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1018 artículos

La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.

Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.

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Keloid transcriptomics reveal heterogeneity in fibroblast subtype enrichment, gene expression, and immune cell responses

Este estudio utiliza el análisis de RNA-Seq masivo de tejidos de queloide y de piel normal emparejada para demostrar que tener en cuenta la heterogeneidad de los tipos celulares revela diferencias distintivas en el enriquecimiento de fibroblastos y células inmunitarias, sus interacciones específicas y las firmas clave de expresión génica que subyacen a la enfermedad de queloide.

Panzer, J. J., Pan, M., Nair, M., Loveless, I. M., Adrianto, I., Huang, L., Chitale, D., Francescone, R., Vendramini-Cos (…)2026-09-07
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PharmCast: rapid generation of three-dimensional pharmacophore fingerprints from two-dimensional structure without conformer generation

PharmCast es una red neuronal de alimentación hacia adelante que predice rápida y precisamente huellas dactilares de farmacóforos 3D directamente a partir de cadenas SMILES 2D sin generación de conformeros, permitiendo un cribado virtual y un salto de andamiaje eficientes a una fracción del costo computacional de los métodos tradicionales.

Muskal, S. M., McGregor, M. J.2026-09-07
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Trustworthy ML/AI for Aging Clocks: Preventing Systematic Prediction Bias in Biological Age Estimation

Este artículo identifica y aborda el problema crítico del sesgo de predicción sistemático en los relojes de envejecimiento basados en aprendizaje automático, el cual puede distorsionar los análisis de asociación derivados, mediante la propuesta de un marco de optimización restringida para asegurar una estimación e inferencia de la edad biológica válidas.

Lee, H., Ye, Z., Yang, Y., Pan, Y., Maron, B., Wang, Z., Kochunov, P., Thompson, P., Hong, L. E., MA, T., Chen, C., Chen (…)2026-09-06
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RevPert: predicting candidate drivers of transcriptomic state transitions via gallery-native reverse perturbation

RevPert es un modelo de perturbación inversa nativo de la galería que prioriza los candidatos a impulsores genéticos de las transiciones de estado transcriptómico mediante la combinación de conectividad de Pearson con signo y un residuo aprendido, demostrando un rendimiento superior en la recuperación de intervenciones retenidas y en la identificación de anclajes relevantes para enfermedades en comparación con las líneas base existentes.

Liang, S., Yang, C., Wang, J., Li, y.2026-09-06
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Coarse composition suffices: tabular in-context learning for multi-activity antimicrobial peptide profiling

Este artículo demuestra que un flujo de trabajo simple, basado únicamente en secuencias, que combina 330 descriptores interpretables con el modelo fundacional TabPFN, supera a los enfoques de aprendizaje profundo complejos y condicionados por la estructura en el perfilado de péptidos antimicrobianos multietiqueta en el benchmark ESCAPE, logrando una precisión de vanguardia sin la necesidad de entrenamiento basado en gradientes o datos estructurales.

Pal, A., Kumar, R., Solanki, D., Pareek, P., Singh, J., Singla, J.2026-09-06
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Covariance Nonstationarity is Evident in Spatial Transcriptomics and Provides a New Categorization of Spatially Varying Genes

Este estudio demuestra que la no estacionariedad de la covarianza es una característica prevalente y biológicamente significativa en la transcriptómica espacial que viola los supuestos comunes de los procesos gaussianos, lo que requiere una reevaluación de cómo se caracterizan y categorizan los genes que varían espacialmente.

Velidi, P., Wei, Z., Nathoo, F.2026-09-05
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Comparing phenotypic manifolds with Kompot: Cluster-free differential expression at single-cell resolution

El artículo presenta Kompot, un marco estadístico libre de agrupamiento que permite el análisis comparativo de datos multicondición con resolución de célula única al modelar la densidad celular y la expresión génica como funciones continuas para detectar tanto la abundancia diferencial como los cambios transcripcionales localizados y heterogéneos sin depender de tipos celulares predefinidos.

Otto, D. J., Arriaga-Gomez, E., Thieme, E., Yang, R., Lee, S. C., Setty, M.2026-09-04
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Probing the transcriptome response to shivering in skeletal muscle using a multilayered bioinformatics approach

Este estudio utiliza un enfoque bioinformático multicapa para caracterizar la robusta firma transcripcional específica del sexo del músculo esquelético humano en respuesta a escalofríos repetidos, revelando cómo estas adaptaciones moleculares disminuyen con la aclimatación al frío y ofreciendo nuevas perspectivas mecánicas sobre la mejora de la salud metabólica.

Kalkhoven, E., Baak, R. E., Hooiveld, G. J. E. J., Schrauwen, P., Hoeks, J., Raymakers, R., van der Stolpe, A., Kersten (…)2026-09-04
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Experimental and In Silico Analysis of the Structural Dynamics of Dengue NS2B-NS3 Protease

Este estudio integra análisis biofísicos experimentales y simulaciones computacionales para caracterizar la dinámica estructural dependiente del pH y la plasticidad conformacional de la proteasa NS2B-NS3 del virus del dengue, proporcionando información crítica para el diseño racional de inhibidores antivirales específicos de pH.

Muthuvel, s. k., BALAKRISHNAN, S. S., MANJINI, S., DHAL, K., DAS, S., S, D.2026-09-04