La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.

Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.

💻 bioinformática

CatIF-RL: Activity-Oriented Enzyme Sequence Design by Steered Inverse Protein Folding

CatIF-RL es un marco novedoso que mejora la actividad catalítica de las enzimas guiando un modelo de plegamiento inverso de difusión de eliminación de ruido basado en grafos hacia valores de kcat predichos más altos mediante señales de preferencia orientadas a la actividad y optimización de políticas relativas a grupos, al tiempo que mantiene la fidelidad estructural y la compatibilidad de secuencia.

Li, Y., Xiong, J., Zhang, Y., Cai, T., Fu, C., Li, S., Xu, W., Lyu, R., Chen, Z., Guo, Z., Gong, X., Wang, F.2026-05-18
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BiomniBench: Process-level Evaluation of LLM Agents for Real-world Biomedical Research

El artículo presenta BiomniBench, un nuevo marco de evaluación a nivel de proceso que evalúa a los agentes de LLM en tareas de investigación biomédica del mundo real mediante rúbricas diseñadas por expertos para superar las limitaciones de los puntos de referencia basados únicamente en resultados y revelar fallos críticos en el razonamiento y la selección de métodos.

Qu, Y., Lu, Y., Tu, X., Zhang, S., She, T., Shaw, A. G., Shih, J.-H., Zhao, B., Shen, M., Yang, H., Yan, J., Zhang, R. (…)2026-05-18
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Elab2ARC: A Browser-Based Workspace for Converting Free-Text Protocols into rich FAIR digital objects

elab2ARC es un espacio de trabajo basado en el navegador y del lado del cliente que automatiza la conversión de registros de cuaderno de laboratorio electrónico eLabFTW en texto libre a Contextos de Investigación Anotados (ARC) compatibles con FAIR y con control de versiones, para facilitar el intercambio y la archivación sin interrumpir los flujos de trabajo diarios del laboratorio.

Zander, S., Zhou, X.-R., Kranz, A., Dumschott, K., Rocca-Serra, P., Weil, H. L., Tschoepke, M., Muehlhaus, T., Von Sucho (…)2026-05-18
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Metabarcode and transcriptome datasets of Pinus sylvestris to assess fungal phyllosphere and disease dynamics.

Este trabajo presenta un conjunto de datos exhaustivo de perfiles de metabarcado de ITS2 y de secuenciación de ARN de 200 y 48 genotipos de *Pinus sylvestris*, respectivamente, para investigar cómo el genotipo del hospedador influye en las comunidades fúngicas foliares y la susceptibilidad a enfermedades en el contexto de la mancha roja del pino.

Moore, B., Perry, A., Kaur, S., Crampton, B., Gurung, A., Beaton, J., Smith, V. A., Morris, J., Hedley, P. E., Nemeth, K (…)2026-05-18
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Mantis-Delta: Mass-Action Network Theory and Steady-State Characterization for Chemical Reaction Networks

El artículo presenta mantis-delta, una biblioteca de Python de código abierto que integra el análisis estructural de la Teoría de Redes de Reacciones Químicas (CRNT) con la generación simbólica de EDOs y solucionadores numéricos híbridos para caracterizar rigurosamente los estados estacionarios, la estabilidad y las bifurcaciones en sistemas de acción de masas sin depender exclusivamente de la simulación.

Venegas Hernandez, E. A.2026-05-18
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Combining amino acid frequency and 1D convolutional neural network embeddings for the identification of protein-protein interactions using a random forest classifier

Este estudio propone un marco de dos etapas que combina características de frecuencia de aminoácidos con representaciones latentes aprendidas por un autoencoder de red neuronal convolucional unidimensional, demostrando que un clasificador de bosque aleatorio entrenado con este conjunto híbrido de características mejora significativamente la precisión de la predicción de interacciones proteína-proteína en comparación con el uso exclusivo de características de frecuencia.

Sindhi, N. A., Pawar, N., Dixson, J., Garcia, D.2026-05-18
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Genome-wide computational prediction of miRNAs encoded by influenza A virus (H3N2) predicts target genes involved in pulmonary and antiviral innate immunity

Este estudio emplea un pipeline computacional de genoma completo para predecir los miARN codificados por el virus de la influenza A (H3N2) y sus genes diana, revelando una red de genes del huésped implicados en la inmunidad innata pulmonar y antiviral que podría aclarar la patogénesis viral y sugerir dianas terapéuticas.

Siddiqi, M. A., Kumar, H., Mazumder, M.2026-05-18
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KaryoScope: rapid, alignment-free sequence annotation for the pangenome era

KaryoScope es una herramienta rápida y sin alineamiento que permite la anotación a resolución de bases de diversas características genómicas en ensamblajes completos de pan-genomas en minutos, caracterizando eficazmente regiones variables previamente inaccesibles como los centrómeros y los subtelómeros para apoyar el análisis comparativo y clínico.

Ranallo-Benavidez, T. R., Chen, Y.-A., Potapova, T. A., Alanko, J. N., Loucks, H., Lucas, J., Human Pangenome Reference (…)2026-05-17