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Establishing Lethal and Growth Reduction Doses of Fast Neutron Irradiated Cowpea [Vigna Unguiculata (L.) Walp.]

Este estudio determinó las dosis de la dosis letal media (DL₅₀) y de reducción del crecimiento (RC₅₀) de la irradiación por neutrones rápidos para dos variedades de caupe, revelando que SAMPEA 21 es más radiosensible que SAMPEA 20T y proporcionando parámetros de referencia genotipo-específicos esenciales para optimizar los protocolos de fitomejoramiento por mutación.

Ibrahim Ashiru, Umar U. Uwais, Ibrahim Halima, Almustapha Zakari, Abdullahi A. Dabo, Aminu Isyaku2026-07-24
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Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

Este estudio empírico demuestra que los embeddings de genes preentrenados del modelo scGPT codifican inherentemente estructuras físicas de interacción proteína-proteína, como lo evidencia una similitud de coseno significativamente mayor entre pares de genes que interactúan en comparación con controles no interactuantes emparejados a través de múltiples bases de datos.

Liu Chen2026-07-24
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Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

Este artículo demuestra empíricamente que el espacio de incrustación estática de genes y tokens del modelo fundacional scGPT codifica información detectable, aunque moderada, sobre interacciones proteína-proteína conocidas, como lo evidencia la similitud de coseno y las métricas de predicción de interacción significativamente más altas para pares de genes que interactúan en comparación con los controles que no interactúan.

Liu Chen2026-07-24
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What Knowledge Can Be Extracted from Single-Cell Data? An Empirical Analysis of Donor-Robust Cell-Type Annotation

Un análisis empírico de datos de secuenciación de ARN de célula única del páncreas humano demuestra que, para tipos celulares canónicos y abundantes, los modelos de anotación de tipos celulares se generalizan de manera robusta entre donantes con solo caídas de rendimiento modestas cuando se evalúan mediante la exclusión de un donante (leave-one-donor-out) en comparación con la división aleatoria, lo que subraya la necesidad de declarar explícitamente el alcance poblacional y técnico al reivindicar conocimiento extraído de datos de célula única.

Liu Chen2026-07-24
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When Do Single-Cell Foundation Models Beat PCA? A Simulation-Based Empirical Analysis of Label Scarcity and Perturbation Generalization

Este estudio basado en simulaciones demuestra que los modelos fundacionales de célula única superan significativamente a los procesos clásicos de PCA en tareas de anotación con escasez de etiquetas (1–5 células etiquetadas por clase), pero ofrecen poca o ninguna ventaja sobre las líneas base lineales simples cuando hay suficientes etiquetas disponibles o al predecir respuestas a perturbaciones novedosas.

Liu Chen2026-07-24
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Rank or Value? An Empirical Analysis of Single-Cell Transformer Tokenization under Sequencing-Depth Loss

Este estudio empírico demuestra que, en la secuenciación de ARN de célula única, el agrupamiento por valores de expresión fijos supera a la codificación por rango de la mediana del corpus para la clasificación de células bajo pérdida de profundidad de secuenciación, revelando que la invarianza a la multiplicación del tamaño de la biblioteca no garantiza la robustez ante la pérdida estocástica de moléculas.

Liu Chen2026-07-24
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Does Candidate-Space Restriction Destabilize Cross-Tissue Gene Regulatory Network Benchmark Rankings? An Empirical Analysis of Analytic Flexibility in Computational Biology

Este análisis empírico demuestra que restringir los espacios de candidatos en las evaluaciones de redes de regulación génica desestabiliza significativamente las clasificaciones de métodos entre tejidos, lo que indica que las elecciones en la definición de candidatos pueden alterar las conclusiones comparativas y deben reportarse junto con los resultados en lugar de tratarse como neutrales.

Liu Chen2026-07-24
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Bacteria getting wired: The porin-cytochrome complex Om(abc)B kickstarts extracellular electron transfer and nanowire formation

Este estudio revela que *Geobacter sulfurreducens* utiliza una estrategia de transferencia de electrones extracelulares secuencial de dos etapas donde el complejo porina-citocromo Om(abc)B permite primero la síntesis de alto gasto energético de los nanofibras de OmcS, permitiendo que las células cambien de un modo inalámbrico a uno cableado que expande drásticamente su acceso al Fe(III) para la replicación.

Nikhil Malvankar, Joseph Erwin, Kejue Jia, Cong Shen, Vanessa Saldivar, Aldo Salazar Morales, Vasilije Pentalic, Fadel S (…)2026-07-24
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Efficiency of timber harvesting with a harvester in fir stands with designated and undesignated thinning

Este estudio encontró que mientras la cosecha de rodales de abetos con raleo no designado toma aproximadamente un 12% más de tiempo que con raleo designado debido al movimiento extendido de la maquinaria y la planificación de los cortes, la carga de trabajo mental y los niveles de concentración del operador se mantienen comparables en ambos escenarios.

Grzegorz Szewczyk, Paweł Tylek, Rafał Dyjach, Damian Najman, Tomasz Repak2026-07-24
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WITHDRAWN: Milk Quality and Associated Safety Risk Factors along the Fresh Milk Value Chain in Pastoral Communities of Yabello Town, Borana Zone, Southern Ethiopia

Este artículo, que originalmente investigó la calidad de la leche y los riesgos para la seguridad en las comunidades pastoriles de la ciudad de Yabello, Etiopía, ha sido retirado por los autores para cumplir con las políticas de preimpresión institucionales y no debe ser citado.

Hailu Lemma, Tadicha Bute, Lechisa Asefa, Israel Melaku, Assefa Asnakew, Girma Berhanu, Degefa Dhengesu, Habtamu Roba2026-07-24