La bioinformática es el puente vital entre la biología y los datos, transformando secuencias genéticas complejas en conocimiento comprensible que impulsa la medicina moderna y la investigación. En Gist.Science, hacemos que estos avances sean accesibles para todos, eliminando las barreras del lenguaje técnico para que cualquier persona pueda seguir el ritmo de los descubrimientos más recientes.

Cada nuevo preimpreso en esta categoría proviene directamente de bioRxiv, la plataforma líder donde los científicos comparten sus hallazgos antes de la publicación formal. Nuestro equipo procesa cada uno de estos documentos para ofrecer tanto resúmenes técnicos detallados como explicaciones en lenguaje sencillo, garantizando que la información fluya sin complicaciones. A continuación, encontrará los últimos artículos publicados en bioinformática seleccionados para su lectura.

💻 bioinformatics

Atlas-scale spatially aware clustering with support for 3D and multimodal data using SpatialLeiden

Este trabajo presenta una extensión de SpatialLeiden que permite el agrupamiento espacial a escala de atlas para datos multimodales, tridimensionales y de múltiples muestras mediante la multiplexación flexible de grafos de vecinos en espacios latentes corregidos por lotes, logrando una reconstrucción estable y una integración de características que superan a herramientas especializadas en hardware estándar.

Müller-Bötticher, N., Malt, A., Kiessling, P., Eils, R., Kuppe, C., Ishaque, N.2026-03-02
💻 bioinformatics

STEQ: A statistically consistent quartet distance based species tree estimation method

El artículo presenta STEQ, un método rápido y estadísticamente consistente basado en distancias de cuartetos para estimar árboles de especies a gran escala a partir de datos multilocus, el cual ofrece una mayor velocidad de inferencia que métodos líderes como ASTRAL manteniendo una precisión competitiva.

Saha, P., Saha, A., Roddur, M. S., Sikdar, S., Anik, N. H., Reaz, R., Bayzid, M. S.2026-03-02
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Explainable AI for end-to-end pathogen target discovery and molecular design

El marco de inteligencia artificial explicable APEX integra modelos de aprendizaje profundo para descubrir dianas terapéuticas esenciales en patógenos y diseñar moléculas inhibidoras dirigidas a sus bolsillos específicos, ofreciendo una solución unificada y transparente para acelerar el desarrollo de fármacos antimicrobianos.

Polonio, A., Perez-Garcia, A., Fernandez-Ortuno, D., Jimenez-Castro, L.2026-03-02
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scDynOmics: An Optimized Transformer Model for Representation Learning from Single-Cell Multiomics

El artículo presenta scDynOmics, un modelo transformador preentrenable y escalable que integra datos multimodales de células individuales mediante mecanismos de atención eficientes y ajuste fino paramétrico para lograr un aprendizaje de representación de alta calidad, clasificación celular y la interpretación de dinámicas de desarrollo.

Yu, G., Ramnarine, T. J. S., Klughammer, J., Mages, S. W.2026-03-02
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Exploring the mechanism of Panax Notoginseng in the treatment of skin wound based on network pharmacology and experimental verification

Este estudio demuestra mediante farmacología de redes y validación experimental que el Panax notoginseng acelera la cicatrización de heridas cutáneas en ratas al modular múltiples componentes y vías de señalización, reduciendo la inflamación y optimizando la transición hacia la reparación tisular mediante la regulación de las citoquinas TNF-α, IL-6 e IL-10.

Li, Y.-b., Li, Q.-l., Liu, J., Li, J.-c., Geng, H.-m., Li, G.-k., Jin, C., Luo, J., Zhang, Z.2026-03-02
💻 bioinformatics

SpatialCompassV (SCOMV): De novo cell and gene spatial pattern classification and spatially differential gene identification

SpatialCompassV (SCOMV) es una herramienta computacional que permite la clasificación no supervisada de patrones espaciales de genes y células, así como la identificación de genes diferencialmente espaciales, mediante el análisis vectorial de sus posiciones relativas a regiones de interés en tejidos tumorales.

Nomura, R., Sakai, S. A., Kageyama, S.-I., Tsuchihara, K., Yamashita, R.2026-02-28
💻 bioinformatics

Nanopore sequencing reaches amplicon sequence variant (ASV) resolution

Este estudio demuestra que, gracias a las mejoras recientes en la precisión de Oxford Nanopore Technologies, ahora es posible generar variantes de secuencia de amplicón (ASV) directamente a partir de lecturas crudas para perfiles microbianos complejos, superando la dependencia de bases de datos de referencia y permitiendo la resolución de variantes intragenómicas en rangos de longitud de 250 a 4200 pb.

Riisgaard-Jensen, M., Villanelo, S. A. R., Andersen, K. S., Kirkegaard, R., Hansen, S. H., Jiang, C., Stefansen, A. V. (…)2026-02-28