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412 artículos

La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.

En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.

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Shear Strain Stiffening in Cartilage is Governed by a Mechanical Phase Transition

Este estudio demuestra que el comportamiento de endurecimiento por deformación cortante en el cartílago articular está gobernado por una transición de fase mecánica de modos dominados por flexión a modos dominados por estiramiento dentro de su red de colágeno, un proceso modulado por la concentración local de colágeno y la compresión volumétrica que dicta la deformación crítica en la cual ocurre el endurecimiento.

Omonira, J., Clugston, J. D., Barth, A. R., Thornton, S. J., Chakraborty, B., Sethna, J. P., Das, M., Bonassar, L. J., C (…)2026-10-03
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Interplay of mechanics, growth and viral infection dynamics in a spatially expanding bacterial colony

Este estudio revela cómo las fuerzas mecánicas, el crecimiento bacteriano y la dinámica de la infección viral interactúan durante la expansión espacial de una colonia de *E. coli* para impulsar el "surf de fagos" anisotrópico y determinar diversos resultados eco-evolutivos, que van desde la coexistencia hasta la resistencia de toda la población.

Stephenson, G., Nadig, A. S., Parmar, T., Krishnamurthy, V., Mitarai, N., Krishna, S., Thutupalli, S.2026-10-03
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3D confinement reshapes RNA folding and enhances circularisation in the Zika virus

Al integrar datos de ligación de proximidad con simulaciones de dinámica molecular de grano grueso, este estudio demuestra que el confinamiento espacial dentro de los viriones del virus del Zika altera las leyes de escala del plegamiento del ARN y promueve la circularización del genoma mediante la formación de tallos de doble cadena largos que inducen un orden de cristal líquido nemático local.

Novev, J. K., Lau, J. Y., Marenduzzo, D., Kudla, G.2026-10-01
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De novo design of flexible protein interactions with GuideFlip

GuideFlip es un método novedoso que co-diseña secuencias y estructuras de proteínas mediante el ajuste de flujo discreto guiado, permitiendo el diseño de novo exitoso de ligandos para dianas flexibles como proteínas intrínsecamente desordenadas y receptores conformacionalmente específicos, validado por altas tasas de acierto experimentales y confirmación estructural.

Yi, K., Chen, Q., Zhang, D., Tian, P., Wagstaff, J. L., McLaughlin, S. H., Tate, C. G., Jamali, K., Scheres, S. H. W.2026-09-30
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cryoWEight: Conformational ensembles from cryo-EM particle images with weighted ensemble simulations

El artículo presenta cryoWEight, un marco de trabajo de Python automatizado que integra imágenes de partículas de criomicroscopía electrónica (cryo-EM) con simulaciones de conjunto ponderado para generar conjuntos conformacionales precisos mediante el reponderado de trayectorias en el espacio de la imagen, superando así las limitaciones de los métodos existentes que dependen de la superposición conformacional previa o de potenciales de sesgo artificiales.

Ojha, A. A., Prabhakar, P. R., Andricioaei, I., Hanson, S. M.2026-09-30
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Fibers and Glasses are Competing Material States in FUS Protein Condensation

Utilizando el modelo de la proteína FUS, este estudio revela que el crecimiento de las fibras y la maduración del condensado hacia un estado vítreo son dos vías competidoras y no interconvertibles que ocurren simultáneamente en la fase diluida y en la fase densa, respectivamente, en lugar de que las fibras emerjan desde el interior de los condensados en envejecimiento.

Feng, L., Muntz, I., Takaki, R., Ndamba, L., Ruer-Gruss, M., Julicher, F., Jawerth, L.2026-09-28
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How many crystal structures do you need to trust your docking results?

El análisis de 403 estructuras cristalinas de la proteasa principal del SARS-CoV-2 del proyecto COVID Moonshot revela que la precisión de la predicción de poses basada en la estructura se estanca tras la recolección de aproximadamente cinco estructuras por andamio genérico, ofreciendo una pauta práctica para optimizar la asignación de recursos en campañas de descubrimiento de fármacos.

Payne, A. M., Kaminow, B., MacDermott-Opeskin, H., Pulido, I., Scheen, J., Castellanos, M. A., Fearon, D., Chodera, J. D (…)2026-09-26
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Structural basis of stepwise G protein activation by the viral chemokine receptor US28

Al utilizar la criomicroscopía electrónica y un superagonista diseñado para resolver tres estados estructurales distintos del complejo del receptor de quimiocinas viral US28-Gq, este estudio elucida un mecanismo paso a paso y conservado para la activación de la proteína G que cierra la brecha entre el reconocimiento de la proteína G y la liberación de GDP.

Jude, K. M., Suomivuori, C.-M., Waghray, D., Maeda, S., Fujiyoshi, Y., Inoue, A., Garcia, K. C., Tsutsumi, N.2026-09-25
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PolyA/polyQ-mediated conformational rewiring regulates DNA engagement and drives aggregation in the neuronal transcription factor Ascl1

Este estudio revela que el tracto polyA/polyQ en el factor de transcripción neuronal Ascl1 funciona como un módulo regulador que promueve la interacción inespecífica con el ADN e impulsa la agregación mediante la modulación del conjunto conformacional de la proteína, equilibrando así la actividad transcripcional frente a los costes de solubilidad.

Mitra, S., Ruidiaz, S. F., Laufeyjardottir, A., Voutsinos, V., Nitsenko, K., Guala, A., Zaret, K. S., Hartmann-Petersen (…)2026-09-25