🧬 biology

Provenance-aware observations of mitochondrial organization

Este artículo introduce "armosis", un marco cuantitativo que mide la reducción progresiva de las entidades biológicas teóricamente posibles a través de los niveles organizacionales, y demuestra su aplicación utilizando un grafo de conocimiento consciente de la procedencia de genomas mitocondriales humanos para revelar el aumento de las restricciones desde los codones hasta la cadena de transporte de electrones completa.

David A Stumpf2026-07-29
🧬 biology

ResNet50 Features for Colon Histopathology: What Transfer Learning Actually Delivers

Este artículo evalúa la eficacia de las características de ResNet50 congeladas para la histopatología de colon, encontrando que, si bien el aprendizaje por transferencia produce una precisión de detección casi perfecta y una agrupación biológicamente plausible, no elimina la necesidad crítica de la normalización de la tinción, la validación externa y la explicabilidad para abordar la posible fuga de datos y el sesgo.

Samjhana Shakya2026-07-29
🧬 biology

Epigenetic Age Estimates in Blood Shift by Decades with Cell Population: A Within-Donor Variance Partition Across Two Platforms and Two Study Designs

Este estudio demuestra que las estimaciones de la edad epigenética en la sangre varían por décadas dependiendo de la población celular específica analizada, una variación lo suficientemente grande como para dominar las señales biológicas y confundir las comparaciones entre estudios, estableciendo así la composición celular como una variable metodológica crítica que requiere un reporte estandarizado.

Frederic Scheer2026-07-29
🧬 biology

AI Driven Analysis of Canola Rhizosphere Microbiome: Diversity, Core Microbiome, and Machine Learning Classification

Este estudio analiza el microbioma de la rizosfera de la canola mediante la secuenciación del ARNr 16S de 8.701 muestras para caracterizar la diversidad e identificar un microbioma central, desarrollando finalmente un clasificador de Bosque Aleatorio altamente preciso basado en características de ASV para predecir el estado de salud de la planta.

Zariab Ahmed, Amina Shoukat Amina Shoukat, Saqib Hussain Hadri, Abdullah Tariq Abdullah Tariq2026-07-29
🧬 biology

Reorganization of lateral orbitofrontal neuronal ensembles underlies pain-related impairment of delayed gratification

Este estudio demuestra que el dolor inflamatorio crónico deteriora la gratificación retardada en ratas mediante la reorganización de los conjuntos funcionales de las neuronas de la corteza orbitofrontal lateral, en lugar de simplemente reducir su actividad general, perturbando así la codificación poblacional de las asociaciones tiempo-recompensa.

Mariana Cerqueira-Nunes, Clara Monteiro, Vasco Galhardo, Helder Cardoso-Cruz2026-07-29
🧬 biology

Identification and analysis of immune-related risk genes associated with sepsis through RNA sequencing and single-cell localization techniques

Este estudio identifica y valida a S100A8, S100A9 y S100A12 como genes de riesgo relacionados con la inmunidad significativamente sobreexpresados en pacientes con sepsis, demostrando su expresión predominante en macrófagos y su posible participación en la vía de señalización PI3K-Akt mediante la integración de secuenciación de ARN, bioinformática, metaanálisis y verificación experimental.

Hongying Cao, Wei Chen, Peng Tang, Yingchun Hu, Youyu Lan2026-07-29
🧬 biology

Quantum Valence Constants and Structural Stability in DNA: The 10-5-6-5 Numerical Isomorphism as a Biological Ledger

Este artículo propone un marco teórico llamado "Biotología Cuantitativa" que afirma que una secuencia numérica específica (10-5-6-5), derivada de las constantes de enlace de valencia y del análisis de orbitales cuánticos, representa una constante matemática divina esencial para la estabilidad termodinámica y la integridad estructural del ADN.

Carlos Alberto Zuniga Gonzalez2026-07-29
🧬 biology

Phylogenomic and multi-omics analysis of Agarivorans sp. D1326 uncovers an agarolytic pathway involving rare GH118 β‑agarase

Este estudio caracteriza a la bacteria marina *Agarivorans* sp. D1326 mediante análisis filogenómicos y multiómicos para dilucidar una red agarolítica integral impulsada por una rara β-agarasa GH118 y vías enzimáticas extracelulares e intracelulares coordinadas para una degradación eficiente del agar.

Tao Li, Cong Liu, Chengwei Wu, Boyu Zhang, Ziwei Wang, Yueyue Zhao, Wenbin Gu, Zilin Liu, Fanling Meng, Jingjing Shanggu (…)2026-07-29
🧬 biology

Bloominess defines an ecological axis of sporadic dominance that shapes antimicrobial resistance dynamics in the microbiome

Este estudio introduce la "bloominess", una nueva métrica que cuantifica la dominancia esporádica en los microbiomas, para demostrar que el comportamiento ecológico de los taxones —específicamente su tendencia a la expansión extrema ocasional— es un factor crítico en la configuración de la dinámica de la resistencia antimicrobiana más allá del mero contenido de genes.

Melanie Hay, Bhoomika Joshi, Khushbu Rana, Ankit Hinsu, Rameshchandra Pandit, Kelyn Seow, Androniki Psifidi, Richard Sta (…)2026-07-28