1210 artículos
La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.
Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.
Los autores desarrollaron un marco de integración basado en redes que utiliza la direccionalidad de los cambios diferenciales para combinar perfiles proteómicos heterogéneos, revelando así relaciones biológicas significativas como la agrupación de perfiles de cáncer de mama alrededor de un perfil de tratamiento con doxorrubicina y su asociación con la etapa tumoral.
BioEngine es una capa de ejecución y adaptación que permite a los biólogos ejecutar, ajustar y desplegar modelos de IA para imágenes biológicas en diversos entornos de hardware mediante instrucciones simples dirigidas a un agente de inteligencia artificial.
Este artículo presenta un agente automatizado de búsqueda de políticas que supera a los métodos tradicionales de priorización de candidatos a fármacos peptídicos, logrando identificar un 65% de las mejores opciones en su lista de 20 frente al 44% de NSGA-II mediante un marco de evaluación público y código abierto.
Los autores presentan RepurAgent, un sistema de IA agéntica supervisada por humanos que abarca todo el ciclo de vida del reposicionamiento de fármacos, desde la generación de hipótesis hasta el análisis experimental, demostrando su eficacia en casos de estudio sobre leucemia mieloide aguda, COVID-19 y deficiencia de sulfatasas múltiples.
El artículo presenta Surleton, un marco de aprendizaje profundo que mejora el plegamiento inverso de proteínas al modelar conjuntamente la geometría del esqueleto y la organización de la superficie, logrando una mayor recuperación de secuencias y precisión, especialmente en residuos expuestos.
Este estudio utiliza un enfoque filogenético comparativo para identificar patrones de conservación evolutiva y descubrir nuevos genes implicados en la diferenciación de bradizoítos en *Toxoplasma gondii*, revelando que este proceso combina vías altamente conservadas con otras específicas de la formación de quistes.
El artículo presenta HMCVelo, el primer modelo determinista basado en ecuaciones diferenciales ordinarias que utiliza datos de secuenciación conjunta de 5hmC y 5mC a nivel de célula única para inferir con alta precisión las trayectorias temporales de la dinámica de metilación del ADN en células corticales murinas, superando significativamente a los métodos de velocidad de ARN y estableciendo fundamentos teóricos para la inferencia de trayectorias en sistemas bioquímicos cíclicos.
Los autores desarrollaron un marco de optimización multiobjetivo en bucle cerrado que combina modelos generativos, simulaciones moleculares y optimización bayesiana para diseñar péptidos penetrantes de células selectivos para receptores, logrando identificar candidatos con mayor afinidad por CXCR4 y menor por NRP1, lo cual fue validado experimentalmente mediante imágenes celulares.
ProNA3D es una herramienta integral que facilita el análisis y la visualización de interfaces en complejos que contienen ácidos nucleicos, apoyando tanto estructuras experimentales como predicciones computacionales para revelar tendencias de conectividad y modos de interacción funcionales.
Este estudio identifica que la vulnerabilidad de la corteza prefrontal en la enfermedad de Alzheimer asociada al síndrome de Down se debe a un estado epigenéticamente restringido de los astrocitos basales, caracterizado por una pérdida de funciones homeostáticas y una respuesta deficiente a señales inflamatorias y de estrés.