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La biofísica es el puente fascinante donde las leyes de la física se encuentran con la complejidad de la vida. En este campo, los investigadores utilizan herramientas y conceptos físicos para descifrar cómo funcionan las máquinas moleculares dentro de nuestras células, desde el plegamiento de proteínas hasta la transmisión de señales nerviosas. Es una disciplina que transforma preguntas biológicas profundas en problemas cuantificables, revelando los mecanismos ocultos que sostienen la vida.

En Gist.Science, monitoreamos constantemente bioRxiv para traerles las últimas novedades de este universo científico. Procesamos cada nuevo preprint en esta categoría, ofreciendo tanto un resumen técnico detallado como una explicación en lenguaje sencillo, asegurando que los hallazgos estén al alcance de todos. A continuación, presentamos los últimos artículos publicados en bioRxiv sobre biofísica.

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Binding Paths: Describing Small Molecule Interactions with Disordered Proteins via a Markov State Model

Este artículo presenta un marco basado en Modelos de Estados de Markov que caracteriza las interacciones de pequeñas moléculas con proteínas desordenadas a través de "rutas de unión" dinámicas en lugar de bolsillos estáticos, racionalizando así los mecanismos de reconocimiento e identificando regiones farmacológicas para facilitar el descubrimiento de fármacos para dianas previamente intratables.

Louet, A. A. B., Hummer, G., Vendruscolo, M.2026-02-09
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Early-Enrichment Hit Discovery via Reversible-Work c(t) Estimation in Metadynamics (CTMD)

Este artículo presenta CTMD, un protocolo de metadinámica rápido, basado en la física y de código abierto que utiliza el estimador de trabajo reversible c(t) para lograr un enriquecimiento temprano robusto en el cribado virtual, cerrando eficazmente la brecha entre los métodos aproximados de acoplamiento/IA y los cálculos de energía libre costosos, al tiempo que evita los artefactos de memorización y los sesgos de conjuntos de entrenamiento observados en los enfoques recientes de co-plegamiento por IA.

Adury, V. S. S., Tiwary, P., Gu, X., Shekhar, M.2026-02-08
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Unbend: Correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model

El artículo presenta "Unbend", una nueva función en el software cisTEM que utiliza un modelo de spline cúbico 3D para corregir el movimiento localizado de la muestra inducido por el haz en imágenes de criomicroscopía electrónica (cryo-EM), mejorando significamente las tasas de detección de partículas y las relaciones señal-ruido en diversos tipos de especímenes mientras introduce una distorsión adicional mínima.

Kong, L., Zottig, X., Elferich, J., Grigorieff, N.2026-02-07
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Structural basis for hydrolytic splicing of a circularly permuted group II intron

Este estudio presenta datos bioquímicos y estructuras de criomicroscopía electrónica (cryo-EM) de alta resolución de un intrón de grupo II circularmente permutado de *Comamonas testosteroni* para elucidar el cambio mecanístico de las vías de ramificación a la de corte hidrolítico, revelando reordenamientos en el sitio activo que permiten la producción de ARN circular y ofreciendo nuevas estrategias para la ingeniería terapéutica.

Ling, X., Jinbiao, M., Chen, Z.2026-02-07
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Active Site Local Environment Allows Acidic and Basic Synergy in Enzymatic Ester Hydrolysis by PETase

Este artículo revela que la enzima PETasa logra una catálisis ácida y básica sinérgica para la hidrólisis de ésteres a través del entorno local de su sitio activo, el cual utiliza un transporte de protones para la generación de nucleófilos y puentes de hidrógeno para la estabilización del estado de transición, sugiriendo así estrategias específicas de ingeniería de proteínas para mejorar su reactividad de degradación de plásticos.

Fan, J., Ha, Y.2026-02-05
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Droplet on Demand Tape Drive and XES Prototypes for Time-Resolved Serial Crystallography at VMXi, Diamond Light Source

Este artículo presenta experimentos de prototipo en la línea de luz VMXi de Diamond Light Source que demuestran la viabilidad de combinar la entrega de muestras mediante un sistema de arrastre de cinta de gotas bajo demanda con la espectroscopia de emisión de rayos X (XES) para la cristalografía serial con resolución temporal en un sincrotrón de tercera generación, una metodología previamente restringida a los XFEL.

Aller, P., Sanchez-Weatherby, J., Telfer, A., Bosman, R., Devenish, N. E., Hinchliffe, P., Horrell, S., Ip, J., Littlewo (…)2026-02-04
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Going around phase defects: reliable phase mapping for realistic data

Este artículo introduce un método de "mapeo de fase extendido" mejorado que detecta y contabiliza explícitamente los defectos de fase causados por bloques de conducción o límites anatómicos, eliminando así las falsas detecciones y proporcionando una caracterización más fiable y fisiológicamente consistente de los conductores rotacionales en arritmias cardíacas a través de conjuntos de datos simulados, experimentales y clínicos.

Verstraeten, B., Lootens, S., Van Den Abeele, R., Van Nieuwenhuize, V., Okenov, A., Hendrickx, S., Santos bezzera, A., N (…)2026-02-04
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The monomeric conformational ensembles of Aβ40 and Aβ42 encode their differential amyloid aggregation propensity

A través de simulaciones extensas y análisis avanzados, este estudio demuestra que la propensión de agregación distintiva de Aβ42 en comparación con Aβ40 está codificada a nivel de monómero por la mayor propensión a la estructura β de Aβ42, conformaciones más extendidas y una mayor exposición hidrofóbica, particularmente en la región C-terminal.

Cadenelli, I., Ciccolo, A., Tagliabue, A., Rossi, G., Conti Nibali, V., Bochicchio, D.2026-02-02
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Lipid droplet isolation as a novel platform for spectroscopic investigation of cargo modifications

Este estudio utiliza la espectroscopia Raman sin marcaje de gotas lipídicas aisladas para revelar una remodelación metabólica y una heterogeneidad lipídica distintas y específicas del tratamiento en células de Schwann normales frente a células de MPNST malignas tras el tratamiento con cannabidiol, radiación ionizante y su combinación, estableciendo así una plataforma novedosa para investigar los mecanismos de radiosensibilización mediados por lípidos.

Chrabaszcz, K., Panek, A., Pogoda, K.2026-02-02