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bioinformatics

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La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.

Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.

Modeling the organizational heterogeneity of lipid-enriched microdomains in the neuronal membranes of gray and white matter of Alzheimer brain: A computational lipidomics study

Este estudio computacional de lipidómica demuestra que las alteraciones lipídicas asociadas a la enfermedad de Alzheimer provocan un remodelado estructural y de microdominios más pronunciado en las membranas neuronales de la materia gris que en las de la materia blanca, estableciendo un marco para comprender cómo la composición lipídica afecta la homeostasis de las membranas cerebrales.

Peesapati, S., Chakraborty, S.2026-02-18💻 bioinformatics

Influence of molecular representation and charge on protein-ligand structural predictions by popular co-folding methods

Este estudio revela que el formato de entrada de los ligandos (CCD o SMILES) influye más en las predicciones estructurales de complejos proteína-ligando realizadas por algoritmos de IA populares (como AlphaFold 3 y Boltz-2) que su carga formal, lo que subraya la necesidad de estandarizar los formatos de entrada e incorporar la protonación en los pipelines de entrenamiento y predicción.

Bugrova, A., Orekhov, P., Gushchin, I.2026-02-18💻 bioinformatics

Information-Content-Informed Kendall-tau Correlation Methodology: Interpreting Missing Values in Metabolomics as Potentially Useful Information

Este artículo presenta la metodología ICI-Kt, un nuevo enfoque para calcular la correlación de Kendall-tau en datos de metabolómica que interpreta los valores faltantes por censura izquierda como información útil en lugar de ruido, mejorando así la detección de valores atípicos y la construcción de redes de características.

Flight, R. M., Bhatt, P. S., Moseley, H. N. B.2026-02-17💻 bioinformatics

hoodscanR: profiling single-cell neighborhoods in spatial transcriptomics data

El paquete Bioconductor hoodscanR permite la identificación precisa de vecindarios celulares y el perfilado de cambios transcripcionales en células tumorales dentro de contextos espaciales, facilitando el estudio de mecanismos de enfermedades como el cáncer de mama y de pulmón.

Liu, N., Martin, J., Bhuva, D. D., Chen, J., Li, M., Lee, S. C., Kharbanda, M., Cheng, J., Mohamed, A., Kulasinghe, A., Chen, Y., Tan, C. W., Li, F., Polo, J. M., Davis, M. J.2026-02-17💻 bioinformatics

ProteomeLM: A proteome-scale language model enables accurate and rapid prediction of protein-protein interactions and gene essentiality across taxa

El artículo presenta ProteomeLM, un modelo de lenguaje a escala proteómica que, al procesar proteomas completos de diversas especies, permite predecir con alta precisión y rapidez las interacciones proteína-proteína y la esencialidad génica, superando a los métodos basados en coevolución de secuencias.

Malbranke, C., Zalaffi, G. P., Bitbol, A.-F.2026-02-17💻 bioinformatics

ConNIS and labeling instability: new statistical methods for improving the detection of essential genes in TraDIS libraries

Este artículo presenta ConNIS, un nuevo método estadístico y un enfoque basado en la inestabilidad de submuestras que mejoran la detección precisa de genes esenciales en bibliotecas TraDIS, especialmente en escenarios de baja densidad de inserción, superando a los métodos existentes y ofreciendo herramientas de software accesibles para su aplicación.

Hanke, M., Harten, T., Foraita, R.2026-02-17💻 bioinformatics

Compressed inverted indexes for scalable sequence similarity

El artículo presenta Onika, un sistema de código abierto en Rust que utiliza índices invertidos comprimidos y esquemas de poda temprana para realizar búsquedas de similitud de secuencias a gran escala de manera más eficiente en tiempo y memoria que las herramientas actuales, manteniendo la sensibilidad y la precisión en la comparación de colecciones masivas de genomas.

Ingels, F., Vandamme, L., Girard, M., Agret, C., Cazaux, B., Limasset, A.2026-02-17💻 bioinformatics

Minimizer Density revisited: Models and Multiminimizers

Este trabajo revisa el concepto de densidad en los esquemas de minimizadores para el análisis de secuencias, proponiendo un nuevo modelo probabilístico, introduciendo la técnica de "multiminimizadores" para reducir la densidad y la densidad deduplicada, y demostrando su eficiencia mediante una implementación en Rust que mejora el rendimiento en tareas de bioinformática.

Ingels, F., Robidou, L., Martayan, I., Marchet, C., Limasset, A.2026-02-17💻 bioinformatics