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🧬 biology

Asymmetric responses of microbial community structure mediated by root exudates under grazing

Este estudio revela que el pastoreo altera los perfiles de exudados radiculares de *Stipa grandis* para impulsar respuestas microbianas asimétricas, donde el pastoreo a corto plazo promueve el crecimiento bacteriano mediante lípidos ricos en energía mientras que el pastoreo a largo plazo sostiene las asociaciones fúngicas a través de metabolitos defensivos, con posiciones de redes de metabolitos constreñidas por propiedades termodinámicas en bacterias pero por la complejidad estructural molecular en hongos.

wei wen2026-08-06
🧬 biology

The Conservation-Tolerance Paradox: Solvent Exposure and Conformational Flexibility Predict False-Positive Deleteriousness Signals Across Ten Deep Mutational Scanning Datasets

Este estudio revela que la conservación evolutiva genera frecuentemente predicciones de deleteriedad de falsos positivos para las mutaciones de sentido erróneo, un modo de fallo que es predicho de manera fuerte e independiente por la alta accesibilidad al solvente y la flexibilidad conformacional a través de diez conjuntos de datos de escaneo de mutaciones profundas.

Amir Mahdi Mahboubi2026-08-06
🧬 biology

Targeting cancer-intrinsic protein neddylation bypasses the loss of JAK/STAT signaling and overcomes acquired resistance to immunotherapy

Este estudio demuestra que el direccionamiento de la nedilación de proteínas intrínsecas del cáncer supera la resistencia adquirida a la inmunoterapia en tumores con deficiencia de JAK/STAT, al estabilizar la proteína cGAS unida a la cromatina, restaurando así la señalización inflamatoria y potenciando la infiltración de células inmunitarias para sensibilizar los tumores al bloqueo de PD1.

Yumeng Mao, Marta Rubies Bedos, Yonglin Lu, Eirini Voutsinou, Irineos Papakyriacou, Liam Alford, Rebeca Parracho, Vaishn (…)2026-08-06
🧬 biology

Structural variants contribute substantially to complex trait heritability

Este estudio presenta la herramienta MiXeR-SV para demostrar que las variantes estructurales, a pesar de comprender una pequeña fracción de las variantes genómicas, contribuyen significativamente a la heredabilidad de numerosos rasgos complejos —particularmente en fenotipos hematológicos, metabólicos y de cáncer— ayudando así a resolver la brecha entre las estimaciones de heredabilidad basadas en SNP y las de gemelos.

Dat Thanh Nguyen, Alexey A. Shadrin, Nadine Parker, Julian Fuhrer, Nam S. Vo, Anders M. Dale, Ole A. Andreassen, Oleksan (…)2026-08-06
🧬 biology

RECIPE bridges transcriptomics and proteomics with deep graph learning on Ribo-seq data

El artículo presenta RECIPE, un marco de red neuronal de grafos que aprovecha los datos de Ribo-seq o transcriptómicos integrados con redes de interacción proteína-proteína para predecir con precisión las abundancias de proteínas en todo el proteoma, superando eficazmente las limitaciones de las mediciones proteómicas incompletas tanto en entornos de volumen como de célula única.

Jun Ding, Luying Su, Bowen Zhao, Kailu Song, Dingfeng Zou, Jingtao Wang, Ziyang Wang, Wei Liu, Xiuhui Yang, Qinghui Duan (…)2026-08-06
🧬 biology

Microbiome-to-Nigrostriatal Vulnerability Mapping Prioritizes SCFA-Linked Gut-Brain Axes in Parkinson’s Disease

El estudio introduce el marco MiNi-PD para priorizar los ejes intestino-cerebro en la enfermedad de Parkinson, revelando que los metabolitos vinculados a los ácidos grasos de cadena corta, particularmente el butirato y el ácido 3-indolpropiónico, convergen en el gen del huésped IL1B dentro de la sustancia negra para definir un mecanismo inflamatorio biológicamente significativo.

Nabanita Ghosh2026-08-06
🧬 biology

Proton-coupled alternating access in a versatile mycobacterial Spns drug transporter

Este estudio elucida la versatilidad mecánica del transportador MsSpns de la micobacteria al demostrar cómo los cambios conformacionales impulsados por la protonación y las interacciones distintivas con el sustrato permiten que el pliegue Spns accione modos de transporte opuestos, facilitando tanto la eflujo de cationes hidrofílicos como la captación de compuestos lipofílicos.

Reza Dastvan, Samantha Gies, Kevin Jagessar, Tianqi Wu, Ian Miller, Khadijeh Dastvan2026-08-06
🧬 biology

Genome-scale molecular profiling from routine histopathology with a multimodal pathology foundation model

El artículo presenta Fuji, un modelo fundacional de patología multimodal entrenado con más de 60.000 imágenes de portaobjetos completos emparejadas con datos genómicos que infiere con éxito estados moleculares a escala genómica, procesos mutacionales y resultados clínicos directamente a partir de la histología de rutina, cerrando así la brecha entre la morfología tisular y los mecanismos moleculares subyacentes.

Guangyu Wang, Qing Li, Jian Sang, Yiwei Xiao, Pengzhi Zhang, Weiqing Chen, Tu Tran, Zejuan Li, Shengyu Li, Tongwu Zhang2026-08-06
🧬 biology

Cardiolipin remodeling reflects mitochondrial reprogramming in clear cell renal cell carcinoma

Este estudio revela que el carcinoma de células renales de tipo células claras se caracteriza por una reducción significativa y una remodelación oxidativa de la cardiolipina, lo que refleja un agotamiento mitocondrial y una regulación al alza compensatoria insuficiente de la enzima de remodelación TAZ, lo cual destaca colectivamente una potencial vulnerabilidad metabólica en la enfermedad.

Rento Ito, Renpei Kato, Ikarashi Daiki, Shigekatsu Maekawa, Mitsugu Kanehira, Yosuke Matsushita, Yosui Nojima, Kenji Miz (…)2026-08-06
🧬 biology

MIDLPred: Ensemble Learning for Phenotype-Oriented Classification of Male Infertility Candidate Proteins from Primary Amino Acid Sequences

Este estudio presenta MIDLPred, un marco de aprendizaje de conjunto que utiliza una red neuronal convolucional unidimensional para clasificar con precisión las proteínas candidatas de la infertilidad masculina en cuatro categorías fenotípicas distintas directamente desde sus secuencias primarias de aminoácidos, ayudando así a los investigadores a priorizar objetivos para investigaciones posteriores.

Abdelhafedh BEN DAHMANE, Mustapha BENSAADA, Hamza CHEHILI, Salah eddine ALIOUANE, Mohamed Abdelhafid HAMIDECHI2026-08-05