumor-Specific Suppressor in Colorectal Cancer: Discovery Through Integrative Analysis of Unannotated Isoforms, Proteomics, and Epigenetic Regulation

Durch eine integrative Analyse von Einzelzell-Long-Read-Sequenzierung, Proteomik und epigenetischen Daten identifiziert diese Studie CAST als einen tumorspezifischen Suppressor bei kolorektalem Karzinom, der durch Promotordemethylierung reaktiviert wird und durch die miR-200-Familie reguliert wird, wodurch ein verallgemeinerbares Framework für die Entdeckung therapeutischer Targets aus unannotierten Isoformen etabliert wird.

alireza ebadi, Maryam Hashemi2026-09-18
🧬 biology

A Computational Cancer GWAS Screen Highlights Structural Variation at the 7q22.1 Locus Near STAG3

Diese Studie zeigt, dass ein computergestütztes Screening, das Short-Read- und Long-Read-Sequenzierungsdaten integriert, eine signifikante Anreicherung von Strukturvarianten an meiosisspezifischen Genloci aufdeckt, die mit Krebs-GWAS-Signalen überlappen, wobei spezifisch eine neuartige 442 bp große Deletion nahe dem *STAG3*-Gen als ein Kandidatstreiber am 7q22.1-Kolorektalkrebs-Suszeptibilitätslocus identifiziert wurde, der durch Short-Read-Sequenzierung allein nicht hätte entdeckt werden können.

Koushik Chowdhury2026-09-18
🧬 biology

The Changing Landscape of Genetic Risk: Age-Related Effects of Polygenic Scores for Suicidal Behaviors

Diese Untersuchung der Add-Health-Kohorte zeigt, dass polygene Risiko-Scores für Suizidgedanken und Suizidversuche nur im jungen Erwachsenenalter und in der frühen mittleren Lebensphase moderate, aber signifikante Assoziationen mit den Ergebnissen aufweisen, statt in der Adoleszenz, was darauf hindeutet, dass aktuelle genetische Risikomodelle, die auf Daten von Erwachsenen basieren, entwicklungspezifische Risiken möglicherweise nicht erfassen, und die Notwendigkeit altersstratifizierter genomweiten Assoziationsstudien hervorhebt, um gezielte Präventionsstrategien zu verbessern.

Nathan Gillespie, Severine Lannoy, Mallory Stephenson, Robert Kirkpatrick, Zuriel Ceja, Miguel Renteria, Alexis C. Edwar (…)2026-09-17