bioinformatics artículos

La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.

Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.

ChatDIA: A zero-shot large language model workflow for targeted analysis of data-independent acquisition mass spectrometry data

El estudio presenta ChatDIA, un flujo de trabajo basado en modelos de lenguaje grandes de propósito general que, mediante razonamiento en configuración *zero-shot*, automatiza el análisis de datos de adquisición independiente de datos (DIA) en proteómica con una precisión competitiva respecto al software especializado y ofrece justificaciones interpretables para la validación interactiva.

Li, J., Charkow, J., Gao, M., Li, J., Rost, H.2026-02-13💻 bioinformatics

LineageSim: A Single-Cell Lineage Simulator with Fate-Aware Gene Expression

El artículo presenta LineageSim, un marco generativo que supera las limitaciones de los simuladores existentes al incorporar expresiones génicas conscientes del destino celular, permitiendo así la creación de datos de línea celular con señales temporales latentes esenciales para validar y entrenar métodos computacionales de predicción de destinos celulares.

Lai, H., Sadria, M.2026-02-12💻 bioinformatics

GeneReL: A Large Language Model-Powered Platform for Gene Regulatory Relationship Extraction with Community Curation

GeneReL es una plataforma integrada que utiliza modelos de lenguaje de gran tamaño (LLM) y curación comunitaria para extraer y validar redes de regulación génica en *Arabidopsis thaliana* a partir de la literatura científica.

Park, J.-S., Ha, S., Lee, Y., Kang, Y. J.2026-02-12💻 bioinformatics

tensorOmics: Data integration for longitudinal omics data using tensor factorisation

**tensorOmics** es un nuevo marco computacional basado en la factorización de tensores que permite integrar y analizar datos multiómicos longitudinales, preservando su estructura temporal y permitiendo tanto el análisis exploratorio como el supervisado para identificar respuestas moleculares coordinadas a lo largo del tiempo.

Kodikara, S., Lu, B., Wang, S., Le Cao, K.-A.2026-02-12💻 bioinformatics

Spatiotemporal cell type deconvolution leveraging tissue structure

SpaDecoder es un nuevo método de deconvolución de tipos celulares para transcriptómica espacial que mejora la precisión al aprovechar la estructura tridimensional del tejido mediante un núcleo gaussiano adaptativo y al integrar perfiles de referencia de scRNA-seq.

Lobo, M. M., Zhang, Z., Zhang, X.2026-02-12💻 bioinformatics

miRXplain: explainable isomiR-aware microRNA target prediction using CLIP-L experiments and hybrid attention transformers

Los autores presentan miRXplain, un modelo de transformador con atención híbrida que predice interacciones entre microARN e isomiRs y sus genes diana utilizando datos de CLIP-L, superando a los métodos actuales con mayor eficiencia y proporcionando explicaciones biológicas sobre la importancia de las variantes de secuencia.

Maji, R. K., Cantini, G., Cheng, H., Marsico, A., Schulz, M. H.2026-02-12💻 bioinformatics

Taxonomy-aware, disorder-matched benchmarking of phase-separating protein predictors

Este estudio propone un nuevo marco de evaluación para los predictores de proteínas con separación de fases, el cual mitiga sesgos taxonómicos y de desorden intrínseco para permitir una medición más precisa y justa de su capacidad de generalización.

Hou, S., Shen, H., Zhang, Y.2026-02-12💻 bioinformatics

Prediction of Antibody Non-Specificity using Protein Language Models and Biophysical Parameters

Este estudio demuestra que la falta de especificidad de los anticuerpos puede predecirse eficazmente mediante el uso de modelos de lenguaje de proteínas y descriptores biofísicos, identificando el punto isoeléctrico como un factor clave y destacando el potencial de los modelos de lenguaje para optimizar el desarrollo de terapias anticuerpos.

Sakhnini, L. I., Beltrame, L., Fulle, S., Sormanni, P., Henriksen, A., Lorenzen, N., Vendruscolo, M., Granata, D.2026-02-11💻 bioinformatics

Cigarette smoke induces colon cancer by regulating the gut microbiota and related metabolites

El tabaquismo aumenta el riesgo de cáncer colorrectal al inducir la disbiosis de la microbiota intestinal, alterar los metabolitos y suprimir genes supresores de tumores, especialmente el CPT2.

Li, W., Bao, Y.-n., Zhao, Q., Yang, X., Gong, Y., Gan, B.2026-02-11💻 bioinformatics

A global survey of System Biology-based predictions of gene-rare disease associations to enhance new diagnoses

Este estudio propone un nuevo método de puntuación de especificidad gen-enfermedad basado en un análisis global de redes funcionales para mejorar la priorización de variantes genéticas y facilitar el diagnóstico de enfermedades raras.

Benitez, Y., Uria-Regojo, G., Minguez, P.2026-02-11💻 bioinformatics

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