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La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.
En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.
Este estudio presenta dos estructuras moleculares de biohíbridos activos de Fotosistema I con nanopartículas de platino que, mediante análisis estructural y simulaciones, revelan principios de diseño clave para optimizar la interfaz proteína-nanomaterial y mejorar la eficiencia en la conversión de energía solar a combustible.
Este estudio demuestra que los elementos palindrómicos extragenicos repetitivos (REP) en *Escherichia coli* actúan como reguladores duales y dependientes del contexto en los extremos 3' de los ARNm, funcionando simultáneamente como terminadores de transcripción y estabilizadores de ARN, lo que reconcilia observaciones previas conflictivas y revela su papel en la diversidad regulatoria entre cepas bacterianas.
Mediante criomicroscopía electrónica tridimensional, este estudio revela que la hemaglutina del virus de la influenza forma redes dinámicas de oligómeros en la superficie viral que coordinan la fusión de membranas mediante interacciones laterales específicas, las cuales son esenciales para la entrada viral.
El marco de aprendizaje automático MORPHIS cuantifica de manera interpretable y robusta las respuestas morfológicas heterogéneas de células individuales ante tratamientos farmacológicos y el envejecimiento, extrayendo firmas de características explicativas que capturan tanto la magnitud de la perturbación como la variabilidad celular.
Este estudio revela que el canal mecanosensible de mini conductancia (MscM) de *Escherichia coli* emplea un mecanismo de apertura novedoso en el que su dominio citoplasmático, y no el dominio transmembrana, media la apertura de las fenestraciones laterales mediante cambios conformacionales acoplados a la detección de tensión en la membrana.
Este estudio identifica que la carga negativa y las secuencias polares neutras aumentan el peso molecular aparente de las proteínas intrínsecamente desordenadas en SDS-PAGE, mientras que la carga positiva y los residuos hidrofóbicos lo disminuyen, revelando que estos efectos no son aditivos y se explican mediante un modelo de micelas decoradas con proteínas.
El artículo presenta CGRig, un modelo de cuerpo rígido que incorpora sitios de interacción a nivel de residuo para simular de manera eficiente y precisa el ensamblaje de proteínas a gran escala y en largos periodos de tiempo, superando las limitaciones de los modelos de esferas únicas y reduciendo los costos computacionales de las simulaciones de dinámica molecular.
Este estudio identifica a SNOR, un nuevo factor ribosómico conservado en hongos que reprime la síntesis de proteínas durante la dormancia inducida por la falta de glucosa y es esencial para reactivar la traducción al restaurar los nutrientes.
Este estudio revela que el hacinamiento macromolecular permite que el ATP forme condensados líquidos sin proteínas mediante interacciones homotípicas, actuando como un arquitecto estructural y regulatorio dinámico capaz de crear microentornos protectores y sensibles a estímulos.
Mediante el uso de una tubería de análisis ciega al investigador sobre datos de dinámica molecular, este estudio identifica microinterruptores conocidos y descubre nuevos motivos estructurales, como un quiebre en la hélice transmembrana 2 y un movimiento tipo pistón acoplado entre las hélices TM2 y TM3, que controlan la función de los receptores acoplados a proteínas G.